MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 1906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	AAAAG	2	10	1825	1834	80 %	0 %	20 %	0 %	333909897
2	NC_015562	AAGAG	2	10	4963	4972	60 %	0 %	40 %	0 %	333909900
3	NC_015562	ATTGA	2	10	5219	5228	40 %	40 %	20 %	0 %	333909900
4	NC_015562	TGATA	2	10	6609	6618	40 %	40 %	20 %	0 %	333909902
5	NC_015562	GAAAA	2	10	6710	6719	80 %	0 %	20 %	0 %	333909902
6	NC_015562	AAACA	2	10	7539	7548	80 %	0 %	0 %	20 %	333909903
7	NC_015562	TTCCT	2	10	7969	7978	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015562	AAACT	2	10	8396	8405	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015562	AGCGA	2	10	9078	9087	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015562	GCATT	2	10	9496	9505	20 %	40 %	20 %	20 %	333909904
11	NC_015562	TACAT	2	10	12700	12709	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015562	TTTTG	2	10	13015	13024	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015562	TTCTT	2	10	14599	14608	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015562	ATTTG	2	10	14777	14786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015562	CCATC	2	10	15369	15378	20 %	20 %	0 %	60 %	333909909
16	NC_015562	AATAA	2	10	17406	17415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015562	TTTAT	2	10	17540	17549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015562	AAATA	2	10	17609	17618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015562	GGCAG	2	10	18536	18545	20 %	0 %	60 %	20 %	333909911
20	NC_015562	GAGTT	2	10	18613	18622	20 %	40 %	40 %	0 %	333909911
21	NC_015562	AAGGA	2	10	18756	18765	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
22	NC_015562	GGAAA	2	10	19513	19522	60 %	0 %	40 %	0 %	333909911
23	NC_015562	AAATC	2	10	19698	19707	60 %	20 %	0 %	20 %	333909912
24	NC_015562	TTTAG	2	10	20975	20984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015562	GCTTC	2	10	21054	21063	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015562	TCTTT	2	10	21782	21791	0 %	80 %	0 %	20 %	333909914
27	NC_015562	TCAAC	2	10	22795	22804	40 %	20 %	0 %	40 %	333909915
28	NC_015562	TTTTC	2	10	23047	23056	0 %	80 %	0 %	20 %	333909915
29	NC_015562	AAATT	2	10	24289	24298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015562	AGCGA	2	10	24364	24373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015562	TAATA	2	10	26133	26142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015562	CAAAA	2	10	26235	26244	80 %	0 %	0 %	20 %	333909918
33	NC_015562	TCCAA	2	10	27697	27706	40 %	20 %	0 %	40 %	333909918
34	NC_015562	ATATT	2	10	28748	28757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015562	CTTTT	2	10	30032	30041	0 %	80 %	0 %	20 %	333909920
36	NC_015562	TTAAA	2	10	31637	31646	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015562	TTTTC	2	10	31871	31880	0 %	80 %	0 %	20 %	333909921
38	NC_015562	AGAAT	2	10	32885	32894	60 %	20 %	20 %	0 %	333909922
39	NC_015562	TTTTG	2	10	33796	33805	0 %	80 %	20 %	0 %	333909923
40	NC_015562	AAGAA	2	10	34781	34790	80 %	0 %	20 %	0 %	333909923
41	NC_015562	AAAAT	2	10	35257	35266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015562	AAGAA	2	10	35826	35835	80 %	0 %	20 %	0 %	333909924
43	NC_015562	TCCAA	2	10	36153	36162	40 %	20 %	0 %	40 %	333909924
44	NC_015562	AATAA	3	15	37615	37629	80 %	20 %	0 %	0 %	333909926
45	NC_015562	AAATA	2	10	37806	37815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015562	TCATC	2	10	39746	39755	20 %	40 %	0 %	40 %	333909928
47	NC_015562	AATTT	2	10	40240	40249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015562	ATGGA	2	10	42980	42989	40 %	20 %	40 %	0 %	333909931
49	NC_015562	AAAAT	2	10	43662	43671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015562	AGATA	2	10	45895	45904	60 %	20 %	20 %	0 %	333909933
51	NC_015562	AATAA	2	10	46199	46208	80 %	20 %	0 %	0 %	333909933
52	NC_015562	TATCT	2	10	47904	47913	20 %	60 %	0 %	20 %	333909934
53	NC_015562	AAATT	2	10	48200	48209	60 %	40 %	0 %	0 %	333909934
54	NC_015562	GTTTT	2	10	48417	48426	0 %	80 %	20 %	0 %	333909934
55	NC_015562	TCTTA	2	10	48915	48924	20 %	60 %	0 %	20 %	333909934
56	NC_015562	CGAAG	2	10	49443	49452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015562	TTTAT	2	10	50629	50638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015562	TTTAA	2	10	52330	52339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015562	CTATG	2	10	53268	53277	20 %	40 %	20 %	20 %	333909937
60	NC_015562	CATTA	2	10	53784	53793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015562	TTAAT	2	10	55615	55624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015562	TCTTT	2	10	59082	59091	0 %	80 %	0 %	20 %	333909945
63	NC_015562	AATTT	2	10	62917	62926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015562	ATCCA	2	10	63908	63917	40 %	20 %	0 %	40 %	333909949
65	NC_015562	GAAAA	2	10	65329	65338	80 %	0 %	20 %	0 %	333909950
66	NC_015562	TTATT	2	10	65552	65561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015562	ATAAA	2	10	66004	66013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015562	ATAAG	2	10	67039	67048	60 %	20 %	20 %	0 %	333909953
69	NC_015562	TTTAA	2	10	68110	68119	40 %	60 %	0 %	0 %	333909954
70	NC_015562	ATTTC	2	10	68572	68581	20 %	60 %	0 %	20 %	333909954
71	NC_015562	ACATA	2	10	68588	68597	60 %	20 %	0 %	20 %	333909954
72	NC_015562	AACGC	2	10	68908	68917	40 %	0 %	20 %	40 %	333909954
73	NC_015562	CCTTC	2	10	69442	69451	0 %	40 %	0 %	60 %	333909955
74	NC_015562	CATCC	2	10	70878	70887	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_015562	AAGAG	2	10	71471	71480	60 %	0 %	40 %	0 %	333909956
76	NC_015562	AAAGG	2	10	71597	71606	60 %	0 %	40 %	0 %	333909956
77	NC_015562	GTTGA	2	10	71697	71706	20 %	40 %	40 %	0 %	333909956
78	NC_015562	GGTTT	2	10	72571	72580	0 %	60 %	40 %	0 %	333909956
79	NC_015562	ACTTT	2	10	73611	73620	20 %	60 %	0 %	20 %	333909958
80	NC_015562	AAGAA	2	10	74721	74730	80 %	0 %	20 %	0 %	333909958
81	NC_015562	AAATG	2	10	74982	74991	60 %	20 %	20 %	0 %	333909958
82	NC_015562	TGCCT	2	10	77533	77542	0 %	40 %	20 %	40 %	333909961
83	NC_015562	TCCCC	2	10	77913	77922	0 %	20 %	0 %	80 %	333909961
84	NC_015562	TAAAG	2	10	78253	78262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015562	ATTAA	2	10	78536	78545	60 %	40 %	0 %	0 %	333909962
86	NC_015562	ATTTA	2	10	78991	79000	40 %	60 %	0 %	0 %	333909962
87	NC_015562	AATAG	2	10	81952	81961	60 %	20 %	20 %	0 %	333909964
88	NC_015562	GTTAA	2	10	82276	82285	40 %	40 %	20 %	0 %	333909964
89	NC_015562	TTTTA	2	10	82707	82716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015562	AAATT	2	10	83888	83897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015562	CCCAA	2	10	84616	84625	40 %	0 %	0 %	60 %	333909966
92	NC_015562	AAAAT	2	10	84777	84786	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015562	TTAAG	2	10	84818	84827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015562	ATCAA	2	10	86882	86891	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015562	GGTTT	2	10	90715	90724	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015562	GTCTT	2	10	91888	91897	0 %	60 %	20 %	20 %	333909973
97	NC_015562	CTGGA	2	10	92482	92491	20 %	20 %	40 %	20 %	333909973
98	NC_015562	TTAGA	2	10	93463	93472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015562	ATGCA	2	10	93759	93768	40 %	20 %	20 %	20 %	333909976
100	NC_015562	CGAAG	2	10	95722	95731	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015562	TCAAA	2	10	96884	96893	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015562	AATGT	2	10	97440	97449	40 %	40 %	20 %	0 %	333909980
103	NC_015562	TTTTA	2	10	97986	97995	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015562	ATTTA	2	10	98001	98010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015562	TTTTG	2	10	99068	99077	0 %	80 %	20 %	0 %	333909982
106	NC_015562	TGAAT	2	10	99572	99581	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015562	CAACT	2	10	100584	100593	40 %	20 %	0 %	40 %	333909984
108	NC_015562	TTTTA	2	10	100734	100743	20 %	80 %	0 %	0 %	333909984
109	NC_015562	TTGCA	2	10	101766	101775	20 %	40 %	20 %	20 %	333909987
110	NC_015562	TCCAA	2	10	102233	102242	40 %	20 %	0 %	40 %	333909988
111	NC_015562	TAGAA	2	10	102380	102389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015562	CTCTT	2	10	102706	102715	0 %	60 %	0 %	40 %	333909990
113	NC_015562	TCTTG	2	10	103739	103748	0 %	60 %	20 %	20 %	333909992
114	NC_015562	TTATC	2	10	103813	103822	20 %	60 %	0 %	20 %	333909992
115	NC_015562	TGCAT	2	10	104469	104478	20 %	40 %	20 %	20 %	333909992
116	NC_015562	AAACA	2	10	104931	104940	80 %	0 %	0 %	20 %	333909992
117	NC_015562	TATTT	2	10	106276	106285	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015562	TTCAC	2	10	108454	108463	20 %	40 %	0 %	40 %	333909996
119	NC_015562	GCTTC	2	10	109288	109297	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_015562	GCTTC	2	10	109386	109395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015562	TTTCT	2	10	109467	109476	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015562	ATTTG	2	10	110803	110812	20 %	60 %	20 %	0 %	333909998
123	NC_015562	TTTAA	2	10	111367	111376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015562	TCAAA	2	10	111848	111857	60 %	20 %	0 %	20 %	333909999
125	NC_015562	TAAAA	2	10	114261	114270	80 %	20 %	0 %	0 %	333910002
126	NC_015562	ATTTA	2	10	115346	115355	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015562	CTGTT	2	10	115747	115756	0 %	60 %	20 %	20 %	333910005
128	NC_015562	CAGTA	2	10	116449	116458	40 %	20 %	20 %	20 %	333910005
129	NC_015562	AGCGA	2	10	117732	117741	40 %	0 %	40 %	20 %	333910007
130	NC_015562	AATTT	2	10	119074	119083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015562	AATTT	2	10	121543	121552	40 %	60 %	0 %	0 %	333910013
132	NC_015562	GTTTT	2	10	121636	121645	0 %	80 %	20 %	0 %	333910013
133	NC_015562	TTATT	2	10	121892	121901	20 %	80 %	0 %	0 %	333910013
134	NC_015562	TTGAT	2	10	121913	121922	20 %	60 %	20 %	0 %	333910013
135	NC_015562	TTTAA	2	10	122269	122278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015562	TTAGA	2	10	122902	122911	40 %	40 %	20 %	0 %	333910014
137	NC_015562	AATCT	2	10	124407	124416	40 %	40 %	0 %	20 %	333910016
138	NC_015562	TGTTA	2	10	125921	125930	20 %	60 %	20 %	0 %	333910016
139	NC_015562	TATTT	2	10	125961	125970	20 %	80 %	0 %	0 %	333910016
140	NC_015562	TCCTT	2	10	126330	126339	0 %	60 %	0 %	40 %	333910016
141	NC_015562	ATTTT	2	10	128415	128424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015562	AAAGA	2	10	130800	130809	80 %	0 %	20 %	0 %	333910019
143	NC_015562	TATTT	2	10	131347	131356	20 %	80 %	0 %	0 %	333910020
144	NC_015562	TATTT	2	10	131589	131598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015562	GAAGA	2	10	133102	133111	60 %	0 %	40 %	0 %	333910022
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272	NC_015562	ATTTT	2	10	261032	261041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_015562	TAAAA	2	10	261288	261297	80 %	20 %	0 %	0 %	333910147
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275	NC_015562	TGGAT	2	10	261887	261896	20 %	40 %	40 %	0 %	333910147
276	NC_015562	TTTGG	2	10	262567	262576	0 %	60 %	40 %	0 %	333910147
277	NC_015562	AGGAG	2	10	262789	262798	40 %	0 %	60 %	0 %	333910147
278	NC_015562	CATTT	2	10	263419	263428	20 %	60 %	0 %	20 %	333910147
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285	NC_015562	TGGGA	2	10	271243	271252	20 %	20 %	60 %	0 %	333910156
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289	NC_015562	ATCCA	2	10	274609	274618	40 %	20 %	0 %	40 %	333910159
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312	NC_015562	TTTTA	2	10	296672	296681	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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383	NC_015562	TTTGG	2	10	361379	361388	0 %	60 %	40 %	0 %	333910239
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393	NC_015562	ATTAA	2	10	376953	376962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_015562	GAAAA	2	10	385353	385362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
403	NC_015562	GCGAA	2	10	385503	385512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
404	NC_015562	TTATA	2	10	385672	385681	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_015562	TTGGA	2	10	388478	388487	20 %	40 %	40 %	0 %	333910261
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