MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 1218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	TTAA	2	8	10	17	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015562	TTCA	2	8	1274	1281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015562	ATTC	2	8	1354	1361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015562	ATTT	2	8	1392	1399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015562	TGTA	2	8	1438	1445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015562	GTGA	2	8	1463	1470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015562	TAAA	2	8	3019	3026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015562	TTAA	2	8	3158	3165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015562	TAAG	2	8	4850	4857	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015562	TAAA	2	8	4866	4873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015562	TTCT	2	8	5665	5672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015562	AATT	2	8	7014	7021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015562	TAAA	2	8	7951	7958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015562	AGTT	2	8	8358	8365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015562	TTTA	2	8	8500	8507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015562	CAAA	3	12	8614	8625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015562	TCTT	2	8	8735	8742	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015562	AAGA	2	8	8793	8800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015562	TTAA	2	8	9027	9034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015562	AATT	2	8	10685	10692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015562	ATAA	2	8	12730	12737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015562	TTTA	2	8	12758	12765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015562	ACTG	2	8	13087	13094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015562	TATT	2	8	13101	13108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015562	TACT	2	8	13325	13332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015562	ATTT	2	8	13631	13638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015562	GGGA	2	8	13727	13734	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015562	ATTT	2	8	14587	14594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015562	TATT	2	8	14628	14635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015562	CAAA	2	8	14749	14756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015562	ATTA	2	8	14872	14879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015562	GAAA	2	8	14881	14888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015562	AAAT	2	8	14904	14911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015562	ACAT	2	8	14919	14926	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015562	AAGA	2	8	17416	17423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015562	TTAA	2	8	17483	17490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015562	AAAT	2	8	17499	17506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015562	TTAT	2	8	17701	17708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015562	ATAA	2	8	17772	17779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015562	TAAA	2	8	17940	17947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015562	ATTT	2	8	19684	19691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015562	TTTC	2	8	20962	20969	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015562	ACAA	2	8	21516	21523	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015562	ACCA	2	8	23207	23214	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015562	GACA	2	8	28265	28272	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015562	TATC	2	8	28624	28631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015562	TATT	2	8	28686	28693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015562	TATC	2	8	29340	29347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015562	AAAT	2	8	31615	31622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015562	AAAT	2	8	31662	31669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015562	GAAA	2	8	32578	32585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015562	TAGA	2	8	33506	33513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015562	AGTA	2	8	33515	33522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015562	TTAA	2	8	35349	35356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015562	TGAA	2	8	37760	37767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015562	TAAA	2	8	37788	37795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015562	ATTT	2	8	37936	37943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015562	CTAT	2	8	40193	40200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015562	TGAA	2	8	42612	42619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015562	TAAA	2	8	43729	43736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015562	ATCC	2	8	45054	45061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015562	AAGA	2	8	46390	46397	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015562	TAAT	2	8	49403	49410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015562	TATT	2	8	51840	51847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015562	ATTA	2	8	53832	53839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015562	ATCT	2	8	55395	55402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015562	TTTA	2	8	60573	60580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015562	ACTT	2	8	60899	60906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015562	AAAT	2	8	60940	60947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015562	TCCC	2	8	62096	62103	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_015562	TAAA	2	8	62186	62193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015562	TAAA	2	8	65985	65992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015562	TTAA	2	8	66040	66047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015562	TAAG	2	8	66402	66409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015562	ACAA	2	8	66412	66419	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015562	TTAA	2	8	67872	67879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015562	ATTA	2	8	70961	70968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015562	TTTA	2	8	75199	75206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015562	ATTT	2	8	76070	76077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015562	GAAA	2	8	77115	77122	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015562	TTAT	2	8	79868	79875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015562	TCTT	2	8	81267	81274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015562	TTAT	2	8	81336	81343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015562	TTGT	2	8	83854	83861	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015562	TTTA	2	8	83867	83874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015562	AATT	2	8	83877	83884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015562	ATAA	2	8	86918	86925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015562	ATGA	2	8	88287	88294	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015562	TTTA	2	8	89538	89545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015562	AAAT	2	8	89560	89567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015562	ATCT	2	8	89574	89581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015562	TAAT	2	8	89596	89603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015562	TGAA	2	8	90675	90682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015562	TTCG	2	8	90868	90875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015562	ATTT	2	8	91262	91269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015562	AATT	2	8	92794	92801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015562	ATAA	2	8	93445	93452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015562	CTTT	2	8	95911	95918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015562	TAAA	2	8	100404	100411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015562	TAAT	2	8	100908	100915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015562	AAAG	2	8	103292	103299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015562	TAAA	2	8	106454	106461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015562	GATA	2	8	107233	107240	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015562	CTAT	2	8	107720	107727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015562	ATTA	2	8	110610	110617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015562	ACCA	2	8	113471	113478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015562	TTTA	2	8	113724	113731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015562	ATTA	2	8	114275	114282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015562	AAAT	2	8	114300	114307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015562	ATTG	2	8	114782	114789	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015562	AAAT	2	8	115430	115437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015562	ACCA	2	8	116781	116788	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015562	TAAA	2	8	117970	117977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015562	TAAA	2	8	117985	117992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015562	TTAT	2	8	118633	118640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015562	AATT	2	8	118788	118795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015562	ATTT	2	8	122110	122117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015562	TTAA	2	8	123566	123573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015562	TTTA	2	8	124229	124236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015562	TGAA	2	8	124375	124382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015562	CTTT	2	8	129893	129900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015562	AACA	2	8	131669	131676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015562	ATTT	2	8	132833	132840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015562	AATT	2	8	134810	134817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015562	ATTT	2	8	135321	135328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015562	TAAA	2	8	135441	135448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015562	ATTA	2	8	139689	139696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015562	ATTA	2	8	139912	139919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015562	AGTT	2	8	140016	140023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015562	AAAC	2	8	140098	140105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015562	AGAT	2	8	141274	141281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015562	CAAC	2	8	143398	143405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015562	ATTT	2	8	144727	144734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015562	ATTA	2	8	144814	144821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015562	TAAA	2	8	144998	145005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015562	TTAA	2	8	146011	146018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015562	ACTT	2	8	147315	147322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015562	GTTT	2	8	149039	149046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015562	TTCA	2	8	153362	153369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_015562	TATT	2	8	153394	153401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015562	AAAT	2	8	154901	154908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_015562	TTTC	2	8	155714	155721	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015562	TTAA	2	8	155759	155766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015562	ATGT	2	8	155807	155814	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015562	ATTT	2	8	155821	155828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015562	ACAG	2	8	157784	157791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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150	NC_015562	CATC	2	8	161876	161883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015562	ATAA	2	8	164730	164737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015562	TAAT	2	8	165843	165850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015562	TTTA	2	8	166058	166065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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