MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 4253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015562	ATT	2	6	204	209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015562	TAA	2	6	1228	1233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015562	ATT	2	6	1311	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015562	AAT	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015562	ATA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015562	ATT	2	6	2851	2856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015562	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015562	ATT	2	6	2893	2898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015562	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015562	GTG	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015562	AAT	2	6	5683	5688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015562	GAT	2	6	6492	6497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015562	ACT	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015562	TTA	2	6	8350	8355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015562	ACA	2	6	8416	8421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015562	TAC	2	6	8424	8429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015562	TCA	2	6	8487	8492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015562	GAA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015562	ATT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015562	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015562	AAT	2	6	8850	8855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015562	TGA	2	6	9103	9108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015562	TGA	2	6	9144	9149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015562	AAT	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015562	ATA	2	6	10785	10790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015562	ATA	2	6	10834	10839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015562	GAA	2	6	11156	11161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015562	ATA	2	6	11178	11183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015562	ATA	2	6	11195	11200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015562	AAC	2	6	11213	11218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015562	ATA	2	6	11227	11232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015562	TGG	2	6	13202	13207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015562	TAA	2	6	13314	13319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015562	TTG	2	6	13410	13415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015562	CAA	2	6	13435	13440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015562	ATT	2	6	13548	13553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015562	ATA	2	6	13571	13576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015562	GTT	2	6	13577	13582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015562	TAA	3	9	13652	13660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015562	TAT	2	6	14637	14642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015562	ATA	2	6	14680	14685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015562	ATA	2	6	14732	14737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015562	GAT	2	6	15122	15127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015562	AAT	2	6	16197	16202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015562	ATT	2	6	16242	16247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015562	TTG	2	6	17453	17458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015562	TAT	2	6	17578	17583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015562	TTA	2	6	17662	17667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015562	TAA	2	6	17815	17820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015562	TTG	2	6	19623	19628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015562	ATG	2	6	20887	20892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015562	TAA	2	6	20934	20939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015562	GCT	2	6	21044	21049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015562	AAT	2	6	21127	21132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015562	ACT	2	6	21134	21139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015562	TAA	2	6	21439	21444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015562	TAA	2	6	24162	24167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015562	ATT	2	6	24310	24315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015562	ATT	2	6	24456	24461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015562	TAA	2	6	25644	25649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015562	TAA	2	6	25677	25682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015562	AAT	2	6	25690	25695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015562	ATT	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015562	TAA	2	6	25860	25865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015562	GAA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015562	ATT	2	6	25913	25918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015562	AAT	2	6	26038	26043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015562	CCA	2	6	26063	26068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015562	TAA	2	6	26097	26102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015562	TGT	2	6	26161	26166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015562	AAG	2	6	28189	28194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015562	ATT	2	6	28242	28247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015562	ATT	2	6	28340	28345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015562	TAT	2	6	28359	28364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015562	TAT	2	6	28369	28374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015562	TTA	2	6	28422	28427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015562	TAT	2	6	28580	28585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015562	ATT	2	6	28727	28732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015562	TAA	2	6	28776	28781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015562	TAT	2	6	28790	28795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015562	GCA	2	6	28959	28964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015562	TTA	2	6	29292	29297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015562	CAC	2	6	29451	29456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015562	AAT	3	9	29566	29574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015562	ATA	2	6	33433	33438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015562	ACA	2	6	33486	33491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015562	ATA	2	6	33554	33559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015562	TAT	2	6	35237	35242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015562	CTT	2	6	35281	35286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015562	CAT	2	6	35335	35340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015562	TTG	2	6	35423	35428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015562	CAA	2	6	35453	35458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015562	TAA	2	6	36537	36542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015562	TAA	2	6	36578	36583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015562	GAA	2	6	36676	36681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015562	TGT	2	6	36705	36710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015562	TTC	2	6	36924	36929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015562	CAT	2	6	36976	36981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015562	TAA	2	6	37008	37013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015562	GTC	2	6	37105	37110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015562	GGT	2	6	37114	37119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015562	ATA	2	6	37639	37644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015562	CAT	2	6	37661	37666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015562	CTT	2	6	37838	37843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015562	TTG	2	6	37885	37890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015562	GTT	2	6	37897	37902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015562	AAG	2	6	37988	37993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015562	AAC	2	6	38001	38006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015562	GAA	2	6	40273	40278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015562	AAG	2	6	40342	40347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015562	TTA	2	6	40458	40463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015562	TAT	2	6	40500	40505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015562	CAT	2	6	42518	42523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015562	AAT	2	6	43749	43754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015562	GTT	2	6	45126	45131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015562	CAA	2	6	45153	45158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015562	TTA	2	6	45281	45286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015562	AAT	2	6	46475	46480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015562	ATT	2	6	46486	46491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015562	ATT	2	6	46591	46596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015562	TTC	2	6	49383	49388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015562	TAA	2	6	49554	49559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015562	AGC	2	6	50472	50477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015562	TAA	2	6	50502	50507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015562	TCC	2	6	50677	50682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015562	ATT	2	6	50704	50709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015562	ACC	2	6	51787	51792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_015562	ATA	2	6	51793	51798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015562	ATT	2	6	51813	51818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015562	AAT	2	6	51819	51824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015562	TTA	3	9	51827	51835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015562	AAT	2	6	51978	51983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015562	TAA	2	6	52088	52093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015562	TTA	2	6	52194	52199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015562	CAA	2	6	52321	52326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015562	ATA	2	6	52404	52409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015562	AAT	2	6	52533	52538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015562	TAT	2	6	52576	52581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015562	GAT	2	6	53736	53741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015562	TAA	2	6	53794	53799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015562	TCA	2	6	55292	55297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015562	TCG	2	6	55358	55363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_015562	ATC	2	6	55456	55461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015562	AGA	2	6	55581	55586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_015562	TTA	2	6	55670	55675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_015562	TAA	2	6	55739	55744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015562	TAA	2	6	57562	57567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015562	AAT	2	6	57605	57610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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