MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	TCCT	2	8	2991	2998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015561	CGCC	2	8	3122	3129	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3	NC_015561	GACC	2	8	3479	3486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015561	TTGA	2	8	4062	4069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015561	TGTC	2	8	6268	6275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015561	CCAG	2	8	6731	6738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015561	TAAT	2	8	7760	7767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015561	CAAT	2	8	7805	7812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015561	CATC	2	8	7953	7960	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015561	GCAG	2	8	8148	8155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015561	CAGA	2	8	10323	10330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015561	GGCG	2	8	10610	10617	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015561	GAGT	2	8	10940	10947	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015561	GAAC	2	8	13599	13606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015561	CATA	2	8	13802	13809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015561	AGCA	2	8	14009	14016	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015561	TGAC	2	8	14422	14429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015561	GCCT	2	8	21220	21227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015561	TAGC	2	8	21326	21333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015561	CGGT	2	8	21491	21498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015561	CCAG	2	8	22786	22793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015561	CCTC	2	8	24637	24644	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_015561	GTGC	2	8	24981	24988	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015561	TACG	2	8	26586	26593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015561	CGAT	2	8	28059	28066	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015561	CGTG	2	8	28348	28355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015561	AGCC	2	8	29173	29180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015561	TTCC	2	8	59366	59373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015561	CGGG	2	8	64997	65004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015561	TTCC	2	8	78997	79004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015561	GTTT	2	8	79823	79830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015561	CCTG	2	8	83028	83035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015561	GTCG	2	8	83551	83558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015561	GGGT	2	8	94902	94909	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015561	GTCT	2	8	96138	96145	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015561	GCGA	2	8	98468	98475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015561	CTGT	2	8	99460	99467	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015561	CATT	2	8	102181	102188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015561	CCGG	2	8	102549	102556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015561	GGTT	2	8	106180	106187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015561	CTTA	2	8	106243	106250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.