MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	ACA	2	6	1216	1221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015561	AAT	2	6	1269	1274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015561	TCG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015561	AGT	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015561	AGA	2	6	3184	3189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015561	GAC	2	6	3212	3217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015561	CCA	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015561	GTA	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015561	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015561	GCG	2	6	3498	3503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015561	TGG	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015561	TCT	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015561	GCT	2	6	4127	4132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015561	CAC	2	6	6279	6284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_015561	GCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015561	GGC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015561	CGG	2	6	6663	6668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015561	CCT	2	6	6716	6721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015561	CGA	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015561	GCT	3	9	6891	6899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015561	AGG	2	6	6948	6953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015561	GTG	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015561	CCG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015561	ATC	2	6	7027	7032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015561	CGA	2	6	7107	7112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015561	GAT	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015561	AGG	2	6	7313	7318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015561	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015561	TCG	2	6	7794	7799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015561	CTG	3	9	7820	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015561	TAG	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015561	ATC	2	6	8046	8051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015561	ATT	2	6	8069	8074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015561	CGG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015561	GTC	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015561	ACC	2	6	10341	10346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015561	AGA	2	6	10582	10587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015561	GAT	2	6	10601	10606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015561	GCC	2	6	10810	10815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015561	AAG	2	6	13613	13618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015561	GCT	2	6	13696	13701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015561	CAC	2	6	13875	13880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015561	CAC	2	6	13887	13892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015561	GCC	2	6	13987	13992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015561	CTG	2	6	14549	14554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015561	ACC	2	6	14587	14592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015561	CGG	2	6	14718	14723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015561	ACG	2	6	17665	17670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015561	TCC	2	6	17707	17712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015561	TGG	2	6	17738	17743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015561	GCG	2	6	17767	17772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015561	CAC	2	6	17835	17840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015561	GGT	2	6	17848	17853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015561	GAT	3	9	17854	17862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015561	GGA	2	6	17897	17902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015561	CTC	2	6	18611	18616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015561	CGC	2	6	18891	18896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_015561	GTT	2	6	18963	18968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015561	TCG	2	6	18989	18994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015561	CGC	2	6	19256	19261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_015561	CTA	2	6	20983	20988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015561	ACC	2	6	21059	21064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_015561	TAC	2	6	21102	21107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015561	TGG	2	6	21119	21124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015561	GCA	2	6	21265	21270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015561	CTG	2	6	21417	21422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015561	GGA	2	6	22759	22764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015561	ATC	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015561	CGA	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015561	GGC	2	6	23095	23100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015561	CTG	2	6	23165	23170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015561	TGC	2	6	23176	23181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015561	AAC	2	6	24850	24855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015561	CCA	2	6	24947	24952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015561	CGG	2	6	25099	25104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015561	CCG	2	6	26433	26438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015561	GGC	2	6	26492	26497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015561	TCA	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015561	CCT	2	6	26571	26576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015561	CCT	2	6	28078	28083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015561	CTC	2	6	28425	28430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_015561	GCA	2	6	28439	28444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015561	TCT	2	6	28507	28512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015561	CCG	2	6	28534	28539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015561	GGA	2	6	28814	28819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015561	TCG	2	6	28979	28984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015561	CGA	2	6	29041	29046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015561	GAG	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015561	TGT	2	6	29138	29143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015561	ACC	2	6	29255	29260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_015561	ACG	3	9	29288	29296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015561	GTC	2	6	29297	29302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015561	CCT	2	6	30718	30723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015561	TGG	2	6	30798	30803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015561	CGG	2	6	30835	30840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015561	AGC	2	6	31201	31206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015561	AGC	2	6	31211	31216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015561	AGT	2	6	31240	31245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015561	GTG	2	6	31251	31256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015561	TGT	2	6	32682	32687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015561	GGT	2	6	32691	32696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015561	CTG	2	6	32729	32734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015561	GAA	2	6	32741	32746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015561	TAA	2	6	33299	33304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015561	GCG	2	6	33358	33363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015561	GAG	2	6	33394	33399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015561	CGC	2	6	35935	35940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015561	TTC	2	6	35943	35948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015561	GCC	2	6	36039	36044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015561	GCG	2	6	36048	36053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015561	GTG	2	6	36084	36089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015561	CTG	2	6	36214	36219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015561	CGA	2	6	36935	36940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015561	TCT	2	6	37501	37506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015561	CAG	2	6	37642	37647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015561	GCT	2	6	37666	37671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015561	ACC	2	6	37706	37711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015561	GCA	3	9	37780	37788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015561	AGG	2	6	37790	37795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015561	GAG	2	6	39639	39644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015561	AGC	2	6	41006	41011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015561	CCT	2	6	41038	41043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015561	GGT	2	6	43215	43220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015561	GGT	2	6	48595	48600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015561	GCA	2	6	48601	48606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015561	CAG	2	6	54976	54981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015561	TGA	2	6	55488	55493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015561	GCA	2	6	55512	55517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015561	CCT	2	6	55778	55783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015561	CAG	2	6	55884	55889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015561	AGA	2	6	56618	56623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015561	CGA	2	6	56780	56785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015561	GCG	2	6	56821	56826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015561	TGG	2	6	59378	59383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015561	GGT	2	6	64053	64058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015561	TGG	2	6	64060	64065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015561	GTC	2	6	64884	64889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015561	TGG	2	6	64933	64938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015561	TGT	2	6	65011	65016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015561	CTT	2	6	65233	65238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.