MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 1471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	GTT	2	6	40	45	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917558
2	NC_015561	AGT	2	6	54	59	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917558
3	NC_015561	CAA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917558
4	NC_015561	GCA	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
5	NC_015561	CGA	2	6	361	366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
6	NC_015561	GCA	3	9	409	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917558
7	NC_015561	CGC	2	6	570	575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917558
8	NC_015561	TCA	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917558
9	NC_015561	GTA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917558
10	NC_015561	GCG	2	6	881	886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917558
11	NC_015561	GGC	2	6	1041	1046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917558
12	NC_015561	GCC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917558
13	NC_015561	ATT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917559
14	NC_015561	GCA	2	6	1306	1311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917559
15	NC_015561	GCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917559
16	NC_015561	CAT	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917560
17	NC_015561	TGG	2	6	1721	1726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917561
18	NC_015561	CGC	2	6	1837	1842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917561
19	NC_015561	CTC	2	6	1882	1887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917561
20	NC_015561	TCT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917561
21	NC_015561	GTG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917561
22	NC_015561	GCT	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917561
23	NC_015561	GCG	2	6	2203	2208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917561
24	NC_015561	ATT	2	6	2483	2488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917562
25	NC_015561	GCC	3	9	2489	2497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917562
26	NC_015561	AGC	2	6	2508	2513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917562
27	NC_015561	GTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917563
28	NC_015561	GAA	2	6	2668	2673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917563
29	NC_015561	TGA	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917563
30	NC_015561	CTG	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917563
31	NC_015561	CGG	2	6	2876	2881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917563
32	NC_015561	CCG	2	6	2905	2910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917563
33	NC_015561	CGG	2	6	2911	2916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917563
34	NC_015561	CTG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917563
35	NC_015561	CAG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917563
36	NC_015561	AAT	2	6	2957	2962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333917563
37	NC_015561	CAA	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917564
38	NC_015561	CAC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917564
39	NC_015561	TCG	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917564
40	NC_015561	GCC	2	6	3575	3580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917564
41	NC_015561	GGT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917564
42	NC_015561	CCA	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917565
43	NC_015561	ATG	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917565
44	NC_015561	CTC	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917565
45	NC_015561	TCG	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917565
46	NC_015561	CGG	2	6	3968	3973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917565
47	NC_015561	GCT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917566
48	NC_015561	TGG	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
49	NC_015561	GCA	2	6	4266	4271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
50	NC_015561	ACA	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
51	NC_015561	ACA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
52	NC_015561	GCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
53	NC_015561	CAC	2	6	4498	4503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
54	NC_015561	GAA	2	6	4545	4550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
55	NC_015561	CAG	2	6	4588	4593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
56	NC_015561	AAG	2	6	4594	4599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
57	NC_015561	CAC	2	6	4711	4716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
58	NC_015561	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917566
59	NC_015561	GCG	2	6	4837	4842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
60	NC_015561	GGC	2	6	4869	4874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
61	NC_015561	CAC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
62	NC_015561	CAG	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
63	NC_015561	CGG	2	6	5156	5161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
64	NC_015561	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
65	NC_015561	ACC	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
66	NC_015561	ACA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
67	NC_015561	ACA	2	6	5260	5265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
68	NC_015561	CAG	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
69	NC_015561	TGG	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
70	NC_015561	CTG	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917566
71	NC_015561	ACG	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
72	NC_015561	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
73	NC_015561	ACA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
74	NC_015561	CCA	2	6	5766	5771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
75	NC_015561	CAT	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917566
76	NC_015561	TAC	2	6	5865	5870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917566
77	NC_015561	ACC	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917566
78	NC_015561	AGG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917566
79	NC_015561	ACG	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917566
80	NC_015561	GGT	2	6	6083	6088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
81	NC_015561	GGT	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917566
82	NC_015561	GCG	3	9	6172	6180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917566
83	NC_015561	CTC	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917566
84	NC_015561	CAA	2	6	6244	6249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917566
85	NC_015561	TGA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917567
86	NC_015561	TTA	2	6	6510	6515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333917567
87	NC_015561	TCA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917567
88	NC_015561	CGC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917567
89	NC_015561	CTT	2	6	7427	7432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917568
90	NC_015561	GGC	2	6	8492	8497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
91	NC_015561	GAA	2	6	8683	8688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917569
92	NC_015561	CGG	2	6	8692	8697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
93	NC_015561	GCG	2	6	8712	8717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917569
94	NC_015561	GAT	2	6	8750	8755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917569
95	NC_015561	GGT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917569
96	NC_015561	CCG	2	6	8811	8816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917569
97	NC_015561	GGT	2	6	8917	8922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917569
98	NC_015561	ATC	2	6	8985	8990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917569
99	NC_015561	GTG	2	6	9040	9045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917570
100	NC_015561	CCG	2	6	9068	9073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917570
101	NC_015561	GCC	2	6	9118	9123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917570
102	NC_015561	ATG	2	6	9161	9166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917570
103	NC_015561	TGC	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
104	NC_015561	GGT	2	6	9319	9324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917570
105	NC_015561	GTG	2	6	9391	9396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917570
106	NC_015561	TGA	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917570
107	NC_015561	AGC	2	6	9476	9481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917570
108	NC_015561	CGG	2	6	9519	9524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
109	NC_015561	CGT	2	6	9552	9557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
110	NC_015561	GCG	2	6	9560	9565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
111	NC_015561	GCG	2	6	9647	9652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
112	NC_015561	CGG	2	6	9656	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
113	NC_015561	CGG	2	6	9744	9749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917570
114	NC_015561	ATC	2	6	9854	9859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917570
115	NC_015561	AGC	3	9	9866	9874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917570
116	NC_015561	CTG	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
117	NC_015561	ATC	2	6	9968	9973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917570
118	NC_015561	TCG	2	6	9993	9998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
119	NC_015561	GAT	2	6	10063	10068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917570
120	NC_015561	CAG	2	6	10150	10155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917570
121	NC_015561	CAC	2	6	10158	10163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917570
122	NC_015561	CAG	2	6	10173	10178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917570
123	NC_015561	GCT	2	6	10181	10186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
124	NC_015561	TGC	2	6	10220	10225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917570
125	NC_015561	TGG	2	6	10627	10632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917571
126	NC_015561	TGG	2	6	10647	10652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917571
127	NC_015561	TCT	2	6	10653	10658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917571
128	NC_015561	CAC	2	6	10754	10759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917571
129	NC_015561	CAT	2	6	11093	11098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917572
130	NC_015561	CAG	2	6	11124	11129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917572
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248	NC_015561	AGC	2	6	19822	19827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917583
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250	NC_015561	CAG	2	6	19952	19957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917584
251	NC_015561	CTG	2	6	20030	20035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917584
252	NC_015561	CTC	2	6	20054	20059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917584
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254	NC_015561	CGG	2	6	20113	20118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917584
255	NC_015561	AGC	2	6	20247	20252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917584
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257	NC_015561	CGC	2	6	20271	20276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917584
258	NC_015561	ACG	2	6	20288	20293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917584
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