MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 1684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015561	CAC	2	6	95191	95196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
1502	NC_015561	TGA	2	6	95235	95240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917664
1503	NC_015561	AGC	2	6	95270	95275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917664
1504	NC_015561	GAA	2	6	95281	95286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917664
1505	NC_015561	GCC	2	6	95294	95299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917664
1506	NC_015561	CGG	2	6	95309	95314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917664
1507	NC_015561	TCG	2	6	95402	95407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917664
1508	NC_015561	CAC	2	6	95480	95485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
1509	NC_015561	ATC	2	6	95528	95533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917664
1510	NC_015561	TGA	2	6	95589	95594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917664
1511	NC_015561	CCA	2	6	95673	95678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
1512	NC_015561	ACC	2	6	95729	95734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917664
1513	NC_015561	GCC	2	6	95779	95784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917664
1514	NC_015561	CGG	2	6	95817	95822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917664
1515	NC_015561	GTC	2	6	95873	95878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917664
1516	NC_015561	CAG	2	6	95899	95904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917664
1517	NC_015561	TCT	2	6	95925	95930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917664
1518	NC_015561	TGG	2	6	95942	95947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917664
1519	NC_015561	TGT	2	6	95948	95953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917664
1520	NC_015561	GCT	2	6	95979	95984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917664
1521	NC_015561	GCG	2	6	95985	95990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917664
1522	NC_015561	ATC	2	6	96013	96018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917664
1523	NC_015561	TGG	2	6	96050	96055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917664
1524	NC_015561	GCG	2	6	96122	96127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_015561	CAG	2	6	96230	96235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1526	NC_015561	CGT	2	6	96272	96277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1527	NC_015561	CGA	2	6	96401	96406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1528	NC_015561	AGG	2	6	96409	96414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917665
1529	NC_015561	CCT	2	6	96431	96436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917665
1530	NC_015561	CGG	2	6	96449	96454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917665
1531	NC_015561	CGA	2	6	96482	96487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1532	NC_015561	CGG	2	6	96518	96523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917665
1533	NC_015561	CCA	2	6	96538	96543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917665
1534	NC_015561	TCG	2	6	96610	96615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1535	NC_015561	GCA	2	6	96619	96624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1536	NC_015561	TCG	2	6	96682	96687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1537	NC_015561	GGC	2	6	96697	96702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917665
1538	NC_015561	TCG	2	6	96769	96774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1539	NC_015561	CAG	2	6	96800	96805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1540	NC_015561	GCT	2	6	96875	96880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1541	NC_015561	CGT	2	6	96971	96976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1542	NC_015561	AAG	2	6	97002	97007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917665
1543	NC_015561	TCG	2	6	97081	97086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1544	NC_015561	GAC	2	6	97137	97142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1545	NC_015561	GCT	2	6	97187	97192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1546	NC_015561	TGC	2	6	97207	97212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1547	NC_015561	TTC	2	6	97287	97292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917665
1548	NC_015561	GCC	2	6	97314	97319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917665
1549	NC_015561	TCG	2	6	97432	97437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917665
1550	NC_015561	AAG	2	6	97446	97451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917665
1551	NC_015561	CCG	2	6	97452	97457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917665
1552	NC_015561	AGG	2	6	97468	97473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917665
1553	NC_015561	TGA	2	6	97528	97533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015561	ACG	3	9	97549	97557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_015561	GCC	2	6	97561	97566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_015561	AAC	2	6	97715	97720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917666
1557	NC_015561	CAG	2	6	97752	97757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917666
1558	NC_015561	CCT	2	6	97963	97968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917667
1559	NC_015561	GAC	2	6	97976	97981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917667
1560	NC_015561	GCC	2	6	98181	98186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917667
1561	NC_015561	GCT	2	6	98193	98198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917667
1562	NC_015561	ACC	2	6	98211	98216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917667
1563	NC_015561	CGA	2	6	98262	98267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917668
1564	NC_015561	GCA	2	6	98383	98388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917668
1565	NC_015561	CGA	2	6	98397	98402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917668
1566	NC_015561	ACG	2	6	98558	98563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015561	CAC	2	6	98691	98696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_015561	ATC	2	6	98932	98937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917669
1569	NC_015561	ACC	3	9	99046	99054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917669
1570	NC_015561	TCA	2	6	99113	99118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917669
1571	NC_015561	GCC	2	6	99142	99147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917669
1572	NC_015561	CAA	2	6	99204	99209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917669
1573	NC_015561	ACG	2	6	99224	99229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917669
1574	NC_015561	CGC	3	9	99309	99317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917669
1575	NC_015561	ACC	2	6	99357	99362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1576	NC_015561	GAA	2	6	99733	99738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015561	GCA	2	6	99756	99761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015561	CGA	2	6	99769	99774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_015561	GCT	2	6	99862	99867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015561	AGT	2	6	100073	100078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917671
1581	NC_015561	CGG	2	6	100110	100115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917671
1582	NC_015561	CGA	2	6	100225	100230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917671
1583	NC_015561	AGT	2	6	100379	100384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917671
1584	NC_015561	GCG	2	6	100418	100423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917671
1585	NC_015561	GAC	2	6	100633	100638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917671
1586	NC_015561	TGC	2	6	100646	100651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917671
1587	NC_015561	CAT	2	6	100654	100659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917671
1588	NC_015561	TGC	2	6	100717	100722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917671
1589	NC_015561	CGG	2	6	100764	100769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917671
1590	NC_015561	TCG	2	6	100882	100887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917671
1591	NC_015561	CGG	2	6	100938	100943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917671
1592	NC_015561	TGT	2	6	100989	100994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917671
1593	NC_015561	CTT	2	6	101071	101076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917671
1594	NC_015561	CCG	2	6	101129	101134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917671
1595	NC_015561	CCA	2	6	101148	101153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917671
1596	NC_015561	TCA	2	6	101227	101232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917672
1597	NC_015561	CTG	2	6	101238	101243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917672
1598	NC_015561	CTC	2	6	101244	101249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917672
1599	NC_015561	GAG	2	6	101251	101256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917672
1600	NC_015561	TGC	2	6	101560	101565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917672
1601	NC_015561	TCC	2	6	101572	101577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917672
1602	NC_015561	TCA	2	6	101582	101587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917672
1603	NC_015561	CGG	2	6	101615	101620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917672
1604	NC_015561	ACG	2	6	101621	101626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917672
1605	NC_015561	TCA	2	6	101636	101641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917672
1606	NC_015561	CCA	2	6	101715	101720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917672
1607	NC_015561	GAC	2	6	101727	101732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917672
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1609	NC_015561	ATG	2	6	101794	101799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917672
1610	NC_015561	GCG	2	6	101962	101967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917672
1611	NC_015561	CTG	2	6	102215	102220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_015561	ATG	2	6	102255	102260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917674
1613	NC_015561	TGC	2	6	102296	102301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917674
1614	NC_015561	GAC	2	6	102360	102365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917674
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1616	NC_015561	TGA	2	6	102427	102432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917674
1617	NC_015561	CCA	2	6	102469	102474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917674
1618	NC_015561	GGA	2	6	102513	102518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917674
1619	NC_015561	GCG	2	6	102567	102572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_015561	CGG	2	6	102573	102578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015561	CCG	2	6	102579	102584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_015561	CGA	2	6	102613	102618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015561	GCC	2	6	102629	102634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_015561	CAG	2	6	102684	102689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.