MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	GA	3	6	320	325	50 %	0 %	50 %	0 %	333917558
2	NC_015561	GC	3	6	1443	1448	0 %	0 %	50 %	50 %	333917559
3	NC_015561	CT	3	6	1605	1610	0 %	50 %	0 %	50 %	333917560
4	NC_015561	AG	3	6	1614	1619	50 %	0 %	50 %	0 %	333917560
5	NC_015561	GT	3	6	2816	2821	0 %	50 %	50 %	0 %	333917563
6	NC_015561	CT	3	6	3149	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015561	GC	3	6	3284	3289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015561	CG	4	8	3452	3459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015561	CG	3	6	3758	3763	0 %	0 %	50 %	50 %	333917565
10	NC_015561	TG	3	6	4088	4093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015561	CG	3	6	4492	4497	0 %	0 %	50 %	50 %	333917566
12	NC_015561	CG	3	6	5308	5313	0 %	0 %	50 %	50 %	333917566
13	NC_015561	TG	3	6	5501	5506	0 %	50 %	50 %	0 %	333917566
14	NC_015561	CA	4	8	6023	6030	50 %	0 %	0 %	50 %	333917566
15	NC_015561	GT	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015561	TC	3	6	6432	6437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015561	GT	3	6	6676	6681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015561	CG	4	8	7049	7056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015561	GT	3	6	8417	8422	0 %	50 %	50 %	0 %	333917569
20	NC_015561	GC	3	6	8872	8877	0 %	0 %	50 %	50 %	333917569
21	NC_015561	TG	3	6	9788	9793	0 %	50 %	50 %	0 %	333917570
22	NC_015561	AG	3	6	10395	10400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015561	GC	3	6	10918	10923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015561	CA	3	6	11486	11491	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
25	NC_015561	GT	3	6	11682	11687	0 %	50 %	50 %	0 %	333917572
26	NC_015561	CG	3	6	11955	11960	0 %	0 %	50 %	50 %	333917572
27	NC_015561	CG	3	6	12383	12388	0 %	0 %	50 %	50 %	333917572
28	NC_015561	CG	3	6	12448	12453	0 %	0 %	50 %	50 %	333917572
29	NC_015561	AC	3	6	12851	12856	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
30	NC_015561	AC	3	6	12865	12870	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
31	NC_015561	AC	3	6	12929	12934	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
32	NC_015561	AC	3	6	13021	13026	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
33	NC_015561	CA	3	6	13066	13071	50 %	0 %	0 %	50 %	333917572
34	NC_015561	CG	3	6	13510	13515	0 %	0 %	50 %	50 %	333917572
35	NC_015561	AC	3	6	13631	13636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015561	TC	3	6	13758	13763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015561	TA	4	8	13920	13927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015561	AC	3	6	14041	14046	50 %	0 %	0 %	50 %	333917573
39	NC_015561	AG	3	6	14530	14535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015561	TC	3	6	14937	14942	0 %	50 %	0 %	50 %	333917576
41	NC_015561	GC	3	6	15605	15610	0 %	0 %	50 %	50 %	333917576
42	NC_015561	GC	3	6	15655	15660	0 %	0 %	50 %	50 %	333917576
43	NC_015561	CG	3	6	16641	16646	0 %	0 %	50 %	50 %	333917576
44	NC_015561	CG	3	6	17567	17572	0 %	0 %	50 %	50 %	333917578
45	NC_015561	GC	3	6	17676	17681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015561	GC	3	6	19182	19187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015561	CT	3	6	20427	20432	0 %	50 %	0 %	50 %	333917584
48	NC_015561	GC	3	6	20469	20474	0 %	0 %	50 %	50 %	333917584
49	NC_015561	TG	3	6	20793	20798	0 %	50 %	50 %	0 %	333917584
50	NC_015561	CA	3	6	21394	21399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015561	CG	3	6	22179	22184	0 %	0 %	50 %	50 %	333917585
52	NC_015561	GC	3	6	22536	22541	0 %	0 %	50 %	50 %	333917585
53	NC_015561	CT	3	6	22662	22667	0 %	50 %	0 %	50 %	333917585
54	NC_015561	TC	3	6	23002	23007	0 %	50 %	0 %	50 %	333917586
55	NC_015561	CA	3	6	23541	23546	50 %	0 %	0 %	50 %	333917587
56	NC_015561	CG	4	8	24677	24684	0 %	0 %	50 %	50 %	333917588
57	NC_015561	GT	3	6	25128	25133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015561	TG	3	6	25174	25179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015561	GC	3	6	26853	26858	0 %	0 %	50 %	50 %	333917591
60	NC_015561	GT	3	6	27087	27092	0 %	50 %	50 %	0 %	333917591
61	NC_015561	GC	3	6	27095	27100	0 %	0 %	50 %	50 %	333917591
62	NC_015561	TC	4	8	27234	27241	0 %	50 %	0 %	50 %	333917591
63	NC_015561	GC	3	6	27794	27799	0 %	0 %	50 %	50 %	333917592
64	NC_015561	AC	4	8	27844	27851	50 %	0 %	0 %	50 %	333917592
65	NC_015561	GA	3	6	28282	28287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015561	CT	3	6	28466	28471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015561	GC	3	6	28715	28720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015561	TC	3	6	28731	28736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015561	CA	3	6	29269	29274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015561	TC	3	6	29883	29888	0 %	50 %	0 %	50 %	333917594
71	NC_015561	CT	3	6	30035	30040	0 %	50 %	0 %	50 %	333917595
72	NC_015561	CG	3	6	31173	31178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015561	GC	3	6	31901	31906	0 %	0 %	50 %	50 %	333917598
74	NC_015561	GC	3	6	31931	31936	0 %	0 %	50 %	50 %	333917598
75	NC_015561	GC	3	6	32105	32110	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
76	NC_015561	GC	3	6	32270	32275	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
77	NC_015561	CG	3	6	32302	32307	0 %	0 %	50 %	50 %	333917599
78	NC_015561	CA	3	6	32637	32642	50 %	0 %	0 %	50 %	333917600
79	NC_015561	GA	4	8	33068	33075	50 %	0 %	50 %	0 %	333917602
80	NC_015561	CG	4	8	33848	33855	0 %	0 %	50 %	50 %	333917603
81	NC_015561	GC	3	6	34351	34356	0 %	0 %	50 %	50 %	333917604
82	NC_015561	TG	3	6	34870	34875	0 %	50 %	50 %	0 %	333917605
83	NC_015561	GT	3	6	35501	35506	0 %	50 %	50 %	0 %	333917605
84	NC_015561	GC	3	6	35613	35618	0 %	0 %	50 %	50 %	333917605
85	NC_015561	GC	3	6	35671	35676	0 %	0 %	50 %	50 %	333917605
86	NC_015561	GC	3	6	35732	35737	0 %	0 %	50 %	50 %	333917605
87	NC_015561	CG	3	6	36105	36110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015561	CG	3	6	36850	36855	0 %	0 %	50 %	50 %	333917606
89	NC_015561	CG	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015561	GC	3	6	37207	37212	0 %	0 %	50 %	50 %	333917607
91	NC_015561	GC	3	6	37405	37410	0 %	0 %	50 %	50 %	333917607
92	NC_015561	GC	3	6	38180	38185	0 %	0 %	50 %	50 %	333917608
93	NC_015561	TC	3	6	39886	39891	0 %	50 %	0 %	50 %	333917610
94	NC_015561	GC	3	6	40702	40707	0 %	0 %	50 %	50 %	333917610
95	NC_015561	GT	3	6	41027	41032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015561	CG	3	6	41709	41714	0 %	0 %	50 %	50 %	333917611
97	NC_015561	TC	3	6	42195	42200	0 %	50 %	0 %	50 %	333917612
98	NC_015561	CG	3	6	42339	42344	0 %	0 %	50 %	50 %	333917612
99	NC_015561	CG	4	8	42841	42848	0 %	0 %	50 %	50 %	333917613
100	NC_015561	CG	3	6	42992	42997	0 %	0 %	50 %	50 %	333917613
101	NC_015561	GC	3	6	43072	43077	0 %	0 %	50 %	50 %	333917613
102	NC_015561	CG	3	6	46079	46084	0 %	0 %	50 %	50 %	333917619
103	NC_015561	GC	3	6	46133	46138	0 %	0 %	50 %	50 %	333917619
104	NC_015561	GC	4	8	47065	47072	0 %	0 %	50 %	50 %	333917619
105	NC_015561	GC	3	6	47985	47990	0 %	0 %	50 %	50 %	333917620
106	NC_015561	CG	3	6	48438	48443	0 %	0 %	50 %	50 %	333917620
107	NC_015561	TC	3	6	48530	48535	0 %	50 %	0 %	50 %	333917620
108	NC_015561	GC	3	6	48665	48670	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
109	NC_015561	TC	3	6	48696	48701	0 %	50 %	0 %	50 %	333917621
110	NC_015561	GC	4	8	48727	48734	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
111	NC_015561	CG	3	6	48799	48804	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
112	NC_015561	GC	4	8	49665	49672	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
113	NC_015561	GC	3	6	49788	49793	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
114	NC_015561	GT	3	6	49973	49978	0 %	50 %	50 %	0 %	333917621
115	NC_015561	GC	3	6	50033	50038	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
116	NC_015561	CG	3	6	50084	50089	0 %	0 %	50 %	50 %	333917621
117	NC_015561	GC	3	6	50660	50665	0 %	0 %	50 %	50 %	333917622
118	NC_015561	TC	3	6	51403	51408	0 %	50 %	0 %	50 %	333917623
119	NC_015561	GC	3	6	51472	51477	0 %	0 %	50 %	50 %	333917623
120	NC_015561	GA	3	6	52468	52473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015561	CG	3	6	52716	52721	0 %	0 %	50 %	50 %	333917624
122	NC_015561	CG	3	6	52835	52840	0 %	0 %	50 %	50 %	333917624
123	NC_015561	AC	3	6	53313	53318	50 %	0 %	0 %	50 %	333917625
124	NC_015561	TG	3	6	53596	53601	0 %	50 %	50 %	0 %	333917625
125	NC_015561	GC	3	6	54028	54033	0 %	0 %	50 %	50 %	333917625
126	NC_015561	TG	3	6	54504	54509	0 %	50 %	50 %	0 %	333917625
127	NC_015561	CA	3	6	55684	55689	50 %	0 %	0 %	50 %	333917627
128	NC_015561	TA	3	6	56648	56653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015561	GC	3	6	57242	57247	0 %	0 %	50 %	50 %	333917629
130	NC_015561	TC	4	8	57904	57911	0 %	50 %	0 %	50 %	333917629
131	NC_015561	TC	3	6	58452	58457	0 %	50 %	0 %	50 %	333917629
132	NC_015561	GC	3	6	59143	59148	0 %	0 %	50 %	50 %	333917630
133	NC_015561	GT	3	6	59198	59203	0 %	50 %	50 %	0 %	333917630
134	NC_015561	CG	3	6	59436	59441	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
135	NC_015561	GC	3	6	59516	59521	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
136	NC_015561	GC	3	6	59714	59719	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
137	NC_015561	CG	3	6	59971	59976	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
138	NC_015561	GT	3	6	60013	60018	0 %	50 %	50 %	0 %	333917631
139	NC_015561	GT	3	6	60564	60569	0 %	50 %	50 %	0 %	333917631
140	NC_015561	GC	3	6	60800	60805	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
141	NC_015561	AG	3	6	60820	60825	50 %	0 %	50 %	0 %	333917631
142	NC_015561	GT	3	6	60886	60891	0 %	50 %	50 %	0 %	333917631
143	NC_015561	GC	4	8	62035	62042	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
144	NC_015561	AG	4	8	62313	62320	50 %	0 %	50 %	0 %	333917631
145	NC_015561	CG	3	6	62492	62497	0 %	0 %	50 %	50 %	333917631
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.