MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-2

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015561	CT	3	6	3149	3154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015561	GC	3	6	3284	3289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015561	CG	4	8	3452	3459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015561	TG	3	6	4088	4093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015561	GT	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015561	TC	3	6	6432	6437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015561	GT	3	6	6676	6681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015561	CG	4	8	7049	7056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015561	AG	3	6	10395	10400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015561	GC	3	6	10918	10923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015561	AC	3	6	13631	13636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015561	TC	3	6	13758	13763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015561	TA	4	8	13920	13927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015561	AG	3	6	14530	14535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015561	GC	3	6	17676	17681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015561	GC	3	6	19182	19187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015561	CA	3	6	21394	21399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015561	GT	3	6	25128	25133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015561	TG	3	6	25174	25179	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015561	GA	3	6	28282	28287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015561	CT	3	6	28466	28471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015561	GC	3	6	28715	28720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_015561	TC	3	6	28731	28736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015561	CA	3	6	29269	29274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015561	CG	3	6	31173	31178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015561	CG	3	6	36105	36110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015561	CG	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015561	GT	3	6	41027	41032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015561	GA	3	6	52468	52473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015561	TA	3	6	56648	56653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015561	TG	3	6	63938	63943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015561	GC	3	6	64891	64896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015561	TG	4	8	64989	64996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015561	GC	3	6	66167	66172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015561	GT	3	6	66415	66420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015561	TG	3	6	68965	68970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015561	GT	3	6	69052	69057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015561	CG	3	6	69093	69098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015561	GC	3	6	76751	76756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015561	CG	3	6	76793	76798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015561	CG	4	8	77600	77607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015561	TG	3	6	83565	83570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015561	GA	3	6	94655	94660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015561	TG	3	6	97583	97588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015561	GC	4	8	97888	97895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015561	GT	3	6	99655	99660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015561	GT	3	6	99705	99710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015561	GC	3	6	106485	106490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015561	CT	3	6	106582	106587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.