MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015560	GCTGC	2	10	56	65	0 %	20 %	40 %	40 %	333917530
2	NC_015560	CCTGC	2	10	1276	1285	0 %	20 %	20 %	60 %	333917533
3	NC_015560	GCTGG	2	10	2438	2447	0 %	20 %	60 %	20 %	333917536
4	NC_015560	CGCGA	2	10	3586	3595	20 %	0 %	40 %	40 %	333917538
5	NC_015560	CCTTC	2	10	3929	3938	0 %	40 %	0 %	60 %	333917539
6	NC_015560	GGTTC	2	10	4352	4361	0 %	40 %	40 %	20 %	333917541
7	NC_015560	CCTGA	2	10	4399	4408	20 %	20 %	20 %	40 %	333917541
8	NC_015560	CCGCC	2	10	5570	5579	0 %	0 %	20 %	80 %	333917542
9	NC_015560	GCCCA	2	10	6906	6915	20 %	0 %	20 %	60 %	333917545
10	NC_015560	ACCAG	2	10	9301	9310	40 %	0 %	20 %	40 %	333917546
11	NC_015560	GGCGC	2	10	9531	9540	0 %	0 %	60 %	40 %	333917547
12	NC_015560	CCGAT	2	10	10882	10891	20 %	20 %	20 %	40 %	333917548
13	NC_015560	GGCTC	2	10	12624	12633	0 %	20 %	40 %	40 %	333917553
14	NC_015560	CGCCA	2	10	13397	13406	20 %	0 %	20 %	60 %	333917553
15	NC_015560	GACCG	2	10	14645	14654	20 %	0 %	40 %	40 %	333917553
16	NC_015560	GACAC	2	10	15819	15828	40 %	0 %	20 %	40 %	333917553
17	NC_015560	CACCC	2	10	15914	15923	20 %	0 %	0 %	80 %	333917553
18	NC_015560	ACACC	2	10	16726	16735	40 %	0 %	0 %	60 %	333917553

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.