MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015560	CGCC	2	8	48	55	0 %	0 %	25 %	75 %	333917530
2	NC_015560	CTGG	2	8	304	311	0 %	25 %	50 %	25 %	333917531
3	NC_015560	GTGA	2	8	376	383	25 %	25 %	50 %	0 %	333917531
4	NC_015560	CCAG	2	8	1026	1033	25 %	0 %	25 %	50 %	333917532
5	NC_015560	AGTG	2	8	1296	1303	25 %	25 %	50 %	0 %	333917533
6	NC_015560	AATT	2	8	1735	1742	50 %	50 %	0 %	0 %	333917534
7	NC_015560	GAGC	2	8	1982	1989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015560	CGGG	2	8	2047	2054	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015560	ATCA	2	8	2714	2721	50 %	25 %	0 %	25 %	333917536
10	NC_015560	ATTC	2	8	2830	2837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015560	TAAA	3	12	2933	2944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015560	GCCT	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	333917538
13	NC_015560	TTAA	2	8	3705	3712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015560	CTTT	2	8	3719	3726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015560	CGAG	2	8	4292	4299	25 %	0 %	50 %	25 %	333917541
16	NC_015560	GACT	2	8	4310	4317	25 %	25 %	25 %	25 %	333917541
17	NC_015560	AGCG	2	8	4489	4496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015560	TCTG	2	8	4616	4623	0 %	50 %	25 %	25 %	333917542
19	NC_015560	GTCA	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	333917542
20	NC_015560	ACGC	2	8	5315	5322	25 %	0 %	25 %	50 %	333917542
21	NC_015560	TGCT	2	8	5422	5429	0 %	50 %	25 %	25 %	333917542
22	NC_015560	GCTG	2	8	5806	5813	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015560	ATCG	2	8	5928	5935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015560	GAAG	2	8	6210	6217	50 %	0 %	50 %	0 %	333917543
25	NC_015560	CCTT	2	8	7149	7156	0 %	50 %	0 %	50 %	333917545
26	NC_015560	GGGC	2	8	7418	7425	0 %	0 %	75 %	25 %	333917545
27	NC_015560	GGCT	2	8	7593	7600	0 %	25 %	50 %	25 %	333917545
28	NC_015560	CCCA	2	8	7858	7865	25 %	0 %	0 %	75 %	333917545
29	NC_015560	ACTG	2	8	8431	8438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015560	AACG	2	8	8707	8714	50 %	0 %	25 %	25 %	333917546
31	NC_015560	GGCC	2	8	9562	9569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015560	CGCC	2	8	9771	9778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015560	CACC	2	8	9812	9819	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015560	CCTG	2	8	9921	9928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015560	GGCT	2	8	10025	10032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015560	ACGG	2	8	10322	10329	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015560	CGAC	2	8	11109	11116	25 %	0 %	25 %	50 %	333917548
38	NC_015560	TCGC	2	8	11247	11254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015560	GTTC	2	8	11684	11691	0 %	50 %	25 %	25 %	333917549
40	NC_015560	GCCA	2	8	11698	11705	25 %	0 %	25 %	50 %	333917549
41	NC_015560	TGCG	2	8	12100	12107	0 %	25 %	50 %	25 %	333917551
42	NC_015560	GATC	2	8	12151	12158	25 %	25 %	25 %	25 %	333917551
43	NC_015560	TGCT	2	8	12288	12295	0 %	50 %	25 %	25 %	333917550
44	NC_015560	GTGA	2	8	12695	12702	25 %	25 %	50 %	0 %	333917553
45	NC_015560	GCGG	2	8	12946	12953	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
46	NC_015560	ACCG	2	8	13055	13062	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
47	NC_015560	GCGG	2	8	13232	13239	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
48	NC_015560	CGCC	2	8	13576	13583	0 %	0 %	25 %	75 %	333917553
49	NC_015560	TCGC	2	8	13703	13710	0 %	25 %	25 %	50 %	333917553
50	NC_015560	CCGG	2	8	14566	14573	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
51	NC_015560	ACCG	2	8	14915	14922	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
52	NC_015560	ACGC	2	8	15773	15780	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
53	NC_015560	CACC	2	8	15808	15815	25 %	0 %	0 %	75 %	333917553
54	NC_015560	CACT	2	8	16209	16216	25 %	25 %	0 %	50 %	333917553
55	NC_015560	CGCC	2	8	16378	16385	0 %	0 %	25 %	75 %	333917553
56	NC_015560	CCAC	2	8	16446	16453	25 %	0 %	0 %	75 %	333917553
57	NC_015560	GCGG	2	8	16474	16481	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
58	NC_015560	GCCA	2	8	16595	16602	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
59	NC_015560	CCCT	2	8	16903	16910	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_015560	CATC	2	8	17610	17617	25 %	25 %	0 %	50 %	333917555
61	NC_015560	CCTG	2	8	17673	17680	0 %	25 %	25 %	50 %	333917556

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.