MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015560	CGCC	2	8	48	55	0 %	0 %	25 %	75 %	333917530
2	NC_015560	CTGG	2	8	304	311	0 %	25 %	50 %	25 %	333917531
3	NC_015560	GTGA	2	8	376	383	25 %	25 %	50 %	0 %	333917531
4	NC_015560	CCAG	2	8	1026	1033	25 %	0 %	25 %	50 %	333917532
5	NC_015560	AGTG	2	8	1296	1303	25 %	25 %	50 %	0 %	333917533
6	NC_015560	AATT	2	8	1735	1742	50 %	50 %	0 %	0 %	333917534
7	NC_015560	ATCA	2	8	2714	2721	50 %	25 %	0 %	25 %	333917536
8	NC_015560	GCCT	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	333917538
9	NC_015560	CGAG	2	8	4292	4299	25 %	0 %	50 %	25 %	333917541
10	NC_015560	GACT	2	8	4310	4317	25 %	25 %	25 %	25 %	333917541
11	NC_015560	TCTG	2	8	4616	4623	0 %	50 %	25 %	25 %	333917542
12	NC_015560	GTCA	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	333917542
13	NC_015560	ACGC	2	8	5315	5322	25 %	0 %	25 %	50 %	333917542
14	NC_015560	TGCT	2	8	5422	5429	0 %	50 %	25 %	25 %	333917542
15	NC_015560	GAAG	2	8	6210	6217	50 %	0 %	50 %	0 %	333917543
16	NC_015560	CCTT	2	8	7149	7156	0 %	50 %	0 %	50 %	333917545
17	NC_015560	GGGC	2	8	7418	7425	0 %	0 %	75 %	25 %	333917545
18	NC_015560	GGCT	2	8	7593	7600	0 %	25 %	50 %	25 %	333917545
19	NC_015560	CCCA	2	8	7858	7865	25 %	0 %	0 %	75 %	333917545
20	NC_015560	AACG	2	8	8707	8714	50 %	0 %	25 %	25 %	333917546
21	NC_015560	CGAC	2	8	11109	11116	25 %	0 %	25 %	50 %	333917548
22	NC_015560	GTTC	2	8	11684	11691	0 %	50 %	25 %	25 %	333917549
23	NC_015560	GCCA	2	8	11698	11705	25 %	0 %	25 %	50 %	333917549
24	NC_015560	TGCG	2	8	12100	12107	0 %	25 %	50 %	25 %	333917551
25	NC_015560	GATC	2	8	12151	12158	25 %	25 %	25 %	25 %	333917551
26	NC_015560	TGCT	2	8	12288	12295	0 %	50 %	25 %	25 %	333917550
27	NC_015560	GTGA	2	8	12695	12702	25 %	25 %	50 %	0 %	333917553
28	NC_015560	GCGG	2	8	12946	12953	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
29	NC_015560	ACCG	2	8	13055	13062	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
30	NC_015560	GCGG	2	8	13232	13239	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
31	NC_015560	CGCC	2	8	13576	13583	0 %	0 %	25 %	75 %	333917553
32	NC_015560	TCGC	2	8	13703	13710	0 %	25 %	25 %	50 %	333917553
33	NC_015560	CCGG	2	8	14566	14573	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
34	NC_015560	ACCG	2	8	14915	14922	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
35	NC_015560	ACGC	2	8	15773	15780	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
36	NC_015560	CACC	2	8	15808	15815	25 %	0 %	0 %	75 %	333917553
37	NC_015560	CACT	2	8	16209	16216	25 %	25 %	0 %	50 %	333917553
38	NC_015560	CGCC	2	8	16378	16385	0 %	0 %	25 %	75 %	333917553
39	NC_015560	CCAC	2	8	16446	16453	25 %	0 %	0 %	75 %	333917553
40	NC_015560	GCGG	2	8	16474	16481	0 %	0 %	75 %	25 %	333917553
41	NC_015560	GCCA	2	8	16595	16602	25 %	0 %	25 %	50 %	333917553
42	NC_015560	CATC	2	8	17610	17617	25 %	25 %	0 %	50 %	333917555
43	NC_015560	CCTG	2	8	17673	17680	0 %	25 %	25 %	50 %	333917556

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.