MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-1

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015560	ATC	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917530
2	NC_015560	CTG	2	6	264	269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917531
3	NC_015560	GGC	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917531
4	NC_015560	CGA	2	6	509	514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917531
5	NC_015560	GAG	2	6	561	566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917531
6	NC_015560	GCA	2	6	575	580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917531
7	NC_015560	GGA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917531
8	NC_015560	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917531
9	NC_015560	GCC	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917531
10	NC_015560	GCT	2	6	777	782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917531
11	NC_015560	TAC	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917531
12	NC_015560	ACG	2	6	880	885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917531
13	NC_015560	GCC	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917532
14	NC_015560	GCT	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917532
15	NC_015560	GCA	2	6	1129	1134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917532
16	NC_015560	CCA	2	6	1147	1152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917532
17	NC_015560	GCC	2	6	1176	1181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917532
18	NC_015560	AGC	2	6	1252	1257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917533
19	NC_015560	GCA	2	6	1262	1267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917533
20	NC_015560	GCG	2	6	1355	1360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917533
21	NC_015560	GCA	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917533
22	NC_015560	CGA	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917533
23	NC_015560	CAC	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917533
24	NC_015560	TGG	2	6	1477	1482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917533
25	NC_015560	TGT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917533
26	NC_015560	GCC	2	6	1504	1509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917533
27	NC_015560	ACC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917534
28	NC_015560	GCG	3	9	1614	1622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917534
29	NC_015560	TGA	2	6	1722	1727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917534
30	NC_015560	CCG	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917535
31	NC_015560	CCT	2	6	1868	1873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917535
32	NC_015560	TCC	2	6	2063	2068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917536
33	NC_015560	CTG	2	6	2220	2225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917536
34	NC_015560	CTC	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917536
35	NC_015560	CGG	2	6	2261	2266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917536
36	NC_015560	GTC	2	6	2775	2780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917536
37	NC_015560	GCG	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917537
38	NC_015560	GCT	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917537
39	NC_015560	ACA	2	6	3405	3410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917538
40	NC_015560	AAC	2	6	3422	3427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917538
41	NC_015560	GAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917538
42	NC_015560	GAG	2	6	3554	3559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917538
43	NC_015560	GCG	3	9	3570	3578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917538
44	NC_015560	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917538
45	NC_015560	CGA	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917539
46	NC_015560	CGA	2	6	3890	3895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917539
47	NC_015560	TGC	2	6	3953	3958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917539
48	NC_015560	TCG	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917540
49	NC_015560	TCA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917540
50	NC_015560	GAT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917540
51	NC_015560	GCA	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917541
52	NC_015560	GCA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917541
53	NC_015560	TCG	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917541
54	NC_015560	AGC	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917541
55	NC_015560	AGG	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917541
56	NC_015560	GCT	2	6	4709	4714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917542
57	NC_015560	TGG	2	6	4755	4760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917542
58	NC_015560	CGG	2	6	4812	4817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917542
59	NC_015560	ATG	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917542
60	NC_015560	GCC	2	6	5056	5061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917542
61	NC_015560	TGC	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917542
62	NC_015560	CCG	2	6	5147	5152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917542
63	NC_015560	CAG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917542
64	NC_015560	GTA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333917542
65	NC_015560	AGA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917542
66	NC_015560	GTT	2	6	5262	5267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333917542
67	NC_015560	AGC	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917542
68	NC_015560	GCC	2	6	5334	5339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917542
69	NC_015560	ACC	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917542
70	NC_015560	GCC	2	6	5378	5383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917542
71	NC_015560	GGC	2	6	5392	5397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917542
72	NC_015560	GCC	3	9	5598	5606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917542
73	NC_015560	AAC	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917542
74	NC_015560	GAA	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917542
75	NC_015560	GAC	2	6	6353	6358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917543
76	NC_015560	TGC	2	6	6695	6700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917544
77	NC_015560	GTG	2	6	6864	6869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917545
78	NC_015560	CGG	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917545
79	NC_015560	ACT	3	9	7026	7034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917545
80	NC_015560	ACG	2	6	7071	7076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917545
81	NC_015560	CTC	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333917545
82	NC_015560	AAC	3	9	7114	7122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917545
83	NC_015560	GAA	2	6	7158	7163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917545
84	NC_015560	GCC	2	6	7210	7215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917545
85	NC_015560	CCA	2	6	7248	7253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917545
86	NC_015560	AGG	3	9	7303	7311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917545
87	NC_015560	GCG	2	6	7387	7392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917545
88	NC_015560	TTC	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917545
89	NC_015560	CAG	2	6	7647	7652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917545
90	NC_015560	CGG	2	6	7706	7711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917545
91	NC_015560	CGA	2	6	7775	7780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917545
92	NC_015560	CCA	2	6	7788	7793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917545
93	NC_015560	CAG	2	6	7968	7973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917545
94	NC_015560	ACG	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917545
95	NC_015560	AGG	2	6	8242	8247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917545
96	NC_015560	CCA	2	6	8260	8265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917545
97	NC_015560	GGA	2	6	8328	8333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333917545
98	NC_015560	CGG	2	6	8384	8389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917545
99	NC_015560	AAC	2	6	8650	8655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917546
100	NC_015560	CGG	2	6	8701	8706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917546
101	NC_015560	GAC	2	6	8842	8847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917546
102	NC_015560	GCC	2	6	9067	9072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333917546
103	NC_015560	ATC	2	6	9086	9091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917546
104	NC_015560	TCT	2	6	9114	9119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917546
105	NC_015560	GTG	2	6	9120	9125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917546
106	NC_015560	TGG	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333917546
107	NC_015560	CCA	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917546
108	NC_015560	CGG	2	6	9434	9439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917547
109	NC_015560	TAC	2	6	9456	9461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917547
110	NC_015560	CGG	2	6	9517	9522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917547
111	NC_015560	TCA	2	6	9547	9552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333917547
112	NC_015560	ACC	2	6	9553	9558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333917547
113	NC_015560	AAC	2	6	10476	10481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333917548
114	NC_015560	CGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917548
115	NC_015560	GCA	2	6	10640	10645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917548
116	NC_015560	TCG	2	6	10765	10770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917548
117	NC_015560	TTC	2	6	10902	10907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917548
118	NC_015560	CTG	2	6	10944	10949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917548
119	NC_015560	AGC	2	6	11029	11034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917548
120	NC_015560	GCG	2	6	11045	11050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917548
121	NC_015560	CAG	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917548
122	NC_015560	TCG	2	6	11617	11622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917549
123	NC_015560	CTT	2	6	11630	11635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917549
124	NC_015560	GCT	2	6	11653	11658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917549
125	NC_015560	GCA	2	6	11864	11869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333917549
126	NC_015560	GCT	2	6	12108	12113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333917551
127	NC_015560	GCG	2	6	12174	12179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333917551
128	NC_015560	GAA	2	6	12182	12187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333917551
129	NC_015560	TTC	2	6	12188	12193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333917551
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.