MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 plasmid pAS9A-1

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015560	CG	3	6	30	35	0 %	0 %	50 %	50 %	333917530
2	NC_015560	GC	3	6	64	69	0 %	0 %	50 %	50 %	333917530
3	NC_015560	GC	3	6	961	966	0 %	0 %	50 %	50 %	333917532
4	NC_015560	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	333917534
5	NC_015560	CG	3	6	2117	2122	0 %	0 %	50 %	50 %	333917536
6	NC_015560	AG	4	8	3144	3151	50 %	0 %	50 %	0 %	333917537
7	NC_015560	TG	3	6	3268	3273	0 %	50 %	50 %	0 %	333917537
8	NC_015560	GC	3	6	4142	4147	0 %	0 %	50 %	50 %	333917540
9	NC_015560	GA	3	6	4337	4342	50 %	0 %	50 %	0 %	333917541
10	NC_015560	GA	3	6	5076	5081	50 %	0 %	50 %	0 %	333917542
11	NC_015560	AG	3	6	5679	5684	50 %	0 %	50 %	0 %	333917542
12	NC_015560	AC	3	6	6198	6203	50 %	0 %	0 %	50 %	333917543
13	NC_015560	CA	3	6	7257	7262	50 %	0 %	0 %	50 %	333917545
14	NC_015560	AC	4	8	8153	8160	50 %	0 %	0 %	50 %	333917545
15	NC_015560	GT	3	6	8180	8185	0 %	50 %	50 %	0 %	333917545
16	NC_015560	CG	3	6	8348	8353	0 %	0 %	50 %	50 %	333917545
17	NC_015560	CA	3	6	8639	8644	50 %	0 %	0 %	50 %	333917546
18	NC_015560	GT	3	6	9196	9201	0 %	50 %	50 %	0 %	333917546
19	NC_015560	CG	3	6	10598	10603	0 %	0 %	50 %	50 %	333917548
20	NC_015560	CG	3	6	10812	10817	0 %	0 %	50 %	50 %	333917548
21	NC_015560	TC	3	6	10854	10859	0 %	50 %	0 %	50 %	333917548
22	NC_015560	TG	4	8	11756	11763	0 %	50 %	50 %	0 %	333917549
23	NC_015560	TG	3	6	11972	11977	0 %	50 %	50 %	0 %	333917551
24	NC_015560	CG	3	6	12231	12236	0 %	0 %	50 %	50 %	333917551
25	NC_015560	GC	3	6	12238	12243	0 %	0 %	50 %	50 %	333917551
26	NC_015560	GC	3	6	12267	12272	0 %	0 %	50 %	50 %	333917551
27	NC_015560	AC	3	6	12430	12435	50 %	0 %	0 %	50 %	333917552
28	NC_015560	CG	3	6	13298	13303	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
29	NC_015560	TG	3	6	13539	13544	0 %	50 %	50 %	0 %	333917553
30	NC_015560	GC	3	6	13729	13734	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
31	NC_015560	CG	3	6	13892	13897	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
32	NC_015560	GC	3	6	14104	14109	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
33	NC_015560	GC	3	6	14239	14244	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
34	NC_015560	CG	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
35	NC_015560	GC	3	6	14328	14333	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
36	NC_015560	TG	3	6	15123	15128	0 %	50 %	50 %	0 %	333917553
37	NC_015560	CG	3	6	15139	15144	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
38	NC_015560	CG	3	6	15368	15373	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
39	NC_015560	GC	3	6	15757	15762	0 %	0 %	50 %	50 %	333917553
40	NC_015560	CA	3	6	15829	15834	50 %	0 %	0 %	50 %	333917553
41	NC_015560	AC	3	6	16293	16298	50 %	0 %	0 %	50 %	333917553
42	NC_015560	CG	3	6	17280	17285	0 %	0 %	50 %	50 %	333917554
43	NC_015560	CA	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	333917555
44	NC_015560	CA	3	6	17639	17644	50 %	0 %	0 %	50 %	333917555
45	NC_015560	GC	4	8	17710	17717	0 %	0 %	50 %	50 %	333917556

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.