MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinomonas posidonica IVIA-Po-181 chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015559	AATGAG	2	12	15508	15519	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015559	ATCGTA	2	12	16982	16993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015559	ATTTAG	2	12	24116	24127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015559	TTCCCC	2	12	79715	79726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015559	AAAATT	2	12	86413	86424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015559	CTGAAA	2	12	97802	97813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015559	GGAAAG	2	12	97938	97949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015559	TGTTAT	2	12	128725	128736	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015559	GACTTA	2	12	169283	169294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015559	TAAAGA	2	12	238417	238428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015559	AGTGGT	2	12	289775	289786	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015559	TTATTT	2	12	339171	339182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015559	TGAAAT	2	12	362398	362409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015559	CTCATT	2	12	397704	397715	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015559	TTTTAT	2	12	490697	490708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015559	GTCTAA	2	12	491809	491820	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015559	GTAGCT	4	24	518906	518929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015559	GGATAG	2	12	625482	625493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015559	GTTTTT	2	12	626241	626252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015559	TGGGTG	2	12	635796	635807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015559	ATAGAG	2	12	739674	739685	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015559	TGAAAT	2	12	753214	753225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015559	CTCTGT	2	12	769087	769098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015559	ATAATT	2	12	781357	781368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015559	TGAAAT	2	12	804525	804536	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015559	TAATTT	2	12	827545	827556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015559	TATTTT	2	12	827613	827624	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015559	CTTTTC	2	12	849817	849828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015559	TTTTAA	2	12	909278	909289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015559	TATTCC	2	12	951481	951492	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015559	GGTATT	2	12	951577	951588	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015559	ATAGAA	2	12	968633	968644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015559	TTTTAT	2	12	971726	971737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015559	GATCTT	2	12	975543	975554	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015559	TTTTCG	2	12	1001223	1001234	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015559	AGGCTG	2	12	1077674	1077685	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015559	ACCATG	3	18	1112348	1112365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015559	ACCATA	2	12	1165962	1165973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015559	TAATGT	2	12	1254780	1254791	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015559	TTGATA	2	12	1345805	1345816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015559	AAATAA	2	12	1388179	1388190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015559	AAGTTG	2	12	1409890	1409901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015559	TTTCGA	2	12	1423560	1423571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015559	AAGTTG	2	12	1439078	1439089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015559	TATTGT	2	12	1477902	1477913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015559	TTGAAT	2	12	1507961	1507972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015559	TTTAAT	2	12	1508025	1508036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015559	AGAGGA	2	12	1553799	1553810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015559	CAAAAT	2	12	1573193	1573204	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015559	TAGAAT	2	12	1599434	1599445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015559	TAATTT	2	12	1631367	1631378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015559	ATTGAG	2	12	1664373	1664384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015559	TTTAAT	2	12	1667146	1667157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015559	AGATTG	2	12	1679473	1679484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015559	TTGTCT	2	12	1693960	1693971	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015559	CAGTTA	2	12	1693993	1694004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015559	TTTATT	2	12	1704119	1704130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015559	ATTAGC	2	12	1717784	1717795	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015559	TATCAT	2	12	1720888	1720899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015559	TGAAAT	2	12	1787618	1787629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015559	CTGGTT	2	12	1857512	1857523	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015559	CCCTAT	2	12	1952704	1952715	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015559	ATTCAT	2	12	1987647	1987658	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015559	AATTAA	2	12	2021567	2021578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015559	CTTTTT	2	12	2093126	2093137	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015559	TTTATT	2	12	2104097	2104108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015559	AAGTGA	2	12	2192889	2192900	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015559	TTTTTA	2	12	2203987	2203998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015559	TAGCCT	2	12	2204073	2204084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015559	CAAAAA	2	12	2249768	2249779	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015559	CCAAAA	2	12	2275297	2275308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015559	AGTTTT	2	12	2314841	2314852	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015559	CATTAA	2	12	2386907	2386918	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015559	TCTATA	2	12	2434106	2434117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015559	TTGATT	2	12	2506034	2506045	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015559	CAAAAA	2	12	2579457	2579468	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015559	GCCATC	2	12	2587116	2587127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015559	AATAAA	2	12	2597134	2597145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015559	AATAAA	2	12	2611416	2611427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015559	ATAAAA	2	12	2620666	2620677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015559	AATAAA	2	12	2626085	2626096	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015559	AGGACT	2	12	2642432	2642443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015559	TTTGGC	2	12	2670181	2670192	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015559	GAGAGT	2	12	2767751	2767762	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015559	GATTTT	2	12	2773944	2773955	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015559	TACTTT	2	12	2775070	2775081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015559	AATTTA	2	12	2790250	2790261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015559	ATTTCA	2	12	2851878	2851889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015559	TTTTCT	2	12	2902147	2902158	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015559	TCCACT	2	12	2999923	2999934	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015559	ATCACA	2	12	3002871	3002882	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015559	ATTGCT	2	12	3046067	3046078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015559	TTCGAA	2	12	3061308	3061319	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015559	AAAAAC	2	12	3087955	3087966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015559	ATCAAA	2	12	3092575	3092586	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015559	CTAAAC	2	12	3143434	3143445	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015559	ATAACA	2	12	3169675	3169686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015559	ATTGGC	2	12	3169712	3169723	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015559	AAAGCA	4	24	3249241	3249264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015559	CTTTCT	2	12	3274868	3274879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015559	ACAAAA	2	12	3333472	3333483	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_015559	ATGTCT	2	12	3353720	3353731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015559	TTTATT	2	12	3386615	3386626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015559	ATAATT	2	12	3437257	3437268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015559	CATATT	2	12	3446729	3446740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015559	TCACAC	2	12	3574071	3574082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015559	ATTTCA	2	12	3576692	3576703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015559	ATTTCA	2	12	3624209	3624220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015559	TAGAAT	2	12	3649266	3649277	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015559	TATCAA	2	12	3710775	3710786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015559	TAAAAA	2	12	3710856	3710867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015559	ATTTCA	2	12	3720663	3720674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015559	CTCATG	2	12	3765280	3765291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015559	CAAAAA	2	12	3771419	3771430	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_015559	ACAATT	2	12	3777859	3777870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015559	AGTCAA	2	12	3780253	3780264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015559	ATAACA	2	12	3780285	3780296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015559	TTTATT	2	12	3788221	3788232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015559	ATTTTT	2	12	3814724	3814735	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015559	CTAGCC	2	12	3873407	3873418	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.