MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinomonas posidonica IVIA-Po-181 chromosome

Total Repeats: 413

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015559	TGTAT	2	10	27649	27658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015559	TCTAT	2	10	28970	28979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015559	TAAAA	2	10	66585	66594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015559	ATTAT	2	10	84190	84199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015559	TAAAG	2	10	90347	90356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015559	TACAG	2	10	99874	99883	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015559	CGAAA	2	10	104612	104621	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015559	CATAA	2	10	141426	141435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015559	CGGGG	2	10	141539	141548	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015559	ATTCA	2	10	150684	150693	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015559	TTGTT	2	10	152324	152333	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015559	TCCTT	2	10	154406	154415	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015559	CATAA	2	10	155598	155607	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_015559	GGCTT	2	10	155773	155782	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015559	ATTTC	2	10	155799	155808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015559	AAGGG	2	10	167577	167586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015559	CGTGT	2	10	170522	170531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015559	ATTTC	2	10	203339	203348	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015559	AAAGA	2	10	222947	222956	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015559	GATCG	2	10	227858	227867	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015559	GGGAA	2	10	238530	238539	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015559	GCGCG	2	10	240262	240271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015559	AGAGT	2	10	248506	248515	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015559	CCTTT	2	10	250400	250409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015559	TTGCA	2	10	252532	252541	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015559	TGGGC	2	10	252637	252646	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015559	TATGG	2	10	254585	254594	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015559	CTTTT	2	10	257190	257199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015559	TCATT	2	10	262748	262757	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015559	ATGTT	2	10	262792	262801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015559	TTTAC	2	10	272910	272919	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015559	CTTTT	2	10	289672	289681	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015559	CTTAT	2	10	289716	289725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015559	GTTTG	2	10	298457	298466	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015559	TTCTA	2	10	303131	303140	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015559	GAGTG	2	10	305635	305644	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015559	TAGTC	2	10	316175	316184	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015559	TCGAT	2	10	323537	323546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015559	AAATA	2	10	339089	339098	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015559	ATTTT	2	10	339263	339272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015559	AGACT	2	10	347574	347583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015559	AGAGA	2	10	360323	360332	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015559	AGTCG	2	10	361494	361503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015559	CAGGG	2	10	361718	361727	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015559	AAGAT	2	10	363162	363171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015559	ATCCC	2	10	363506	363515	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_015559	CACAT	2	10	363661	363670	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015559	GTATG	2	10	364182	364191	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015559	GGTAG	2	10	368957	368966	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015559	ATTTT	2	10	369022	369031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015559	GGCTT	2	10	373853	373862	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015559	AATCG	4	20	386392	386411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015559	TAACA	2	10	387699	387708	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015559	CGCTT	2	10	408217	408226	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_015559	TTTGG	2	10	428425	428434	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015559	AGTTT	2	10	439321	439330	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015559	AGGGA	2	10	461578	461587	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015559	ATTTT	2	10	485916	485925	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015559	TGATT	2	10	504241	504250	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015559	ATTTT	2	10	509682	509691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015559	AATTG	2	10	519490	519499	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015559	ATTAA	2	10	519504	519513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015559	AAAGT	2	10	529938	529947	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015559	AAATT	2	10	533873	533882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015559	GTTAA	2	10	533936	533945	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015559	TAATG	2	10	553544	553553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015559	ATTCA	2	10	556181	556190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015559	TTGGG	2	10	559658	559667	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015559	CTAAA	2	10	570251	570260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015559	CTTAG	3	15	570282	570296	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015559	ATGAA	2	10	585011	585020	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015559	ATGGA	2	10	588645	588654	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015559	TTTAC	2	10	590943	590952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015559	ATTTT	2	10	593797	593806	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015559	AAACA	2	10	603414	603423	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015559	CCAAA	2	10	603866	603875	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015559	ATTTA	2	10	609203	609212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015559	ATAGG	2	10	610098	610107	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015559	CTCTT	2	10	635379	635388	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015559	ATATA	2	10	636104	636113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015559	CAAAG	2	10	662799	662808	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015559	TGTGC	2	10	666998	667007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015559	CTTTG	2	10	667060	667069	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015559	AAGGG	2	10	677684	677693	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015559	TTGGA	2	10	678952	678961	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015559	TGTAA	2	10	685446	685455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015559	ATAAA	2	10	685539	685548	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015559	ATACG	2	10	691176	691185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015559	AATGA	2	10	693428	693437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015559	TTGCA	2	10	704211	704220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015559	AGGGT	2	10	745701	745710	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015559	AGAGA	2	10	751139	751148	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015559	AGTCG	2	10	752310	752319	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015559	CAGGG	2	10	752534	752543	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015559	AAGAT	2	10	753978	753987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015559	ATCCC	2	10	754322	754331	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_015559	TGAAG	2	10	754561	754570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015559	TTAAC	2	10	755244	755253	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015559	TTATT	2	10	756222	756231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015559	ATTGC	2	10	788789	788798	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015559	ATTGA	2	10	796738	796747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015559	GATTT	2	10	801839	801848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015559	AGAGA	2	10	802451	802460	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015559	AGTCG	2	10	803622	803631	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015559	CAGGG	2	10	803846	803855	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015559	AAGAT	2	10	805289	805298	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015559	ATCCC	2	10	805633	805642	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
108	NC_015559	TAAAA	2	10	806660	806669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015559	TAATT	2	10	821447	821456	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015559	AATGC	2	10	823514	823523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_015559	TGTCT	2	10	830466	830475	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015559	TAATA	2	10	878780	878789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015559	TTTGC	2	10	949020	949029	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015559	GCGAG	2	10	967139	967148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015559	AACGA	2	10	967908	967917	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015559	TTAAA	2	10	969709	969718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015559	ACCAA	2	10	983121	983130	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_015559	GCAAA	2	10	986193	986202	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015559	ACATG	2	10	992680	992689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015559	CTTTT	2	10	995777	995786	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015559	ATTTT	2	10	998030	998039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015559	TTATA	2	10	1013573	1013582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015559	AGCCT	3	15	1013788	1013802	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015559	TATCC	2	10	1020985	1020994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_015559	CTGAG	3	15	1040928	1040942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015559	TATTT	2	10	1065722	1065731	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015559	ATTGG	2	10	1065771	1065780	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015559	AAAAC	2	10	1084807	1084816	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015559	ATTGA	2	10	1109770	1109779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015559	ATTAG	2	10	1112383	1112392	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015559	AAATT	2	10	1113232	1113241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015559	ACTAA	2	10	1123406	1123415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015559	GTTTT	2	10	1145411	1145420	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015559	GAATA	2	10	1177252	1177261	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015559	GCGAG	2	10	1177276	1177285	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015559	TCGCT	2	10	1185252	1185261	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015559	TTAAA	2	10	1188979	1188988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015559	TGGCG	2	10	1207970	1207979	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015559	TCGTT	2	10	1246856	1246865	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015559	CATCA	2	10	1249246	1249255	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015559	AATAA	2	10	1250012	1250021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015559	AAAGG	2	10	1254387	1254396	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015559	AAATG	2	10	1255111	1255120	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015559	GAGCC	2	10	1255889	1255898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015559	AGCGA	2	10	1257496	1257505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015559	AAATA	2	10	1259750	1259759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015559	AACGA	2	10	1262375	1262384	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015559	GTTGT	2	10	1269809	1269818	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_015559	CCAGC	2	10	1436108	1436117	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_015559	GTTTT	2	10	1439420	1439429	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_015559	TTATC	2	10	1464838	1464847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_015559	ATCGC	2	10	1683008	1683017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_015559	GTTTG	2	10	2810197	2810206	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
287	NC_015559	CTTTC	2	10	2810380	2810389	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
288	NC_015559	CATGC	2	10	2834997	2835006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
289	NC_015559	CATGC	2	10	2835130	2835139	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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292	NC_015559	GGGAT	2	10	2850772	2850781	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_015559	TACGC	2	10	3089003	3089012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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399	NC_015559	CCCTG	2	10	3721345	3721354	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
400	NC_015559	CGACT	2	10	3721569	3721578	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
401	NC_015559	TCTCT	2	10	3722740	3722749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
402	NC_015559	ATGAG	2	10	3729158	3729167	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
403	NC_015559	TTGAA	2	10	3729211	3729220	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_015559	ATTGT	2	10	3807893	3807902	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_015559	AAAAG	2	10	3843601	3843610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
411	NC_015559	TTTCT	2	10	3854570	3854579	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
412	NC_015559	ATTAA	2	10	3873011	3873020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_015559	CTTTT	2	10	3877333	3877342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.