MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	ATTTTT	2	12	1689	1700	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015555	AAAGGA	2	12	3090	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015555	TCAAAT	2	12	6790	6801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895870
4	NC_015555	TCTGTA	2	12	6965	6976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895870
5	NC_015555	AGACGA	2	12	7764	7775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895870
6	NC_015555	CAAGAG	2	12	7896	7907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895870
7	NC_015555	TACGAC	2	12	10325	10336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895871
8	NC_015555	ACATGC	2	12	13187	13198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895875
9	NC_015555	AAGAGA	2	12	14015	14026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895875
10	NC_015555	ATCGAT	2	12	20698	20709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895881
11	NC_015555	TCGATG	2	12	20732	20743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895881
12	NC_015555	AAAAGA	2	12	20796	20807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333895881
13	NC_015555	TAAAAT	2	12	23134	23145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895883
14	NC_015555	AAATAA	2	12	34413	34424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015555	GCAAAA	2	12	37592	37603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895895
16	NC_015555	TACTGA	2	12	37962	37973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895895
17	NC_015555	TGCAGC	2	12	41206	41217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333895897
18	NC_015555	AGATTA	2	12	42316	42327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333895898
19	NC_015555	ATGCCA	2	12	42647	42658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895898
20	NC_015555	TTTTGA	2	12	46454	46465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333895902
21	NC_015555	TTTTTA	2	12	52008	52019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015555	GTTGTC	2	12	53167	53178	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333895906
23	NC_015555	TAAATG	2	12	55393	55404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333895907
24	NC_015555	AAAATG	2	12	56867	56878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015555	AAGCGA	2	12	62883	62894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015555	ACGTTG	2	12	62994	63005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015555	AAGCGA	2	12	63468	63479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015555	AAAACC	2	12	67953	67964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895919
29	NC_015555	TAATTT	2	12	70838	70849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895922
30	NC_015555	AGCTTG	2	12	72290	72301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895923
31	NC_015555	GCAAAA	2	12	75459	75470	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895925
32	NC_015555	AAAATG	2	12	75798	75809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333895925
33	NC_015555	TACTGA	2	12	75829	75840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895925
34	NC_015555	AAGCGA	2	12	82109	82120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015555	ACGTTG	2	12	82220	82231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015555	AAGCGA	2	12	82694	82705	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015555	TACGAT	2	12	87905	87916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895934
38	NC_015555	AAGACG	2	12	89052	89063	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895936
39	NC_015555	TAGATT	2	12	90509	90520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895938
40	NC_015555	TTGATT	2	12	93370	93381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333895942
41	NC_015555	GCCTCT	2	12	95227	95238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333895943
42	NC_015555	ATTTGA	2	12	96556	96567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895944
43	NC_015555	TGATAA	2	12	98117	98128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015555	ATACTT	2	12	98270	98281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333895946
45	NC_015555	GTCAAA	2	12	103346	103357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895951
46	NC_015555	AGCTTA	2	12	104134	104145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895951
47	NC_015555	CGTTGG	2	12	114503	114514	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333895964
48	NC_015555	ACAATT	2	12	116721	116732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895967
49	NC_015555	TTAGCT	2	12	119328	119339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895968
50	NC_015555	GCAAAT	2	12	129627	129638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895981
51	NC_015555	GGTAAA	2	12	134399	134410	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333895984
52	NC_015555	TATCGA	2	12	135697	135708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015555	ATTTTT	2	12	136211	136222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015555	CCTTTT	2	12	136348	136359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015555	ATAAAA	2	12	137074	137085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333895986
56	NC_015555	ATAAAT	2	12	138576	138587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895987
57	NC_015555	AATAAA	2	12	139921	139932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015555	CATATA	2	12	140152	140163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895989
59	NC_015555	GCAAAA	2	12	142974	142985	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895991
60	NC_015555	TACTGA	2	12	143344	143355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895991
61	NC_015555	ATAAAT	2	12	145353	145364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895992
62	NC_015555	ATCTAT	2	12	148199	148210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333895997
63	NC_015555	TTTCAG	2	12	148833	148844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895998
64	NC_015555	TAGCCA	2	12	157737	157748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896007
65	NC_015555	TTAAAC	2	12	160293	160304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015555	GTTAAA	2	12	162750	162761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896011
67	NC_015555	CGAAAA	2	12	164447	164458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896011
68	NC_015555	GACAAA	2	12	168125	168136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896016
69	NC_015555	TATTGA	2	12	171393	171404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333896019
70	NC_015555	TAAAAA	2	12	172197	172208	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333896021
71	NC_015555	ATAGAC	2	12	172867	172878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896021
72	NC_015555	AAATAA	2	12	176077	176088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015555	TGAATA	2	12	179523	179534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896027
74	NC_015555	CTGAAG	2	12	180105	180116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896027
75	NC_015555	GAATAA	2	12	182688	182699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015555	GCGGTG	2	12	184084	184095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333896031
77	NC_015555	AGAGGT	2	12	184254	184265	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333896031
78	NC_015555	AAAGAG	2	12	186716	186727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896033
79	NC_015555	CTCATT	2	12	191960	191971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333896039
80	NC_015555	TGAAAT	2	12	192396	192407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896039
81	NC_015555	CAAATG	2	12	193836	193847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896040
82	NC_015555	ATTTTT	2	12	194852	194863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333896041
83	NC_015555	GGCTGT	2	12	195797	195808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333896041
84	NC_015555	ATGTGT	2	12	197129	197140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333896042
85	NC_015555	AAATTT	2	12	197466	197477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015555	AAATAA	2	12	202354	202365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015555	TGGTGA	2	12	203075	203086	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333896048
88	NC_015555	TGGACT	2	12	203094	203105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896048
89	NC_015555	TATAGA	2	12	204751	204762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896051
90	NC_015555	AGATAA	2	12	207907	207918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896052
91	NC_015555	TAAAAT	2	12	208977	208988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896053
92	NC_015555	GACAAT	2	12	211543	211554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896056
93	NC_015555	ATAAAT	2	12	214702	214713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015555	CAATGC	2	12	216046	216057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896060
95	NC_015555	TAAAAG	2	12	222593	222604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896064
96	NC_015555	TAGATG	2	12	225860	225871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896066
97	NC_015555	AGCTTT	2	12	226560	226571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333896068
98	NC_015555	ATCTTT	2	12	227261	227272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333896068
99	NC_015555	TACTGT	2	12	231806	231817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333896072
100	NC_015555	ATATGA	2	12	232487	232498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896073
101	NC_015555	TTGTTT	2	12	235480	235491	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896075
102	NC_015555	CTTTGT	2	12	237226	237237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333896076
103	NC_015555	AGCTTA	2	12	238153	238164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896077
104	NC_015555	AAATAT	2	12	240771	240782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896080
105	NC_015555	TTAGCA	2	12	242045	242056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896083
106	NC_015555	GTTTTT	2	12	242070	242081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896083
107	NC_015555	CCAAAA	2	12	244821	244832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896086
108	NC_015555	TATAGG	2	12	247256	247267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896088
109	NC_015555	CTATGA	2	12	250551	250562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896090
110	NC_015555	GCAACA	2	12	254883	254894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015555	TGTGCT	2	12	258476	258487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333896095
112	NC_015555	GCTGAA	2	12	258681	258692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896095
113	NC_015555	TACTTT	2	12	259059	259070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333896096
114	NC_015555	ACCTAT	2	12	260178	260189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896098
115	NC_015555	TTCACC	2	12	261571	261582	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333896099
116	NC_015555	GTTTTG	2	12	268878	268889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896108
117	NC_015555	TAAGCT	2	12	272684	272695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896111
118	NC_015555	ATTGCC	2	12	272916	272927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333896111
119	NC_015555	GTATCA	2	12	278218	278229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896115
120	NC_015555	TGGAAG	2	12	284842	284853	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333896121
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122	NC_015555	CACCAT	2	12	299073	299084	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333896138
123	NC_015555	TTTAAA	2	12	299372	299383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015555	CAAAGA	2	12	301096	301107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896141
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130	NC_015555	AGGTGC	2	12	331870	331881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333896166
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153	NC_015555	AAGCGA	2	12	376087	376098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015555	TCATCG	2	12	384358	384369	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333896232
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181	NC_015555	TCAGTA	2	12	449551	449562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896288
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232	NC_015555	TAGGCA	2	12	599416	599427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896419
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234	NC_015555	TTACGG	2	12	602193	602204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896422
235	NC_015555	AATGCT	2	12	603838	603849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
236	NC_015555	TGATGC	2	12	604792	604803	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896425
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242	NC_015555	ATTTTT	2	12	624151	624162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_015555	TATATC	2	12	624508	624519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333896443
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344	NC_015555	TGCAGG	2	12	874670	874681	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333896665
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346	NC_015555	TACAAA	2	12	879892	879903	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333896670
347	NC_015555	GCCAAC	2	12	884922	884933	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333896675
348	NC_015555	AGCATC	2	12	885176	885187	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896675
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465	NC_015555	GAAATG	2	12	1166134	1166145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333896922
466	NC_015555	GAAAGA	2	12	1178882	1178893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896935
467	NC_015555	GATTAA	2	12	1179109	1179120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896935
468	NC_015555	TGAAGA	2	12	1180022	1180033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333896937
469	NC_015555	TGGAAT	2	12	1182420	1182431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896939
470	NC_015555	TGTAGA	2	12	1185243	1185254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896942
471	NC_015555	TAAAAG	2	12	1187886	1187897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896944
472	NC_015555	GCCATA	2	12	1192015	1192026	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896949
473	NC_015555	GCAAAA	2	12	1193603	1193614	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896951
474	NC_015555	TACTGA	2	12	1193973	1193984	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896951
475	NC_015555	ATATAA	2	12	1197392	1197403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896955
476	NC_015555	TTTGTT	2	12	1198101	1198112	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896956
477	NC_015555	GGAATT	2	12	1198459	1198470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896956
478	NC_015555	GGCATA	2	12	1201587	1201598	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896960
479	NC_015555	GATACG	2	12	1206054	1206065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896963
480	NC_015555	TATGGA	2	12	1206341	1206352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896963
481	NC_015555	TCTGCA	2	12	1209367	1209378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333896965
482	NC_015555	AGAGAT	2	12	1210651	1210662	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333896966
483	NC_015555	TTTTAA	2	12	1214248	1214259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_015555	AATTCA	2	12	1214790	1214801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333896969
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487	NC_015555	CATGGG	2	12	1217970	1217981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333896972
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489	NC_015555	TCAAGT	2	12	1232477	1232488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896986
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491	NC_015555	TTTTGC	2	12	1240242	1240253	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333896997
492	NC_015555	TACTGT	2	12	1242423	1242434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333897000
493	NC_015555	GTTGAA	2	12	1246820	1246831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897005
494	NC_015555	GTTTTA	2	12	1248099	1248110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333897007
495	NC_015555	TAAAGT	2	12	1251562	1251573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333897012
496	NC_015555	AATTAT	2	12	1251680	1251691	50 %	50 %	0 %	0 %	333897013
497	NC_015555	GTATTA	2	12	1253686	1253697	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333897016
498	NC_015555	TTGAAG	2	12	1254207	1254218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333897017
499	NC_015555	ACGATG	2	12	1254986	1254997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333897017
500	NC_015555	AAAGGG	2	12	1258373	1258384	50 %	0 %	50 %	0 %	333897021

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