MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	ATTTTT	2	12	1689	1700	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015555	AAAGGA	2	12	3090	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015555	AAATAA	2	12	34413	34424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015555	TTTTTA	2	12	52008	52019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015555	AAAATG	2	12	56867	56878	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015555	AAGCGA	2	12	62883	62894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015555	ACGTTG	2	12	62994	63005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015555	AAGCGA	2	12	63468	63479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015555	AAGCGA	2	12	82109	82120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015555	ACGTTG	2	12	82220	82231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015555	AAGCGA	2	12	82694	82705	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_015555	TGATAA	2	12	98117	98128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015555	TATCGA	2	12	135697	135708	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015555	ATTTTT	2	12	136211	136222	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015555	CCTTTT	2	12	136348	136359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015555	AATAAA	2	12	139921	139932	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015555	TTAAAC	2	12	160293	160304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015555	AAATAA	2	12	176077	176088	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015555	GAATAA	2	12	182688	182699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015555	AAATTT	2	12	197466	197477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015555	AAATAA	2	12	202354	202365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015555	ATAAAT	2	12	214702	214713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015555	GCAACA	2	12	254883	254894	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015555	TTTAAA	2	12	299372	299383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015555	AGATGG	2	12	329726	329737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015555	AATAAA	2	12	340259	340270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015555	TAAAAT	2	12	372383	372394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015555	AAGCGA	2	12	375502	375513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015555	ACGTTG	2	12	375613	375624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015555	AAGCGA	2	12	376087	376098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015555	AAAACT	2	12	402887	402898	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015555	TTTTAT	2	12	425505	425516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015555	ATTTAT	2	12	433080	433091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015555	AAGCGA	2	12	444928	444939	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015555	ACGTTG	2	12	445039	445050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015555	AAGCGA	2	12	445513	445524	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015555	TTGAAA	2	12	461045	461056	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015555	AAATTC	2	12	524302	524313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_015555	AATGCT	2	12	603838	603849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015555	ATATTT	2	12	613483	613494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015555	ATTTTT	2	12	624151	624162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015555	TGTTTA	2	12	659125	659136	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015555	TCAGTA	2	12	690845	690856	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015555	TAAGCG	2	12	712961	712972	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015555	TGATAT	2	12	725514	725525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015555	GCATAT	2	12	727029	727040	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015555	ATCAAT	2	12	741375	741386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015555	TTTTTA	2	12	790409	790420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015555	AATATT	2	12	791358	791369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015555	AGTAAT	2	12	793750	793761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015555	ATTAAA	2	12	804829	804840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015555	ACTAAA	2	12	804883	804894	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015555	AAGTGT	2	12	805946	805957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015555	GAATTG	2	12	819139	819150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015555	TGCTAT	2	12	868879	868890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015555	AAAAAT	2	12	887096	887107	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015555	AAATTA	2	12	891452	891463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015555	TGAAAA	2	12	892162	892173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015555	ATTTTT	2	12	962676	962687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015555	ATAGAT	2	12	1019952	1019963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015555	AATAAA	2	12	1078803	1078814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015555	ATTTAA	2	12	1092649	1092660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015555	TTTTAA	2	12	1214248	1214259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015555	ATAATT	2	12	1320745	1320756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015555	CATTAT	2	12	1399630	1399641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015555	ATTATA	2	12	1434253	1434264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015555	TTCGCT	2	12	1456530	1456541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015555	TCAACG	2	12	1457004	1457015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015555	TCGCTT	2	12	1457116	1457127	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015555	ATAAAA	2	12	1499201	1499212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015555	TATGAA	2	12	1503677	1503688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015555	TTGCAT	2	12	1537570	1537581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015555	TATATT	2	12	1619635	1619646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015555	TAAAAA	2	12	1634718	1634729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015555	TAATTT	2	12	1674673	1674684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015555	ATTTTT	2	12	1701438	1701449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015555	TATTAA	2	12	1733186	1733197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015555	AGCTGG	2	12	1734538	1734549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_015555	ATCTAC	2	12	1734961	1734972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015555	ATTACT	2	12	1774234	1774245	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015555	TTAATT	2	12	1774327	1774338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015555	ATTTAA	2	12	1808503	1808514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015555	ACTTTG	2	12	1810428	1810439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_015555	ATATTC	2	12	1812357	1812368	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015555	TGTTCT	2	12	1839920	1839931	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_015555	TGCTTT	2	12	1842722	1842733	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015555	GAATCT	2	12	1932182	1932193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015555	ATTACT	2	12	1933722	1933733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_015555	AGTTTT	2	12	1933788	1933799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015555	TTTTTA	2	12	1974517	1974528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015555	CATTTT	2	12	1985484	1985495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015555	AATTTT	2	12	2069454	2069465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015555	CCCCTA	2	12	2109355	2109366	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015555	ACAAAA	2	12	2109441	2109452	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015555	AATATT	2	12	2118640	2118651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015555	AATATT	2	12	2150224	2150235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015555	AATGAA	2	12	2150280	2150291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015555	CTCATT	2	12	2160403	2160414	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015555	ATTTAA	2	12	2160719	2160730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015555	TCCCAA	2	12	2167126	2167137	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015555	ATATTT	2	12	2292306	2292317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015555	GCTTTC	2	12	2296106	2296117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015555	TAAAAA	2	12	2308352	2308363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015555	AATATT	2	12	2331028	2331039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015555	TTAAAT	2	12	2335415	2335426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015555	AAAATG	2	12	2339614	2339625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015555	TGTTTT	2	12	2361106	2361117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015555	TAAGCT	2	12	2362820	2362831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015555	CTTGTT	2	12	2393840	2393851	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015555	CTTTTA	2	12	2419926	2419937	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015555	AACAGA	2	12	2456358	2456369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015555	ATAAAG	2	12	2462305	2462316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015555	TAAATC	2	12	2465343	2465354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015555	TAATTA	2	12	2480185	2480196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015555	AGAGAT	2	12	2483092	2483103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015555	CATATA	2	12	2490368	2490379	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015555	TATCTC	2	12	2493560	2493571	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015555	ATTACT	2	12	2496200	2496211	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.