MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	TCAAAT	2	12	6790	6801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895870
2	NC_015555	TCTGTA	2	12	6965	6976	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895870
3	NC_015555	AGACGA	2	12	7764	7775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895870
4	NC_015555	CAAGAG	2	12	7896	7907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895870
5	NC_015555	TACGAC	2	12	10325	10336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895871
6	NC_015555	ACATGC	2	12	13187	13198	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895875
7	NC_015555	AAGAGA	2	12	14015	14026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333895875
8	NC_015555	ATCGAT	2	12	20698	20709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895881
9	NC_015555	TCGATG	2	12	20732	20743	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895881
10	NC_015555	AAAAGA	2	12	20796	20807	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	333895881
11	NC_015555	TAAAAT	2	12	23134	23145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895883
12	NC_015555	GCAAAA	2	12	37592	37603	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895895
13	NC_015555	TACTGA	2	12	37962	37973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895895
14	NC_015555	TGCAGC	2	12	41206	41217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333895897
15	NC_015555	AGATTA	2	12	42316	42327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333895898
16	NC_015555	ATGCCA	2	12	42647	42658	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895898
17	NC_015555	TTTTGA	2	12	46454	46465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333895902
18	NC_015555	GTTGTC	2	12	53167	53178	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333895906
19	NC_015555	TAAATG	2	12	55393	55404	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333895907
20	NC_015555	AAAACC	2	12	67953	67964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333895919
21	NC_015555	TAATTT	2	12	70838	70849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333895922
22	NC_015555	AGCTTG	2	12	72290	72301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895923
23	NC_015555	GCAAAA	2	12	75459	75470	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895925
24	NC_015555	AAAATG	2	12	75798	75809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333895925
25	NC_015555	TACTGA	2	12	75829	75840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895925
26	NC_015555	TACGAT	2	12	87905	87916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895934
27	NC_015555	AAGACG	2	12	89052	89063	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333895936
28	NC_015555	TAGATT	2	12	90509	90520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895938
29	NC_015555	TTGATT	2	12	93370	93381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333895942
30	NC_015555	GCCTCT	2	12	95227	95238	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333895943
31	NC_015555	ATTTGA	2	12	96556	96567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895944
32	NC_015555	ATACTT	2	12	98270	98281	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333895946
33	NC_015555	GTCAAA	2	12	103346	103357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895951
34	NC_015555	AGCTTA	2	12	104134	104145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895951
35	NC_015555	CGTTGG	2	12	114503	114514	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333895964
36	NC_015555	ACAATT	2	12	116721	116732	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895967
37	NC_015555	TTAGCT	2	12	119328	119339	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895968
38	NC_015555	GCAAAT	2	12	129627	129638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895981
39	NC_015555	GGTAAA	2	12	134399	134410	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333895984
40	NC_015555	ATAAAA	2	12	137074	137085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333895986
41	NC_015555	ATAAAT	2	12	138576	138587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895987
42	NC_015555	CATATA	2	12	140152	140163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895989
43	NC_015555	GCAAAA	2	12	142974	142985	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895991
44	NC_015555	TACTGA	2	12	143344	143355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895991
45	NC_015555	ATAAAT	2	12	145353	145364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333895992
46	NC_015555	ATCTAT	2	12	148199	148210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333895997
47	NC_015555	TTTCAG	2	12	148833	148844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333895998
48	NC_015555	TAGCCA	2	12	157737	157748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896007
49	NC_015555	GTTAAA	2	12	162750	162761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896011
50	NC_015555	CGAAAA	2	12	164447	164458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896011
51	NC_015555	GACAAA	2	12	168125	168136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896016
52	NC_015555	TATTGA	2	12	171393	171404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333896019
53	NC_015555	TAAAAA	2	12	172197	172208	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333896021
54	NC_015555	ATAGAC	2	12	172867	172878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896021
55	NC_015555	TGAATA	2	12	179523	179534	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896027
56	NC_015555	CTGAAG	2	12	180105	180116	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896027
57	NC_015555	GCGGTG	2	12	184084	184095	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333896031
58	NC_015555	AGAGGT	2	12	184254	184265	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333896031
59	NC_015555	AAAGAG	2	12	186716	186727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896033
60	NC_015555	CTCATT	2	12	191960	191971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333896039
61	NC_015555	TGAAAT	2	12	192396	192407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896039
62	NC_015555	CAAATG	2	12	193836	193847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896040
63	NC_015555	ATTTTT	2	12	194852	194863	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	333896041
64	NC_015555	GGCTGT	2	12	195797	195808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	333896041
65	NC_015555	ATGTGT	2	12	197129	197140	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333896042
66	NC_015555	TGGTGA	2	12	203075	203086	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333896048
67	NC_015555	TGGACT	2	12	203094	203105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896048
68	NC_015555	TATAGA	2	12	204751	204762	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896051
69	NC_015555	AGATAA	2	12	207907	207918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896052
70	NC_015555	TAAAAT	2	12	208977	208988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896053
71	NC_015555	GACAAT	2	12	211543	211554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896056
72	NC_015555	CAATGC	2	12	216046	216057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333896060
73	NC_015555	TAAAAG	2	12	222593	222604	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896064
74	NC_015555	TAGATG	2	12	225860	225871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896066
75	NC_015555	AGCTTT	2	12	226560	226571	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333896068
76	NC_015555	ATCTTT	2	12	227261	227272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333896068
77	NC_015555	TACTGT	2	12	231806	231817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	333896072
78	NC_015555	ATATGA	2	12	232487	232498	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896073
79	NC_015555	TTGTTT	2	12	235480	235491	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896075
80	NC_015555	CTTTGT	2	12	237226	237237	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333896076
81	NC_015555	AGCTTA	2	12	238153	238164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896077
82	NC_015555	AAATAT	2	12	240771	240782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896080
83	NC_015555	TTAGCA	2	12	242045	242056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896083
84	NC_015555	GTTTTT	2	12	242070	242081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333896083
85	NC_015555	CCAAAA	2	12	244821	244832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896086
86	NC_015555	TATAGG	2	12	247256	247267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896088
87	NC_015555	CTATGA	2	12	250551	250562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896090
88	NC_015555	TGTGCT	2	12	258476	258487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333896095
89	NC_015555	GCTGAA	2	12	258681	258692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333896095
90	NC_015555	TACTTT	2	12	259059	259070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333896096
91	NC_015555	ACCTAT	2	12	260178	260189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896098
92	NC_015555	TTCACC	2	12	261571	261582	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333896099
93	NC_015555	GTTTTG	2	12	268878	268889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896108
94	NC_015555	TAAGCT	2	12	272684	272695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896111
95	NC_015555	ATTGCC	2	12	272916	272927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333896111
96	NC_015555	GTATCA	2	12	278218	278229	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333896115
97	NC_015555	TGGAAG	2	12	284842	284853	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333896121
98	NC_015555	TTAAAA	2	12	298767	298778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896137
99	NC_015555	CACCAT	2	12	299073	299084	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333896138
100	NC_015555	CAAAGA	2	12	301096	301107	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896141
101	NC_015555	ATGAAA	2	12	310956	310967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896148
102	NC_015555	GTGATT	2	12	317022	317033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333896152
103	NC_015555	AATACA	2	12	319734	319745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	333896156
104	NC_015555	TACAAG	2	12	328405	328416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333896163
105	NC_015555	AGGTGC	2	12	331870	331881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333896166
106	NC_015555	ATGAAT	2	12	336579	336590	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896172
107	NC_015555	GAAGCA	2	12	336923	336934	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333896172
108	NC_015555	ATTGAA	2	12	338790	338801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896176
109	NC_015555	AGTTTT	2	12	339081	339092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333896177
110	NC_015555	TGAAGT	2	12	341912	341923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896180
111	NC_015555	AAGATT	2	12	347840	347851	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896181
112	NC_015555	TGCAGT	2	12	349841	349852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333896185
113	NC_015555	TGGAAG	2	12	351349	351360	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333896185
114	NC_015555	ATGAAT	2	12	352110	352121	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896186
115	NC_015555	GAAGCA	2	12	352454	352465	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	333896186
116	NC_015555	ATAGAA	2	12	356619	356630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333896194
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228	NC_015555	TTTACA	2	12	687442	687453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	333896491
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345	NC_015555	ATGAAG	2	12	1000999	1001010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333896779
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452	NC_015555	AAAAGC	2	12	1284820	1284831	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333897053
453	NC_015555	ATTAAA	2	12	1285935	1285946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333897054
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