MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 2058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	TTGAT	2	10	3761	3770	20 %	60 %	20 %	0 %	333895866
2	NC_015555	TTTAA	2	10	5789	5798	40 %	60 %	0 %	0 %	333895869
3	NC_015555	TAAAA	2	10	6638	6647	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015555	AAGGG	2	10	7705	7714	40 %	0 %	60 %	0 %	333895870
5	NC_015555	ACTTC	2	10	7961	7970	20 %	40 %	0 %	40 %	333895870
6	NC_015555	AAGGC	2	10	8123	8132	40 %	0 %	40 %	20 %	333895870
7	NC_015555	AAGGT	2	10	10366	10375	40 %	20 %	40 %	0 %	333895871
8	NC_015555	GAAAG	2	10	13145	13154	60 %	0 %	40 %	0 %	333895875
9	NC_015555	ACGAC	2	10	23118	23127	40 %	0 %	20 %	40 %	333895883
10	NC_015555	GATGT	2	10	28656	28665	20 %	40 %	40 %	0 %	333895889
11	NC_015555	TTTTA	2	10	31154	31163	20 %	80 %	0 %	0 %	333895891
12	NC_015555	CAAGC	2	10	31643	31652	40 %	0 %	20 %	40 %	333895891
13	NC_015555	TTACA	2	10	35835	35844	40 %	40 %	0 %	20 %	333895894
14	NC_015555	AAAAG	2	10	36040	36049	80 %	0 %	20 %	0 %	333895894
15	NC_015555	TGAAA	2	10	36292	36301	60 %	20 %	20 %	0 %	333895894
16	NC_015555	AAATT	2	10	37144	37153	60 %	40 %	0 %	0 %	333895895
17	NC_015555	GAAAA	2	10	38687	38696	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015555	AGTAA	2	10	38788	38797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015555	TTTAA	2	10	38898	38907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015555	AATTT	2	10	39656	39665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015555	AGTAA	2	10	39673	39682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015555	AATCA	2	10	41886	41895	60 %	20 %	0 %	20 %	333895897
23	NC_015555	AATAG	2	10	43387	43396	60 %	20 %	20 %	0 %	333895898
24	NC_015555	TTAAG	2	10	45344	45353	40 %	40 %	20 %	0 %	333895901
25	NC_015555	ATTAT	2	10	46201	46210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015555	ATACA	2	10	47195	47204	60 %	20 %	0 %	20 %	333895902
27	NC_015555	GATGG	2	10	48673	48682	20 %	20 %	60 %	0 %	333895904
28	NC_015555	GAAAA	2	10	49380	49389	80 %	0 %	20 %	0 %	333895904
29	NC_015555	AAAAT	2	10	50242	50251	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015555	TTGCA	2	10	51694	51703	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015555	CCGAG	2	10	51804	51813	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_015555	GACGA	2	10	56344	56353	40 %	0 %	40 %	20 %	333895909
33	NC_015555	TATAA	2	10	56767	56776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015555	TAATA	2	10	59218	59227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015555	AGAAA	2	10	60314	60323	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015555	AGGAG	2	10	60908	60917	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015555	TCGTG	2	10	61318	61327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015555	AAAGA	2	10	61810	61819	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015555	ATAAA	2	10	62007	62016	80 %	20 %	0 %	0 %	333895916
40	NC_015555	GGGAG	2	10	62694	62703	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015555	ACAGT	2	10	63486	63495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015555	AAAGA	2	10	64176	64185	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015555	GACAG	2	10	64556	64565	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015555	AAGAT	2	10	65285	65294	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015555	TGCTT	2	10	66476	66485	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_015555	ATTAC	2	10	67931	67940	40 %	40 %	0 %	20 %	333895919
47	NC_015555	GTCAG	2	10	69243	69252	20 %	20 %	40 %	20 %	333895920
48	NC_015555	ACAGA	2	10	72349	72358	60 %	0 %	20 %	20 %	333895923
49	NC_015555	AAATG	2	10	72369	72378	60 %	20 %	20 %	0 %	333895923
50	NC_015555	TTTCG	2	10	74518	74527	0 %	60 %	20 %	20 %	333895924
51	NC_015555	AAATT	2	10	75011	75020	60 %	40 %	0 %	0 %	333895925
52	NC_015555	GTGTA	2	10	76154	76163	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015555	TTTAC	2	10	78382	78391	20 %	60 %	0 %	20 %	333895928
54	NC_015555	AGAAA	2	10	79539	79548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015555	AGGAG	2	10	80133	80142	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015555	TCGTG	2	10	80543	80552	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015555	AAAGA	2	10	81035	81044	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015555	ATAAA	2	10	81232	81241	80 %	20 %	0 %	0 %	333895930
59	NC_015555	GGGAG	2	10	81920	81929	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015555	ACAGT	2	10	82712	82721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015555	AAAGA	2	10	83402	83411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015555	GACAG	2	10	83783	83792	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015555	AAGAT	2	10	84512	84521	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015555	GTCAA	2	10	85807	85816	40 %	20 %	20 %	20 %	333895931
65	NC_015555	GATAA	2	10	86391	86400	60 %	20 %	20 %	0 %	333895932
66	NC_015555	CATAT	2	10	87030	87039	40 %	40 %	0 %	20 %	333895934
67	NC_015555	GATAG	2	10	87677	87686	40 %	20 %	40 %	0 %	333895934
68	NC_015555	AATAA	2	10	89390	89399	80 %	20 %	0 %	0 %	333895937
69	NC_015555	TAAAG	2	10	91525	91534	60 %	20 %	20 %	0 %	333895939
70	NC_015555	TTGAA	2	10	95476	95485	40 %	40 %	20 %	0 %	333895943
71	NC_015555	TGCTG	2	10	96617	96626	0 %	40 %	40 %	20 %	333895944
72	NC_015555	TATAC	2	10	98513	98522	40 %	40 %	0 %	20 %	333895946
73	NC_015555	TTCAC	2	10	98680	98689	20 %	40 %	0 %	40 %	333895946
74	NC_015555	ATGGG	2	10	99522	99531	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015555	TTTAC	2	10	101738	101747	20 %	60 %	0 %	20 %	333895950
76	NC_015555	GACGA	2	10	103722	103731	40 %	0 %	40 %	20 %	333895951
77	NC_015555	ATTCA	2	10	104805	104814	40 %	40 %	0 %	20 %	333895952
78	NC_015555	GTATC	2	10	105090	105099	20 %	40 %	20 %	20 %	333895953
79	NC_015555	TAAAA	2	10	106351	106360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015555	TAAAA	2	10	107887	107896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015555	ATGAA	2	10	109163	109172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015555	AAAGA	2	10	110322	110331	80 %	0 %	20 %	0 %	333895959
83	NC_015555	TAATC	2	10	110538	110547	40 %	40 %	0 %	20 %	333895959
84	NC_015555	TATGA	2	10	111100	111109	40 %	40 %	20 %	0 %	333895959
85	NC_015555	ATTTA	2	10	114531	114540	40 %	60 %	0 %	0 %	333895964
86	NC_015555	TATGA	2	10	119643	119652	40 %	40 %	20 %	0 %	333895969
87	NC_015555	TTAGG	2	10	119880	119889	20 %	40 %	40 %	0 %	333895969
88	NC_015555	AGTGA	2	10	119941	119950	40 %	20 %	40 %	0 %	333895970
89	NC_015555	GAGTT	2	10	120152	120161	20 %	40 %	40 %	0 %	333895970
90	NC_015555	GAAAG	2	10	125192	125201	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015555	CGGTG	2	10	126119	126128	0 %	20 %	60 %	20 %	333895977
92	NC_015555	CGCAT	2	10	129878	129887	20 %	20 %	20 %	40 %	333895981
93	NC_015555	AGGAA	2	10	134752	134761	60 %	0 %	40 %	0 %	333895984
94	NC_015555	CTTTG	2	10	135654	135663	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015555	ATCGT	2	10	135939	135948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015555	TAAAA	2	10	137099	137108	80 %	20 %	0 %	0 %	333895986
97	NC_015555	TGAAT	2	10	137781	137790	40 %	40 %	20 %	0 %	333895987
98	NC_015555	AAATT	2	10	142526	142535	60 %	40 %	0 %	0 %	333895991
99	NC_015555	TGAAT	2	10	144558	144567	40 %	40 %	20 %	0 %	333895992
100	NC_015555	ATCCC	2	10	145890	145899	20 %	20 %	0 %	60 %	333895993
101	NC_015555	GAAAA	2	10	146501	146510	80 %	0 %	20 %	0 %	333895995
102	NC_015555	CTTAA	2	10	149275	149284	40 %	40 %	0 %	20 %	333895999
103	NC_015555	ATGAG	2	10	149507	149516	40 %	20 %	40 %	0 %	333895999
104	NC_015555	ATGAA	2	10	152499	152508	60 %	20 %	20 %	0 %	333896001
105	NC_015555	AGACA	2	10	155782	155791	60 %	0 %	20 %	20 %	333896005
106	NC_015555	GAAGA	2	10	156328	156337	60 %	0 %	40 %	0 %	333896005
107	NC_015555	TTGAT	2	10	156686	156695	20 %	60 %	20 %	0 %	333896006
108	NC_015555	AAAGA	2	10	157331	157340	80 %	0 %	20 %	0 %	333896007
109	NC_015555	AGACG	2	10	158088	158097	40 %	0 %	40 %	20 %	333896007
110	NC_015555	CTAAT	2	10	158316	158325	40 %	40 %	0 %	20 %	333896007
111	NC_015555	TAAAA	2	10	158630	158639	80 %	20 %	0 %	0 %	333896007
112	NC_015555	AACAA	2	10	158888	158897	80 %	0 %	0 %	20 %	333896008
113	NC_015555	GTGAT	2	10	160061	160070	20 %	40 %	40 %	0 %	333896008
114	NC_015555	AGGGA	2	10	160806	160815	40 %	0 %	60 %	0 %	333896009
115	NC_015555	AGTTG	2	10	161945	161954	20 %	40 %	40 %	0 %	333896011
116	NC_015555	TAAAA	2	10	162041	162050	80 %	20 %	0 %	0 %	333896011
117	NC_015555	GCAGA	2	10	162064	162073	40 %	0 %	40 %	20 %	333896011
118	NC_015555	TATTT	2	10	167449	167458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015555	AAAAG	2	10	168313	168322	80 %	0 %	20 %	0 %	333896016
120	NC_015555	TTTAT	2	10	169474	169483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015555	TTGGG	2	10	172329	172338	0 %	40 %	60 %	0 %	333896021
122	NC_015555	CTTTA	2	10	172799	172808	20 %	60 %	0 %	20 %	333896021
123	NC_015555	AATAA	2	10	175402	175411	80 %	20 %	0 %	0 %	333896023
124	NC_015555	CATAC	2	10	176360	176369	40 %	20 %	0 %	40 %	333896024
125	NC_015555	GGGAA	2	10	176854	176863	40 %	0 %	60 %	0 %	333896025
126	NC_015555	CTATT	2	10	178270	178279	20 %	60 %	0 %	20 %	333896026
127	NC_015555	AATTT	2	10	179952	179961	40 %	60 %	0 %	0 %	333896027
128	NC_015555	GCAAA	2	10	180118	180127	60 %	0 %	20 %	20 %	333896027
129	NC_015555	CTAAA	2	10	180665	180674	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015555	TGAAT	2	10	181103	181112	40 %	40 %	20 %	0 %	333896029
131	NC_015555	TAAGA	2	10	182656	182665	60 %	20 %	20 %	0 %	333896030
132	NC_015555	CATAT	2	10	182948	182957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015555	ATGGA	2	10	183985	183994	40 %	20 %	40 %	0 %	333896031
134	NC_015555	GATTA	2	10	184057	184066	40 %	40 %	20 %	0 %	333896031
135	NC_015555	AGAAT	2	10	185286	185295	60 %	20 %	20 %	0 %	333896032
136	NC_015555	GCTTG	2	10	185701	185710	0 %	40 %	40 %	20 %	333896033
137	NC_015555	ATTAT	2	10	185828	185837	40 %	60 %	0 %	0 %	333896033
138	NC_015555	ACAAT	2	10	188251	188260	60 %	20 %	0 %	20 %	333896035
139	NC_015555	AATAT	2	10	192511	192520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015555	GATTT	2	10	192865	192874	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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