MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 6313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015555	ATGC	2	8	646	653	25 %	25 %	25 %	25 %	333895863
2	NC_015555	AATA	2	8	772	779	75 %	25 %	0 %	0 %	333895863
3	NC_015555	CAAA	2	8	1205	1212	75 %	0 %	0 %	25 %	333895863
4	NC_015555	TTAT	3	12	1677	1688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015555	TAAA	2	8	1773	1780	75 %	25 %	0 %	0 %	333895864
6	NC_015555	TAGA	2	8	2541	2548	50 %	25 %	25 %	0 %	333895864
7	NC_015555	TAAA	2	8	3064	3071	75 %	25 %	0 %	0 %	333895865
8	NC_015555	GTTT	2	8	3286	3293	0 %	75 %	25 %	0 %	333895866
9	NC_015555	TACT	2	8	3440	3447	25 %	50 %	0 %	25 %	333895866
10	NC_015555	TAAA	2	8	4088	4095	75 %	25 %	0 %	0 %	333895866
11	NC_015555	TTTC	2	8	4566	4573	0 %	75 %	0 %	25 %	333895868
12	NC_015555	TCCG	2	8	4886	4893	0 %	25 %	25 %	50 %	333895868
13	NC_015555	GTAT	2	8	6753	6760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015555	GACA	2	8	7000	7007	50 %	0 %	25 %	25 %	333895870
15	NC_015555	TACG	2	8	7504	7511	25 %	25 %	25 %	25 %	333895870
16	NC_015555	AATG	2	8	8840	8847	50 %	25 %	25 %	0 %	333895871
17	NC_015555	ATAA	2	8	9099	9106	75 %	25 %	0 %	0 %	333895871
18	NC_015555	GTTG	2	8	9497	9504	0 %	50 %	50 %	0 %	333895871
19	NC_015555	AAGA	2	8	10086	10093	75 %	0 %	25 %	0 %	333895871
20	NC_015555	AGAT	2	8	10450	10457	50 %	25 %	25 %	0 %	333895871
21	NC_015555	ATTT	2	8	11124	11131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015555	AGAT	2	8	11152	11159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015555	TTGG	2	8	11267	11274	0 %	50 %	50 %	0 %	333895872
24	NC_015555	TGTC	2	8	11945	11952	0 %	50 %	25 %	25 %	333895873
25	NC_015555	GAAG	2	8	13245	13252	50 %	0 %	50 %	0 %	333895875
26	NC_015555	AAAG	2	8	13371	13378	75 %	0 %	25 %	0 %	333895875
27	NC_015555	TGAA	2	8	13936	13943	50 %	25 %	25 %	0 %	333895875
28	NC_015555	ATAG	2	8	14355	14362	50 %	25 %	25 %	0 %	333895876
29	NC_015555	CAAA	2	8	14962	14969	75 %	0 %	0 %	25 %	333895876
30	NC_015555	CAAA	2	8	15498	15505	75 %	0 %	0 %	25 %	333895877
31	NC_015555	AGAT	2	8	16161	16168	50 %	25 %	25 %	0 %	333895877
32	NC_015555	GGAA	2	8	16555	16562	50 %	0 %	50 %	0 %	333895878
33	NC_015555	GATT	2	8	17485	17492	25 %	50 %	25 %	0 %	333895879
34	NC_015555	AAGT	2	8	17655	17662	50 %	25 %	25 %	0 %	333895879
35	NC_015555	CAGC	2	8	17829	17836	25 %	0 %	25 %	50 %	333895879
36	NC_015555	TGAT	2	8	17967	17974	25 %	50 %	25 %	0 %	333895879
37	NC_015555	ATAA	2	8	18195	18202	75 %	25 %	0 %	0 %	333895880
38	NC_015555	AAAT	2	8	18985	18992	75 %	25 %	0 %	0 %	333895880
39	NC_015555	AAAT	2	8	21835	21842	75 %	25 %	0 %	0 %	333895882
40	NC_015555	TGAA	2	8	22081	22088	50 %	25 %	25 %	0 %	333895882
41	NC_015555	GGTA	2	8	22253	22260	25 %	25 %	50 %	0 %	333895882
42	NC_015555	GATA	2	8	22535	22542	50 %	25 %	25 %	0 %	333895882
43	NC_015555	AGAT	2	8	22711	22718	50 %	25 %	25 %	0 %	333895882
44	NC_015555	ATTT	2	8	22941	22948	25 %	75 %	0 %	0 %	333895883
45	NC_015555	TAGG	2	8	23043	23050	25 %	25 %	50 %	0 %	333895883
46	NC_015555	TGGA	2	8	23193	23200	25 %	25 %	50 %	0 %	333895883
47	NC_015555	TTCA	2	8	24161	24168	25 %	50 %	0 %	25 %	333895884
48	NC_015555	TGGT	2	8	24473	24480	0 %	50 %	50 %	0 %	333895884
49	NC_015555	TCAA	2	8	24529	24536	50 %	25 %	0 %	25 %	333895884
50	NC_015555	AAAG	2	8	24564	24571	75 %	0 %	25 %	0 %	333895884
51	NC_015555	ATCC	2	8	25739	25746	25 %	25 %	0 %	50 %	333895886
52	NC_015555	CAAT	2	8	25977	25984	50 %	25 %	0 %	25 %	333895886
53	NC_015555	AATA	2	8	26265	26272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015555	TATT	2	8	26294	26301	25 %	75 %	0 %	0 %	333895887
55	NC_015555	TACT	2	8	26642	26649	25 %	50 %	0 %	25 %	333895888
56	NC_015555	GCTT	2	8	26655	26662	0 %	50 %	25 %	25 %	333895888
57	NC_015555	GTAT	2	8	27210	27217	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015555	GAAA	2	8	27631	27638	75 %	0 %	25 %	0 %	333895889
59	NC_015555	CATA	2	8	28978	28985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015555	CTTT	2	8	29590	29597	0 %	75 %	0 %	25 %	333895890
61	NC_015555	ATGA	2	8	29598	29605	50 %	25 %	25 %	0 %	333895890
62	NC_015555	TATT	2	8	30287	30294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015555	TTTG	2	8	30398	30405	0 %	75 %	25 %	0 %	333895891
64	NC_015555	TTAT	2	8	30730	30737	25 %	75 %	0 %	0 %	333895891
65	NC_015555	CAGA	2	8	30962	30969	50 %	0 %	25 %	25 %	333895891
66	NC_015555	ACAA	2	8	31885	31892	75 %	0 %	0 %	25 %	333895891
67	NC_015555	CATA	2	8	32084	32091	50 %	25 %	0 %	25 %	333895891
68	NC_015555	GCCA	2	8	32559	32566	25 %	0 %	25 %	50 %	333895891
69	NC_015555	GATC	2	8	32688	32695	25 %	25 %	25 %	25 %	333895891
70	NC_015555	CTAT	2	8	32807	32814	25 %	50 %	0 %	25 %	333895891
71	NC_015555	AATG	2	8	33024	33031	50 %	25 %	25 %	0 %	333895891
72	NC_015555	TAAT	2	8	33142	33149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015555	GAAA	2	8	33451	33458	75 %	0 %	25 %	0 %	333895892
74	NC_015555	CAAA	2	8	33950	33957	75 %	0 %	0 %	25 %	333895893
75	NC_015555	AGCA	2	8	34129	34136	50 %	0 %	25 %	25 %	333895893
76	NC_015555	AGCA	2	8	34279	34286	50 %	0 %	25 %	25 %	333895893
77	NC_015555	TAAA	2	8	34983	34990	75 %	25 %	0 %	0 %	333895894
78	NC_015555	GAAA	2	8	35563	35570	75 %	0 %	25 %	0 %	333895894
79	NC_015555	TGAT	2	8	36099	36106	25 %	50 %	25 %	0 %	333895894
80	NC_015555	ATCA	2	8	37481	37488	50 %	25 %	0 %	25 %	333895895
81	NC_015555	TATC	2	8	37755	37762	25 %	50 %	0 %	25 %	333895895
82	NC_015555	GATA	2	8	37884	37891	50 %	25 %	25 %	0 %	333895895
83	NC_015555	ATAG	2	8	38092	38099	50 %	25 %	25 %	0 %	333895895
84	NC_015555	GAGC	2	8	38227	38234	25 %	0 %	50 %	25 %	333895895
85	NC_015555	AATT	3	12	38348	38359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015555	TCCT	2	8	39162	39169	0 %	50 %	0 %	50 %	333895896
87	NC_015555	TTTC	2	8	39243	39250	0 %	75 %	0 %	25 %	333895896
88	NC_015555	TTTC	2	8	39293	39300	0 %	75 %	0 %	25 %	333895896
89	NC_015555	TTGT	2	8	39332	39339	0 %	75 %	25 %	0 %	333895896
90	NC_015555	TAAA	2	8	40179	40186	75 %	25 %	0 %	0 %	333895897
91	NC_015555	GAAA	2	8	40253	40260	75 %	0 %	25 %	0 %	333895897
92	NC_015555	AGCA	2	8	40408	40415	50 %	0 %	25 %	25 %	333895897
93	NC_015555	GCTG	2	8	40774	40781	0 %	25 %	50 %	25 %	333895897
94	NC_015555	AGCA	2	8	41307	41314	50 %	0 %	25 %	25 %	333895897
95	NC_015555	TAAA	2	8	41397	41404	75 %	25 %	0 %	0 %	333895897
96	NC_015555	ATTA	2	8	42088	42095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015555	AGAA	2	8	42333	42340	75 %	0 %	25 %	0 %	333895898
98	NC_015555	TAAC	2	8	42713	42720	50 %	25 %	0 %	25 %	333895898
99	NC_015555	ATGA	2	8	43039	43046	50 %	25 %	25 %	0 %	333895898
100	NC_015555	AGAT	2	8	43092	43099	50 %	25 %	25 %	0 %	333895898
101	NC_015555	GAAA	2	8	43101	43108	75 %	0 %	25 %	0 %	333895898
102	NC_015555	ACAA	2	8	43178	43185	75 %	0 %	0 %	25 %	333895898
103	NC_015555	GATA	2	8	43200	43207	50 %	25 %	25 %	0 %	333895898
104	NC_015555	ATGG	2	8	43864	43871	25 %	25 %	50 %	0 %	333895899
105	NC_015555	GGTG	2	8	44407	44414	0 %	25 %	75 %	0 %	333895899
106	NC_015555	GAAA	2	8	45618	45625	75 %	0 %	25 %	0 %	333895901
107	NC_015555	TGAT	2	8	45917	45924	25 %	50 %	25 %	0 %	333895901
108	NC_015555	TTGA	2	8	46276	46283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015555	ACAT	2	8	46473	46480	50 %	25 %	0 %	25 %	333895902
110	NC_015555	TAAG	2	8	46528	46535	50 %	25 %	25 %	0 %	333895902
111	NC_015555	ACTG	2	8	46538	46545	25 %	25 %	25 %	25 %	333895902
112	NC_015555	AAAG	2	8	46554	46561	75 %	0 %	25 %	0 %	333895902
113	NC_015555	AATA	2	8	46628	46635	75 %	25 %	0 %	0 %	333895902
114	NC_015555	GAAA	2	8	46931	46938	75 %	0 %	25 %	0 %	333895902
115	NC_015555	ATAA	2	8	47268	47275	75 %	25 %	0 %	0 %	333895902
116	NC_015555	TATT	2	8	47900	47907	25 %	75 %	0 %	0 %	333895903
117	NC_015555	GAAG	2	8	48122	48129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015555	AAGG	2	8	48402	48409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015555	TCAA	2	8	48494	48501	50 %	25 %	0 %	25 %	333895904
120	NC_015555	GGAA	2	8	48744	48751	50 %	0 %	50 %	0 %	333895904
121	NC_015555	AGAC	2	8	48834	48841	50 %	0 %	25 %	25 %	333895904
122	NC_015555	AGAA	2	8	49218	49225	75 %	0 %	25 %	0 %	333895904
123	NC_015555	TAGA	2	8	49367	49374	50 %	25 %	25 %	0 %	333895904
124	NC_015555	AAAT	2	8	49782	49789	75 %	25 %	0 %	0 %	333895904
125	NC_015555	GTAC	2	8	49874	49881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015555	TTGT	2	8	49937	49944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015555	GAAT	2	8	50057	50064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015555	TGGA	2	8	50460	50467	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015555	TGTA	2	8	51262	51269	25 %	50 %	25 %	0 %	333895905
130	NC_015555	TAAA	2	8	51319	51326	75 %	25 %	0 %	0 %	333895905
131	NC_015555	TAAG	2	8	51837	51844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015555	GGAA	2	8	51899	51906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015555	ATAC	2	8	52043	52050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015555	GTTT	2	8	52182	52189	0 %	75 %	25 %	0 %	333895906
135	NC_015555	ATTC	2	8	53862	53869	25 %	50 %	0 %	25 %	333895906
136	NC_015555	ATTT	2	8	54560	54567	25 %	75 %	0 %	0 %	333895907
137	NC_015555	AAAT	2	8	54691	54698	75 %	25 %	0 %	0 %	333895907
138	NC_015555	AGAT	2	8	54904	54911	50 %	25 %	25 %	0 %	333895907
139	NC_015555	TAGA	2	8	55210	55217	50 %	25 %	25 %	0 %	333895907
140	NC_015555	GATT	2	8	55698	55705	25 %	50 %	25 %	0 %	333895907
141	NC_015555	ATAA	2	8	55732	55739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_015555	GATC	2	8	55955	55962	25 %	25 %	25 %	25 %	333895908
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