MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015554	ACGCTT	2	12	43	54	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015554	TTACAC	2	12	7235	7246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015554	TTTAAG	2	12	15111	15122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015554	TGAAAT	2	12	39271	39282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015554	AGCGTT	2	12	47782	47793	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015554	TGAAAT	2	12	49301	49312	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015554	AGTTAT	2	12	63305	63316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015554	TTTGAA	2	12	79653	79664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015554	TTTTCT	2	12	96540	96551	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015554	TTCTAC	2	12	111745	111756	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015554	AAATTA	2	12	124913	124924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015554	GTATAG	2	12	147161	147172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015554	ATTAAA	2	12	189602	189613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015554	AGCGTT	2	12	195290	195301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015554	TGAAAT	2	12	196809	196820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015554	AAAAAC	2	12	223698	223709	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015554	ATAATT	2	12	277195	277206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015554	CATCGT	2	12	278142	278153	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015554	ATTCTA	2	12	291245	291256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015554	ATGTAA	2	12	298402	298413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015554	TTAATT	2	12	298452	298463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015554	GTTTGA	2	12	318032	318043	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015554	TTTCCA	2	12	322161	322172	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015554	AAAAGA	2	12	326659	326670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015554	TCAGAT	2	12	328249	328260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015554	GGTATA	2	12	330140	330151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015554	AGTATT	2	12	560882	560893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015554	CCTTCA	3	18	597708	597725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015554	ATTAAC	2	12	613375	613386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015554	TTATTT	2	12	614671	614682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015554	CGCAAA	2	12	661367	661378	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015554	ATAACA	2	12	661406	661417	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015554	TCGTGG	2	12	670853	670864	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015554	AATTGC	2	12	674505	674516	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015554	AAAAGG	2	12	684002	684013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015554	ACATTT	2	12	691871	691882	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015554	TAAAAT	2	12	699207	699218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015554	GTTTTT	2	12	726916	726927	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015554	TGGCCA	2	12	726961	726972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015554	TGAATG	2	12	774573	774584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015554	TTTGTG	2	12	774592	774603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015554	ATTAGC	2	12	802671	802682	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015554	ATTTAA	2	12	810673	810684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015554	ACAATA	2	12	831709	831720	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015554	GCCGGG	2	12	878262	878273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015554	ATTGCA	2	12	903212	903223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015554	AGCTTT	2	12	921721	921732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_015554	CTCAAC	2	12	950697	950708	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015554	AATGAA	2	12	992075	992086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015554	CTTTAT	2	12	1001257	1001268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015554	AGCGTT	2	12	1045160	1045171	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015554	TGAAAT	2	12	1046681	1046692	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015554	ATTTTT	2	12	1066263	1066274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015554	AACAAA	3	18	1087995	1088012	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015554	AATAAC	2	12	1107467	1107478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015554	ATGGCG	2	12	1118131	1118142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015554	AAGTAA	2	12	1171847	1171858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015554	ATTGGT	2	12	1200049	1200060	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015554	ATGAAT	2	12	1222847	1222858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015554	TGGCAA	2	12	1232072	1232083	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015554	TATACA	2	12	1235096	1235107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015554	GTTATC	2	12	1263452	1263463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_015554	TAATGC	2	12	1269818	1269829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015554	TTTTTA	2	12	1286569	1286580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015554	AAGCTT	2	12	1303276	1303287	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015554	GTTTTT	2	12	1309972	1309983	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015554	TTCATT	2	12	1351222	1351233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015554	ATTTAT	2	12	1361319	1361330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015554	GTTTTT	2	12	1371084	1371095	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015554	AGCTAG	2	12	1472399	1472410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015554	CTATAA	2	12	1522126	1522137	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015554	TAAATC	2	12	1562083	1562094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015554	ATGAGC	2	12	1578439	1578450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015554	ATAAAA	2	12	1610459	1610470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015554	TTTAGT	2	12	1664234	1664245	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015554	GTATTT	2	12	1682957	1682968	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015554	GTTTAC	2	12	1749693	1749704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015554	TTAAAA	2	12	1758944	1758955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015554	AAATTC	2	12	1776713	1776724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_015554	TATAAT	2	12	1842102	1842113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015554	TGTATT	2	12	1846760	1846771	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015554	TCAGTG	2	12	1872253	1872264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015554	TAAATT	2	12	1884627	1884638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015554	TTTTTA	2	12	1944907	1944918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015554	TTTTTA	2	12	1954370	1954381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015554	TGAAAC	2	12	1986466	1986477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015554	TATAAA	2	12	1994580	1994591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015554	CTCTTA	2	12	1994722	1994733	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015554	TGCTCA	3	18	2000018	2000035	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015554	ATAACA	2	12	2013813	2013824	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015554	TTGCCC	2	12	2040565	2040576	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015554	GTTAAC	2	12	2048285	2048296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015554	TTAGTT	2	12	2076668	2076679	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015554	TTTTTA	2	12	2092326	2092337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015554	AAGCTA	2	12	2092342	2092353	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015554	ATTTTT	2	12	2099987	2099998	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015554	GGGTTT	2	12	2159113	2159124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015554	TTCACA	2	12	2178175	2178186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015554	ATTTAT	2	12	2209188	2209199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015554	GAAAAA	2	12	2251125	2251136	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015554	TATAGG	2	12	2268181	2268192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015554	AAATAC	2	12	2296997	2297008	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015554	TTAACG	2	12	2298651	2298662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015554	ACTGAA	2	12	2352159	2352170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_015554	ATAACT	2	12	2368069	2368080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015554	AACTTA	2	12	2393260	2393271	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015554	TAAAGC	2	12	2508583	2508594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015554	TAACTT	2	12	2513563	2513574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015554	TTTTAT	2	12	2525999	2526010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015554	ATTGTT	2	12	2536502	2536513	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015554	ACGTTG	2	12	2548728	2548739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015554	ATAAAC	2	12	2585549	2585560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015554	AATATA	2	12	2595479	2595490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015554	ATCGGC	2	12	2627476	2627487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015554	CTTCGT	2	12	2629383	2629394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015554	TTTAAT	2	12	2640318	2640329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015554	ACAATT	2	12	2660414	2660425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015554	CTTTTA	3	18	2675225	2675242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_015554	CCAATA	2	12	2677803	2677814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015554	CCTTTT	2	12	2727840	2727851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015554	TAATAT	2	12	2735899	2735910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015554	ATTTTA	2	12	2809924	2809935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015554	GGGGAG	2	12	2810614	2810625	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015554	GTATGG	2	12	2860336	2860347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015554	TCAAAG	2	12	2871457	2871468	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015554	TCGACA	2	12	2920539	2920550	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015554	TTTTTA	2	12	3019721	3019732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.