MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 1668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015554	CTTCAA	2	12	4413725	4413736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895341
1502	NC_015554	CATCTA	2	12	4420064	4420075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895344
1503	NC_015554	CATGTA	2	12	4421064	4421075	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895345
1504	NC_015554	AACTTC	2	12	4425088	4425099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895346
1505	NC_015554	CAGCTA	2	12	4425330	4425341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895346
1506	NC_015554	CCGTTT	2	12	4427532	4427543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_015554	GGCTTA	2	12	4428359	4428370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895351
1508	NC_015554	CACTAC	2	12	4428964	4428975	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333895352
1509	NC_015554	GTGCTT	2	12	4431517	4431528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333895354
1510	NC_015554	GGATAC	2	12	4432747	4432758	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333895356
1511	NC_015554	TGATGG	2	12	4433992	4434003	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333895356
1512	NC_015554	GCTTTT	2	12	4435278	4435289	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333895358
1513	NC_015554	ATATGG	2	12	4440784	4440795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015554	TTTTAT	2	12	4442026	4442037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015554	AATGGC	2	12	4443792	4443803	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333895367
1516	NC_015554	CCCAAT	2	12	4444652	4444663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333895368
1517	NC_015554	AATACT	2	12	4444965	4444976	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895368
1518	NC_015554	TCAGCA	2	12	4447349	4447360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895369
1519	NC_015554	CCAAAG	2	12	4449175	4449186	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333895371
1520	NC_015554	AGCAAC	2	12	4452613	4452624	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333895373
1521	NC_015554	TACGAA	2	12	4457674	4457685	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895378
1522	NC_015554	TCCGCT	2	12	4462434	4462445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333895383
1523	NC_015554	TCACCT	2	12	4467359	4467370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333895387
1524	NC_015554	TCAGCA	2	12	4467392	4467403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895387
1525	NC_015554	CACGAG	2	12	4468457	4468468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895388
1526	NC_015554	GGCTTC	2	12	4468488	4468499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895388
1527	NC_015554	CACGTC	2	12	4472755	4472766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333895392
1528	NC_015554	TCTATT	2	12	4473518	4473529	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333895392
1529	NC_015554	GCATCA	2	12	4476128	4476139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895395
1530	NC_015554	CTTACC	2	12	4477740	4477751	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	333895396
1531	NC_015554	ACACTA	2	12	4484214	4484225	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333895404
1532	NC_015554	TGTCTT	2	12	4485088	4485099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333895405
1533	NC_015554	TTTCAT	2	12	4495860	4495871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333895416
1534	NC_015554	ACGCTT	2	12	4508960	4508971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333895427
1535	NC_015554	CATTTT	2	12	4513733	4513744	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1536	NC_015554	TGGTTA	2	12	4514471	4514482	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333895431
1537	NC_015554	TAACGC	2	12	4517602	4517613	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895432
1538	NC_015554	AGCGGT	2	12	4518749	4518760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333895434
1539	NC_015554	GCAGTG	2	12	4527407	4527418	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333895442
1540	NC_015554	TGATAC	2	12	4530625	4530636	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895445
1541	NC_015554	TGAAGT	2	12	4537948	4537959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895448
1542	NC_015554	GTACTG	2	12	4543661	4543672	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895450
1543	NC_015554	GGTGTA	2	12	4544344	4544355	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	333895450
1544	NC_015554	GCTTCA	2	12	4547843	4547854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333895452
1545	NC_015554	TTAGCG	2	12	4549902	4549913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895454
1546	NC_015554	TGCGGC	2	12	4552746	4552757	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333895457
1547	NC_015554	TTCACA	2	12	4553243	4553254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895458
1548	NC_015554	TCTTCG	2	12	4559465	4559476	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333895462
1549	NC_015554	CCTGAA	2	12	4562104	4562115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895466
1550	NC_015554	TGCGCT	2	12	4564364	4564375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895470
1551	NC_015554	CGGCAA	2	12	4564956	4564967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895470
1552	NC_015554	AAACGA	2	12	4567097	4567108	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333895472
1553	NC_015554	TAGATG	2	12	4567891	4567902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895473
1554	NC_015554	CTTGCG	2	12	4573375	4573386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333895477
1555	NC_015554	GAAATG	2	12	4575093	4575104	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015554	GTTTTT	2	12	4582861	4582872	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	333895489
1557	NC_015554	GTAATC	2	12	4583157	4583168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895489
1558	NC_015554	CTTATT	2	12	4583480	4583491	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	333895490
1559	NC_015554	CGCGCC	2	12	4588616	4588627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333895497
1560	NC_015554	AAACCT	2	12	4599199	4599210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333895506
1561	NC_015554	TTGCTT	2	12	4599678	4599689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	333895506
1562	NC_015554	GGCTTT	2	12	4607471	4607482	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333895514
1563	NC_015554	GTAGAA	2	12	4611310	4611321	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333895519
1564	NC_015554	CATGAT	2	12	4612699	4612710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895519
1565	NC_015554	GGTGAA	2	12	4613467	4613478	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	333895519
1566	NC_015554	TATCGA	2	12	4614061	4614072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895520
1567	NC_015554	ATCTAG	2	12	4617363	4617374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1568	NC_015554	AGTGGA	2	12	4617519	4617530	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015554	ATTAGC	2	12	4621347	4621358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895527
1570	NC_015554	TCAACC	2	12	4621807	4621818	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	333895527
1571	NC_015554	AGCACA	2	12	4622173	4622184	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	333895527
1572	NC_015554	CTACAT	2	12	4633881	4633892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895537
1573	NC_015554	GATGCC	2	12	4635790	4635801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333895540
1574	NC_015554	TGAAAG	2	12	4637514	4637525	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333895543
1575	NC_015554	TGAAAA	2	12	4637866	4637877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333895543
1576	NC_015554	TCAATA	2	12	4639808	4639819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895545
1577	NC_015554	ACGTTA	2	12	4641369	4641380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895548
1578	NC_015554	TATTTG	2	12	4641383	4641394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	333895548
1579	NC_015554	AATTTA	2	12	4648577	4648588	50 %	50 %	0 %	0 %	333895554
1580	NC_015554	CGGCCG	2	12	4648635	4648646	0 %	0 %	50 %	50 %	333895554
1581	NC_015554	GTATTG	2	12	4650095	4650106	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333895555
1582	NC_015554	ATACAC	2	12	4651461	4651472	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	333895555
1583	NC_015554	TTATGG	2	12	4654266	4654277	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	333895557
1584	NC_015554	TGAAGA	2	12	4654317	4654328	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333895557
1585	NC_015554	AATTAA	2	12	4657947	4657958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015554	GCACAT	2	12	4660242	4660253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895563
1587	NC_015554	AGTTTA	2	12	4661060	4661071	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895564
1588	NC_015554	ACAGTA	2	12	4661940	4661951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	333895566
1589	NC_015554	TCACTT	2	12	4666528	4666539	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	333895570
1590	NC_015554	CCAATG	2	12	4668213	4668224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	333895574
1591	NC_015554	CAGGAT	2	12	4669673	4669684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	333895576
1592	NC_015554	CTGCCG	2	12	4670114	4670125	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	333895576
1593	NC_015554	TTGGCT	2	12	4677476	4677487	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	333895581
1594	NC_015554	TGATAT	2	12	4683968	4683979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	333895590
1595	NC_015554	ATATGA	2	12	4687538	4687549	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015554	GCTTCA	2	12	4688300	4688311	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333895594
1597	NC_015554	GCACAG	2	12	4691191	4691202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333895598
1598	NC_015554	AGTTGC	2	12	4697268	4697279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	333895602
1599	NC_015554	TGAGCC	2	12	4703983	4703994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333895609
1600	NC_015554	TCGCTT	2	12	4715058	4715069	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	333895621
1601	NC_015554	AATAAA	2	12	4716057	4716068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	333895622
1602	NC_015554	AGCACC	2	12	4721002	4721013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	333895627
1603	NC_015554	CAAATT	2	12	4721255	4721266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895627
1604	NC_015554	ATCAAT	2	12	4725346	4725357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	333895631
1605	NC_015554	GCCCCT	2	12	4732373	4732384	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	333895637
1606	NC_015554	AGATTG	2	12	4733957	4733968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333895638
1607	NC_015554	CGTATA	2	12	4734174	4734185	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	333895638
1608	NC_015554	TTTTGG	2	12	4737890	4737901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015554	ACTCTC	2	12	4751378	4751389	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1612	NC_015554	ATGCCG	2	12	4762640	4762651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333895665
1613	NC_015554	ACACTT	2	12	4762751	4762762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333895666
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