MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 2078

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015554	ATAC	2	8	4762064	4762071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_015554	CTAT	2	8	4763573	4763580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_015554	TTGT	2	8	4763923	4763930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_015554	AATA	2	8	4764414	4764421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_015554	CATC	2	8	4764560	4764567	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2006	NC_015554	TTTC	2	8	4764615	4764622	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2007	NC_015554	CCAG	2	8	4764631	4764638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_015554	AATA	2	8	4770839	4770846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015554	GATG	2	8	4774025	4774032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_015554	TTCA	2	8	4775609	4775616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2011	NC_015554	TTTA	2	8	4775762	4775769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_015554	CATT	2	8	4775973	4775980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_015554	CGCT	2	8	4777265	4777272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_015554	ATCA	2	8	4781451	4781458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2015	NC_015554	AAAT	2	8	4781481	4781488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_015554	ATCA	2	8	4786591	4786598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2017	NC_015554	TAAA	2	8	4788308	4788315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_015554	AACT	2	8	4811799	4811806	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2019	NC_015554	ACTG	2	8	4820550	4820557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2020	NC_015554	ATCG	2	8	4823471	4823478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2021	NC_015554	ATCA	2	8	4823489	4823496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2022	NC_015554	ATAA	3	12	4823725	4823736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_015554	ATTA	2	8	4830038	4830045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_015554	TGAT	2	8	4837961	4837968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015554	AAGC	2	8	4838927	4838934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2026	NC_015554	TCAT	2	8	4849211	4849218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2027	NC_015554	GCGA	2	8	4850615	4850622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2028	NC_015554	CAAA	2	8	4864593	4864600	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2029	NC_015554	CTTT	2	8	4864765	4864772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2030	NC_015554	CTGT	2	8	4865424	4865431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2031	NC_015554	TTTA	2	8	4865546	4865553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2032	NC_015554	GATA	2	8	4867728	4867735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_015554	TCAA	2	8	4868472	4868479	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2034	NC_015554	AGCT	2	8	4871068	4871075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2035	NC_015554	AATG	2	8	4875875	4875882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_015554	CTTC	2	8	4876724	4876731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_015554	ATTA	2	8	4878340	4878347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2038	NC_015554	GGTT	2	8	4879325	4879332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_015554	AAAG	2	8	4884453	4884460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_015554	GTTG	2	8	4890459	4890466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2041	NC_015554	CATG	2	8	4891665	4891672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2042	NC_015554	GCTA	2	8	4892110	4892117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2043	NC_015554	AAAC	2	8	4895714	4895721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2044	NC_015554	ACGA	2	8	4907617	4907624	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2045	NC_015554	CCTG	2	8	4910296	4910303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_015554	ATCT	2	8	4911448	4911455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2047	NC_015554	AAAC	2	8	4911533	4911540	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2048	NC_015554	CTTA	2	8	4913211	4913218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2049	NC_015554	ATGA	2	8	4914123	4914130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_015554	CGCT	2	8	4914131	4914138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2051	NC_015554	TACA	2	8	4914272	4914279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2052	NC_015554	AACC	2	8	4914898	4914905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_015554	TTTC	2	8	4915090	4915097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2054	NC_015554	CCAT	2	8	4916066	4916073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_015554	CTTT	2	8	4922943	4922950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2056	NC_015554	CAAC	2	8	4931419	4931426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2057	NC_015554	CTAT	2	8	4932607	4932614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2058	NC_015554	GTTT	2	8	4932632	4932639	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_015554	CCCT	2	8	4934691	4934698	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2060	NC_015554	GATA	2	8	4935297	4935304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2061	NC_015554	TTTA	2	8	4939212	4939219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_015554	CAGC	2	8	4939645	4939652	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2063	NC_015554	AGGA	2	8	4940222	4940229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_015554	AACG	2	8	4940278	4940285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2065	NC_015554	ATTT	2	8	4941070	4941077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_015554	CATT	2	8	4941489	4941496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2067	NC_015554	AGAC	2	8	4942176	4942183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2068	NC_015554	TTAT	2	8	4942410	4942417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_015554	AAAG	2	8	4942534	4942541	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_015554	AACT	2	8	4948167	4948174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2071	NC_015554	CATT	2	8	4948203	4948210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2072	NC_015554	CTTA	2	8	4948441	4948448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2073	NC_015554	TGAG	2	8	4949724	4949731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_015554	ACAG	2	8	4953479	4953486	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2075	NC_015554	TATT	2	8	4953570	4953577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_015554	TATC	2	8	4953587	4953594	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2077	NC_015554	TATT	2	8	4960319	4960326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_015554	GAAT	2	8	4960879	4960886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.