MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mahella australiensis 50-1 BON chromosome

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015520	ATATGC	2	12	11442	11453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015520	TGACAG	2	12	35899	35910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015520	CGGCAG	2	12	41199	41210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015520	TGTTAC	2	12	84589	84600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_015520	CGTTAC	2	12	84604	84615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015520	AATTTT	2	12	115239	115250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015520	AAGGAT	2	12	148999	149010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015520	TAAAAT	2	12	149059	149070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015520	TGATAT	2	12	204830	204841	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015520	GAAACA	2	12	204931	204942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015520	TATGAA	2	12	215606	215617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015520	ATTGGA	2	12	219515	219526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015520	TGAGCT	2	12	225994	226005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_015520	AGTGCG	2	12	226863	226874	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015520	TAGGTG	2	12	334019	334030	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015520	CGCAGG	2	12	337522	337533	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015520	AAATAA	2	12	400566	400577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015520	ATTGCT	2	12	418727	418738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_015520	TTATCT	2	12	485142	485153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015520	TATAAA	2	12	548824	548835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015520	TAGATT	2	12	567564	567575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015520	TAGGTG	2	12	635556	635567	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015520	TTTTAT	2	12	743859	743870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015520	TTTCCA	2	12	779067	779078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015520	TATATG	2	12	831680	831691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015520	CTTTTA	2	12	879095	879106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015520	AGTTAA	2	12	935468	935479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015520	ATTTTT	2	12	951612	951623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015520	TTGCCT	2	12	1036387	1036398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015520	TAAATA	2	12	1050259	1050270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015520	ATAAAT	2	12	1102134	1102145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015520	TGCTTT	2	12	1144449	1144460	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015520	GAGCTA	2	12	1147685	1147696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015520	GCATTT	2	12	1506911	1506922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015520	CGGCAC	2	12	1525406	1525417	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015520	TCCTTT	2	12	1530891	1530902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015520	ATGCCG	2	12	1549695	1549706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015520	ATAAAA	2	12	1551754	1551765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015520	CCTGCG	2	12	1585048	1585059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015520	CAACAT	2	12	1664423	1664434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015520	TCATAT	2	12	1705194	1705205	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015520	TTTATA	2	12	1710225	1710236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015520	ATTTTT	2	12	1711302	1711313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015520	CTTTCT	2	12	1718370	1718381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015520	CGAGGT	2	12	1766629	1766640	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015520	ATTAAT	2	12	1835568	1835579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015520	TATAAA	2	12	1857995	1858006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015520	CATAAG	2	12	1858020	1858031	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015520	AAAGGC	2	12	2005870	2005881	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015520	ATCAAA	2	12	2095734	2095745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015520	TTATCC	2	12	2206010	2206021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015520	ATTACT	2	12	2238816	2238827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015520	ATATCA	2	12	2243481	2243492	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015520	CCGTAT	2	12	2335200	2335211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015520	TGAAAA	2	12	2337334	2337345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015520	TATATT	2	12	2337732	2337743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015520	TTAGTA	2	12	2338010	2338021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015520	TTGACT	2	12	2364355	2364366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_015520	ATTTTC	2	12	2415256	2415267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015520	TATATT	2	12	2421517	2421528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015520	ATAATT	2	12	2445900	2445911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015520	CCTTAG	2	12	2447431	2447442	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015520	TTATAT	2	12	2516495	2516506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015520	CAGTAC	2	12	2567281	2567292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015520	CAACCT	2	12	2634758	2634769	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015520	TCACAA	2	12	2642229	2642240	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015520	TCATCT	2	12	2658384	2658395	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015520	TACATA	2	12	2666927	2666938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015520	TTCATC	2	12	2671779	2671790	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015520	ATAAGC	2	12	2690633	2690644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015520	TATAAT	2	12	2715703	2715714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015520	AGTATT	2	12	2772831	2772842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015520	TACAAC	2	12	2920711	2920722	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015520	AAAGAA	2	12	2927660	2927671	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015520	TCCTTA	2	12	2941632	2941643	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015520	ATCCCA	2	12	3073878	3073889	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015520	TCAAAT	2	12	3103233	3103244	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.