MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mahella australiensis 50-1 BON chromosome

Total Repeats: 2182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015520	GATAC	2	10	2852076	2852085	40 %	20 %	20 %	20 %	332983208
2002	NC_015520	AAAAT	2	10	2854604	2854613	80 %	20 %	0 %	0 %	332983210
2003	NC_015520	TGTTA	2	10	2855088	2855097	20 %	60 %	20 %	0 %	332983210
2004	NC_015520	TCCAT	2	10	2860046	2860055	20 %	40 %	0 %	40 %	332983214
2005	NC_015520	CAAGC	2	10	2860768	2860777	40 %	0 %	20 %	40 %	332983214
2006	NC_015520	TCTCT	2	10	2860799	2860808	0 %	60 %	0 %	40 %	332983214
2007	NC_015520	TCCCA	2	10	2862191	2862200	20 %	20 %	0 %	60 %	332983215
2008	NC_015520	TAAAA	2	10	2862877	2862886	80 %	20 %	0 %	0 %	332983216
2009	NC_015520	TGTTA	2	10	2864085	2864094	20 %	60 %	20 %	0 %	332983217
2010	NC_015520	CGCGC	2	10	2866985	2866994	0 %	0 %	40 %	60 %	332983220
2011	NC_015520	TCTGC	2	10	2867819	2867828	0 %	40 %	20 %	40 %	332983220
2012	NC_015520	CTTCT	2	10	2868451	2868460	0 %	60 %	0 %	40 %	332983221
2013	NC_015520	CATCT	2	10	2870428	2870437	20 %	40 %	0 %	40 %	332983223
2014	NC_015520	GCTTT	2	10	2870930	2870939	0 %	60 %	20 %	20 %	332983224
2015	NC_015520	AAAGT	2	10	2872192	2872201	60 %	20 %	20 %	0 %	332983225
2016	NC_015520	CGGAT	2	10	2872221	2872230	20 %	20 %	40 %	20 %	332983225
2017	NC_015520	ACATA	2	10	2872263	2872272	60 %	20 %	0 %	20 %	332983225
2018	NC_015520	GCCGC	2	10	2872533	2872542	0 %	0 %	40 %	60 %	332983225
2019	NC_015520	GCAAA	2	10	2876040	2876049	60 %	0 %	20 %	20 %	332983229
2020	NC_015520	GATAT	2	10	2877162	2877171	40 %	40 %	20 %	0 %	332983230
2021	NC_015520	GCAGT	2	10	2877695	2877704	20 %	20 %	40 %	20 %	332983230
2022	NC_015520	TTGGA	2	10	2879137	2879146	20 %	40 %	40 %	0 %	332983231
2023	NC_015520	ATGGG	2	10	2879966	2879975	20 %	20 %	60 %	0 %	332983232
2024	NC_015520	GCATA	2	10	2882006	2882015	40 %	20 %	20 %	20 %	332983234
2025	NC_015520	GTATC	2	10	2883075	2883084	20 %	40 %	20 %	20 %	332983235
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2027	NC_015520	ATTTT	2	10	2886753	2886762	20 %	80 %	0 %	0 %	332983239
2028	NC_015520	GTATG	2	10	2889789	2889798	20 %	40 %	40 %	0 %	332983242
2029	NC_015520	AACAG	2	10	2891398	2891407	60 %	0 %	20 %	20 %	332983243
2030	NC_015520	AAAAC	2	10	2891957	2891966	80 %	0 %	0 %	20 %	332983244
2031	NC_015520	TCCCG	2	10	2893302	2893311	0 %	20 %	20 %	60 %	332983244
2032	NC_015520	TCGCT	2	10	2896744	2896753	0 %	40 %	20 %	40 %	332983249
2033	NC_015520	AGTTC	2	10	2897923	2897932	20 %	40 %	20 %	20 %	332983249
2034	NC_015520	TTAAT	2	10	2901160	2901169	40 %	60 %	0 %	0 %	332983252
2035	NC_015520	CCTTG	2	10	2902440	2902449	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2036	NC_015520	GCACA	2	10	2902917	2902926	40 %	0 %	20 %	40 %	332983253
2037	NC_015520	CTTCG	2	10	2904530	2904539	0 %	40 %	20 %	40 %	332983254
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2039	NC_015520	TGATC	2	10	2909770	2909779	20 %	40 %	20 %	20 %	332983258
2040	NC_015520	ATCAT	2	10	2910100	2910109	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2041	NC_015520	AACAG	2	10	2912533	2912542	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2042	NC_015520	AGCAA	2	10	2918223	2918232	60 %	0 %	20 %	20 %	332983265
2043	NC_015520	CTGTT	2	10	2924976	2924985	0 %	60 %	20 %	20 %	332983269
2044	NC_015520	CATCT	2	10	2927839	2927848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2045	NC_015520	GAATT	2	10	2928041	2928050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_015520	CAAAT	2	10	2931806	2931815	60 %	20 %	0 %	20 %	332983275
2047	NC_015520	ATCTT	2	10	2933507	2933516	20 %	60 %	0 %	20 %	332983276
2048	NC_015520	CCTCA	2	10	2934101	2934110	20 %	20 %	0 %	60 %	332983277
2049	NC_015520	GGCTT	2	10	2942770	2942779	0 %	40 %	40 %	20 %	332983284
2050	NC_015520	CGTCA	2	10	2944064	2944073	20 %	20 %	20 %	40 %	332983285
2051	NC_015520	TTGTT	2	10	2946312	2946321	0 %	80 %	20 %	0 %	332983287
2052	NC_015520	TCATA	2	10	2950815	2950824	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2053	NC_015520	GTATT	2	10	2952308	2952317	20 %	60 %	20 %	0 %	332983291
2054	NC_015520	TCAAC	2	10	2952818	2952827	40 %	20 %	0 %	40 %	332983291
2055	NC_015520	CTGGG	2	10	2958594	2958603	0 %	20 %	60 %	20 %	332983299
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2057	NC_015520	TAAAT	2	10	2961569	2961578	60 %	40 %	0 %	0 %	332983303
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2063	NC_015520	GCTCA	2	10	2967627	2967636	20 %	20 %	20 %	40 %	332983308
2064	NC_015520	TTTTA	2	10	2967720	2967729	20 %	80 %	0 %	0 %	332983308
2065	NC_015520	GTTAT	2	10	2967751	2967760	20 %	60 %	20 %	0 %	332983308
2066	NC_015520	AGTTC	2	10	2968720	2968729	20 %	40 %	20 %	20 %	332983308
2067	NC_015520	CATCA	2	10	2969799	2969808	40 %	20 %	0 %	40 %	332983310
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2070	NC_015520	ATGCC	2	10	2972691	2972700	20 %	20 %	20 %	40 %	332983312
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2073	NC_015520	TCACT	2	10	2974728	2974737	20 %	40 %	0 %	40 %	332983315
2074	NC_015520	TCACC	2	10	2975325	2975334	20 %	20 %	0 %	60 %	332983315
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2082	NC_015520	AAAAG	2	10	2994009	2994018	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2092	NC_015520	TATAT	2	10	3025234	3025243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_015520	ATTTT	2	10	3025271	3025280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2095	NC_015520	GAAAA	2	10	3027514	3027523	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2103	NC_015520	GCTCG	2	10	3037266	3037275	0 %	20 %	40 %	40 %	332983377
2104	NC_015520	TTGGG	2	10	3037628	3037637	0 %	40 %	60 %	0 %	332983377
2105	NC_015520	ACTTA	2	10	3038638	3038647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2106	NC_015520	AACGA	2	10	3038878	3038887	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2107	NC_015520	ATGAT	2	10	3040251	3040260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_015520	GATAG	2	10	3041634	3041643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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2122	NC_015520	ATATT	2	10	3056000	3056009	40 %	60 %	0 %	0 %	332983387
2123	NC_015520	AAACA	2	10	3057295	3057304	80 %	0 %	0 %	20 %	332983388
2124	NC_015520	GCGCA	2	10	3057968	3057977	20 %	0 %	40 %	40 %	332983389
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2164	NC_015520	TAAAA	2	10	3108750	3108759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_015520	ACGGT	2	10	3112397	3112406	20 %	20 %	40 %	20 %	332983454
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2168	NC_015520	TATAT	2	10	3117151	3117160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2169	NC_015520	CATAT	2	10	3119824	3119833	40 %	40 %	0 %	20 %	332983460
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2180	NC_015520	TAAAA	2	10	3133031	3133040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2182	NC_015520	ATTTT	2	10	3135924	3135933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.