MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mahella australiensis 50-1 BON chromosome

Total Repeats: 4351

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015520	GCT	2	6	2921712	2921717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015520	AGA	2	6	2921739	2921744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015520	TTC	2	6	2921794	2921799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_015520	GGC	2	6	2921844	2921849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_015520	TAT	2	6	2921860	2921865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015520	GTG	2	6	2921929	2921934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015520	TAA	2	6	2921955	2921960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015520	CAT	2	6	2922035	2922040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015520	GAA	2	6	2922142	2922147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015520	ATG	2	6	2922155	2922160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015520	GAG	2	6	2922289	2922294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015520	AAT	2	6	2922576	2922581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015520	CCT	2	6	2923792	2923797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_015520	TCC	2	6	2924583	2924588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_015520	CTC	2	6	2925466	2925471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_015520	TAT	2	6	2925480	2925485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015520	CAT	2	6	2925523	2925528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_015520	CTC	2	6	2926779	2926784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_015520	AAT	2	6	2926788	2926793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015520	TCA	2	6	2927035	2927040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015520	AGT	2	6	2927042	2927047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015520	ATT	2	6	2927178	2927183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015520	TTC	2	6	2927246	2927251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015520	AAT	2	6	2927382	2927387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015520	ATA	3	9	2927394	2927402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015520	GCT	2	6	2927413	2927418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_015520	CAA	2	6	2927461	2927466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015520	GAA	2	6	2927509	2927514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015520	TTC	2	6	2927532	2927537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015520	GTT	2	6	2927578	2927583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015520	GAA	2	6	2927639	2927644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015520	TCA	2	6	2927806	2927811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015520	TGC	2	6	2927977	2927982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_015520	AGG	2	6	2927986	2927991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015520	ATT	2	6	2927996	2928001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015520	AAT	2	6	2928126	2928131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015520	TAT	2	6	2928570	2928575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015520	TCG	2	6	2928604	2928609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015520	AAG	2	6	2928910	2928915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015520	TAT	2	6	2929502	2929507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015520	ATT	2	6	2929548	2929553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015520	GTA	2	6	2929566	2929571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015520	TAA	2	6	2929665	2929670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015520	TTC	2	6	2929705	2929710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015520	CAT	2	6	2929758	2929763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015520	TCA	2	6	2929882	2929887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015520	ACG	2	6	2929903	2929908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015520	AAT	2	6	2930030	2930035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015520	GCA	2	6	2930091	2930096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_015520	TGC	2	6	2930116	2930121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_015520	GGA	2	6	2930180	2930185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015520	CCT	2	6	2931094	2931099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015520	CTC	2	6	2932010	2932015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_015520	TCC	2	6	2933859	2933864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015520	TAA	2	6	2933886	2933891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015520	CTC	2	6	2933953	2933958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_015520	ATA	2	6	2933962	2933967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015520	ACC	2	6	2940002	2940007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_015520	TAT	2	6	2941226	2941231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015520	ATT	2	6	2941236	2941241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015520	TAT	2	6	2941247	2941252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015520	AAT	2	6	2941253	2941258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015520	TCA	2	6	2941457	2941462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_015520	CCA	2	6	2941500	2941505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4065	NC_015520	TTC	2	6	2941512	2941517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_015520	TGA	2	6	2941527	2941532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015520	TTC	2	6	2941535	2941540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015520	CTT	2	6	2941603	2941608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_015520	CGA	2	6	2941717	2941722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_015520	CGT	2	6	2941754	2941759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015520	TCC	2	6	2941916	2941921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_015520	TCC	2	6	2942380	2942385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_015520	GCC	2	6	2942415	2942420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_015520	CCT	2	6	2948317	2948322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_015520	TAA	2	6	2948358	2948363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015520	ACC	2	6	2948950	2948955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_015520	ACG	2	6	2948977	2948982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_015520	CTA	2	6	2949039	2949044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_015520	GCC	2	6	2949106	2949111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_015520	TTA	2	6	2949223	2949228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015520	ATT	2	6	2949252	2949257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015520	GAG	2	6	2949276	2949281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015520	AGC	2	6	2950738	2950743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015520	TAT	2	6	2950777	2950782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015520	TGG	2	6	2950797	2950802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015520	TTA	2	6	2950994	2950999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015520	AAT	2	6	2951079	2951084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_015520	AAT	2	6	2951111	2951116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_015520	TTG	2	6	2953355	2953360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015520	ATA	2	6	2953373	2953378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015520	ATT	2	6	2953381	2953386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015520	CAA	2	6	2953444	2953449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_015520	AGT	2	6	2953466	2953471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015520	TGG	2	6	2953475	2953480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015520	TTA	2	6	2953498	2953503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015520	ATA	2	6	2953528	2953533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015520	GCT	2	6	2953622	2953627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015520	CTT	2	6	2953644	2953649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015520	ATC	2	6	2954186	2954191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_015520	TAT	2	6	2954201	2954206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015520	GCA	2	6	2954246	2954251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_015520	GTA	2	6	2954290	2954295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015520	ATA	2	6	2954311	2954316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015520	AAG	2	6	2954325	2954330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015520	TAA	2	6	2955330	2955335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015520	TAT	2	6	2956562	2956567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015520	TTG	2	6	2957930	2957935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015520	TTG	2	6	2957948	2957953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015520	CTG	2	6	2957963	2957968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015520	ATA	2	6	2958057	2958062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015520	ATT	2	6	2958457	2958462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015520	ATG	2	6	2958467	2958472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015520	GGA	2	6	2959522	2959527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015520	ACA	2	6	2960300	2960305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_015520	ATA	2	6	2960311	2960316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015520	TAA	2	6	2960328	2960333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015520	TAC	2	6	2960716	2960721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015520	CCT	2	6	2961337	2961342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_015520	TTC	2	6	2961351	2961356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015520	TAC	2	6	2961425	2961430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015520	TCC	2	6	2961951	2961956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_015520	TAA	2	6	2962016	2962021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015520	TTA	2	6	2965017	2965022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015520	AAG	2	6	2965061	2965066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015520	CGG	2	6	2965081	2965086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_015520	TTA	2	6	2965147	2965152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015520	GCC	2	6	2965178	2965183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_015520	TCA	2	6	2965195	2965200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.