MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mahella australiensis 50-1 BON chromosome

Total Repeats: 41217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_015520	CTG	2	6	3116358	3116363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983457
41002	NC_015520	CCG	2	6	3116411	3116416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983457
41003	NC_015520	TTC	2	6	3116533	3116538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983457
41004	NC_015520	ACT	2	6	3116600	3116605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983457
41005	NC_015520	CTT	2	6	3116706	3116711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983457
41006	NC_015520	AAC	2	6	3116760	3116765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332983457
41007	NC_015520	TTA	2	6	3116766	3116771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983457
41008	NC_015520	GTA	2	6	3116930	3116935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983458
41009	NC_015520	ATA	2	6	3116979	3116984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983458
41010	NC_015520	CCT	2	6	3117037	3117042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41011	NC_015520	AAT	2	6	3117050	3117055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41012	NC_015520	ACA	2	6	3117317	3117322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332983459
41013	NC_015520	TTA	2	6	3117398	3117403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983459
41014	NC_015520	ACA	2	6	3117675	3117680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332983459
41015	NC_015520	ATT	2	6	3117924	3117929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983459
41016	NC_015520	GAT	2	6	3117951	3117956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983459
41017	NC_015520	ATC	2	6	3117957	3117962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983459
41018	NC_015520	CCG	2	6	3118001	3118006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983459
41019	NC_015520	GCC	2	6	3118080	3118085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983459
41020	NC_015520	GCA	2	6	3118142	3118147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983459
41021	NC_015520	CTC	2	6	3118197	3118202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983459
41022	NC_015520	TCA	2	6	3118259	3118264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41023	NC_015520	GTT	2	6	3118288	3118293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332983460
41024	NC_015520	GCA	2	6	3118321	3118326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41025	NC_015520	AGC	2	6	3118336	3118341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41026	NC_015520	GAT	3	9	3118383	3118391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983460
41027	NC_015520	GAT	2	6	3118571	3118576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983460
41028	NC_015520	AGC	2	6	3118634	3118639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41029	NC_015520	ATG	2	6	3118749	3118754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983460
41030	NC_015520	ATA	2	6	3118765	3118770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983460
41031	NC_015520	TAT	2	6	3118799	3118804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983460
41032	NC_015520	TCT	2	6	3118822	3118827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983460
41033	NC_015520	TCA	2	6	3118897	3118902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983460
41034	NC_015520	CGA	2	6	3119151	3119156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41035	NC_015520	TCG	2	6	3119197	3119202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41036	NC_015520	ATC	2	6	3119229	3119234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983460
41037	NC_015520	TAT	2	6	3119238	3119243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983460
41038	NC_015520	ATC	2	6	3119400	3119405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983460
41039	NC_015520	GTA	2	6	3119443	3119448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983460
41040	NC_015520	GAA	2	6	3119449	3119454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332983460
41041	NC_015520	TAG	2	6	3119546	3119551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983460
41042	NC_015520	TAC	2	6	3119571	3119576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983460
41043	NC_015520	ATA	2	6	3119596	3119601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983460
41044	NC_015520	CGC	2	6	3119603	3119608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983460
41045	NC_015520	ATA	2	6	3119613	3119618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983460
41046	NC_015520	AGC	2	6	3119659	3119664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41047	NC_015520	CAG	2	6	3119667	3119672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983460
41048	NC_015520	CGC	2	6	3119696	3119701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983460
41049	NC_015520	TAT	2	6	3119775	3119780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983460
41050	NC_015520	TTC	2	6	3119928	3119933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983460
41051	NC_015520	CTT	2	6	3120089	3120094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983461
41052	NC_015520	GGC	2	6	3120122	3120127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332983461
41053	NC_015520	CAC	2	6	3120152	3120157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332983461
41054	NC_015520	CGC	2	6	3120169	3120174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983461
41055	NC_015520	CAG	2	6	3120614	3120619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983461
41056	NC_015520	TTA	2	6	3120637	3120642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983461
41057	NC_015520	TCA	2	6	3120735	3120740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983461
41058	NC_015520	TGC	2	6	3120819	3120824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41059	NC_015520	AGC	2	6	3120837	3120842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41060	NC_015520	TCG	2	6	3120966	3120971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41061	NC_015520	TCC	2	6	3120984	3120989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983462
41062	NC_015520	TCT	2	6	3120991	3120996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983462
41063	NC_015520	CAT	2	6	3121013	3121018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983462
41064	NC_015520	CTG	2	6	3121073	3121078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41065	NC_015520	TAA	2	6	3121079	3121084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983462
41066	NC_015520	GCA	2	6	3121119	3121124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41067	NC_015520	CTT	2	6	3121274	3121279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983462
41068	NC_015520	TCA	2	6	3121396	3121401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983462
41069	NC_015520	GTC	2	6	3121436	3121441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41070	NC_015520	GCA	2	6	3121509	3121514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41071	NC_015520	CCT	2	6	3121546	3121551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983462
41072	NC_015520	GCT	2	6	3121739	3121744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41073	NC_015520	CAC	2	6	3121829	3121834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332983462
41074	NC_015520	GCG	2	6	3121894	3121899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332983462
41075	NC_015520	TTA	2	6	3121918	3121923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983462
41076	NC_015520	ATC	2	6	3121985	3121990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983462
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41078	NC_015520	TGC	2	6	3122053	3122058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41079	NC_015520	GCT	2	6	3122165	3122170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983462
41080	NC_015520	TAT	2	6	3122186	3122191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983462
41081	NC_015520	GGT	2	6	3122216	3122221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332983462
41082	NC_015520	ACA	2	6	3122265	3122270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332983462
41083	NC_015520	CTC	2	6	3122285	3122290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983462
41084	NC_015520	CAC	2	6	3122303	3122308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332983462
41085	NC_015520	CTT	2	6	3122375	3122380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983462
41086	NC_015520	CAT	2	6	3122546	3122551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983462
41087	NC_015520	GCC	2	6	3122616	3122621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983462
41088	NC_015520	CCA	2	6	3122727	3122732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332983463
41089	NC_015520	CGT	2	6	3122820	3122825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983463
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41092	NC_015520	GAT	2	6	3123092	3123097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983463
41093	NC_015520	GCT	2	6	3123224	3123229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983463
41094	NC_015520	TAT	2	6	3123292	3123297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332983463
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41096	NC_015520	AGT	2	6	3123446	3123451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983463
41097	NC_015520	TCT	2	6	3123582	3123587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332983463
41098	NC_015520	CTC	2	6	3123593	3123598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983463
41099	NC_015520	GCC	2	6	3123796	3123801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983463
41100	NC_015520	GCT	2	6	3124052	3124057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983463
41101	NC_015520	CGT	2	6	3124211	3124216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983464
41102	NC_015520	CTC	2	6	3124397	3124402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983464
41103	NC_015520	CGC	2	6	3124513	3124518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332983464
41104	NC_015520	CAT	2	6	3124696	3124701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983464
41105	NC_015520	CCT	2	6	3124792	3124797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332983465
41106	NC_015520	CTG	2	6	3124976	3124981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332983465
41107	NC_015520	CGA	2	6	3124988	3124993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332983465
41108	NC_015520	GCG	2	6	3124999	3125004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332983465
41109	NC_015520	TAG	2	6	3125086	3125091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332983465
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41113	NC_015520	CCA	2	6	3125455	3125460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332983465
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41212	NC_015520	TCA	2	6	3135419	3135424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332983475
41213	NC_015520	AAT	2	6	3135592	3135597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332983475
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41215	NC_015520	TCC	2	6	3135668	3135673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41216	NC_015520	CTA	3	9	3135711	3135719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41217	NC_015520	ATA	2	6	3135811	3135816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.