MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 1027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GCTGAT	2	12	6430	6441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798030
2	NC_015519	GCTTTG	2	12	10224	10235	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332798032
3	NC_015519	TTTTAG	2	12	14683	14694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798038
4	NC_015519	CAGGGA	2	12	15149	15160	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332798039
5	NC_015519	CAGGAA	2	12	15954	15965	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332798039
6	NC_015519	GATAAA	2	12	28464	28475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015519	TACCTA	2	12	29054	29065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798052
8	NC_015519	TTTTAG	2	12	35019	35030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798058
9	NC_015519	TATTGA	2	12	36779	36790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798058
10	NC_015519	ACATGA	2	12	36806	36817	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015519	TTATGG	2	12	36963	36974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015519	GGCTCA	2	12	39930	39941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798061
13	NC_015519	ACAGTA	2	12	40307	40318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798061
14	NC_015519	GGTATT	2	12	42472	42483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332798063
15	NC_015519	GCAGAT	2	12	48815	48826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332798068
16	NC_015519	AATTCT	2	12	54058	54069	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015519	TAATGC	2	12	57617	57628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798073
18	NC_015519	TTAAAT	2	12	59627	59638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015519	CATAAA	2	12	61170	61181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332798077
20	NC_015519	ATGCTG	2	12	65578	65589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798079
21	NC_015519	TTTGAC	2	12	68283	68294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798081
22	NC_015519	TAAAAA	2	12	69562	69573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798082
23	NC_015519	TTGGCA	2	12	69943	69954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798082
24	NC_015519	AAATAG	2	12	73537	73548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798084
25	NC_015519	GCAGGG	2	12	76313	76324	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798087
26	NC_015519	GGGGAT	2	12	76754	76765	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332798087
27	NC_015519	TATCCA	2	12	80922	80933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798090
28	NC_015519	TTTAGA	2	12	84763	84774	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798092
29	NC_015519	AAAAGC	2	12	89016	89027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798098
30	NC_015519	ATGGGA	2	12	90397	90408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798099
31	NC_015519	TGGGGT	2	12	91683	91694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798101
32	NC_015519	AGAGGA	2	12	95675	95686	50 %	0 %	50 %	0 %	332798104
33	NC_015519	AAGAAA	4	24	95716	95739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798104
34	NC_015519	ATCCGG	2	12	98944	98955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798108
35	NC_015519	TATAAA	2	12	103627	103638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015519	CAAAAG	2	12	106360	106371	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015519	AAATGC	2	12	107951	107962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798118
38	NC_015519	AAATAT	2	12	110591	110602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798121
39	NC_015519	TCAGGT	2	12	114851	114862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798126
40	NC_015519	AAATAA	2	12	115336	115347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798126
41	NC_015519	AGGAAG	2	12	116658	116669	50 %	0 %	50 %	0 %	332798126
42	NC_015519	CCATAC	2	12	118382	118393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332798128
43	NC_015519	AAAGCT	2	12	121839	121850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798130
44	NC_015519	CCGATG	2	12	122517	122528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798131
45	NC_015519	GAAAAA	2	12	125304	125315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798133
46	NC_015519	AAAATG	2	12	130056	130067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798138
47	NC_015519	GTTTAT	2	12	133733	133744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798139
48	NC_015519	GACAAA	2	12	145501	145512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798147
49	NC_015519	CCTTCT	2	12	146408	146419	0 %	50 %	0 %	50 %	332798148
50	NC_015519	TTGCTA	2	12	146922	146933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798148
51	NC_015519	TAAAGG	2	12	147117	147128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015519	AAATTT	2	12	150413	150424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015519	TTCCGG	2	12	153351	153362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798153
54	NC_015519	GTAGAT	2	12	156855	156866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798156
55	NC_015519	GGTATT	2	12	159986	159997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015519	GGTTGC	2	12	162855	162866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332798164
57	NC_015519	CTACGC	2	12	166479	166490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332798167
58	NC_015519	TCTTAA	2	12	175606	175617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798174
59	NC_015519	GTAGAG	2	12	175637	175648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798174
60	NC_015519	AGGCGG	2	12	180376	180387	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798179
61	NC_015519	GACGAA	2	12	180611	180622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332798179
62	NC_015519	GGGAAG	2	12	190902	190913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798186
63	NC_015519	GGATGA	2	12	191164	191175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798186
64	NC_015519	AAATGC	2	12	196857	196868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798191
65	NC_015519	TACTGC	2	12	198327	198338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798192
66	NC_015519	AAAGGT	2	12	200203	200214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798196
67	NC_015519	TATATG	2	12	204733	204744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798198
68	NC_015519	AGACTC	2	12	205203	205214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332798198
69	NC_015519	GCAGGA	2	12	210444	210455	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332798203
70	NC_015519	TGCGGC	2	12	212945	212956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332798204
71	NC_015519	GAAACA	2	12	217754	217765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798212
72	NC_015519	AAAAGG	2	12	218265	218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798214
73	NC_015519	AAAGCT	2	12	218407	218418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798214
74	NC_015519	TATGTT	2	12	225383	225394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798228
75	NC_015519	TTGAAG	2	12	225625	225636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798229
76	NC_015519	AAAAGA	2	12	227195	227206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798233
77	NC_015519	CAAAAA	2	12	230193	230204	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	332798237
78	NC_015519	TTATAC	2	12	231607	231618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798239
79	NC_015519	TGCTCA	2	12	235246	235257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798243
80	NC_015519	TGAAAC	2	12	238570	238581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015519	AGAAAA	2	12	245505	245516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798248
82	NC_015519	AAGCGA	2	12	252503	252514	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_015519	GCAACA	2	12	257829	257840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332798256
84	NC_015519	GCCCGG	2	12	257972	257983	0 %	0 %	50 %	50 %	332798256
85	NC_015519	GAATAT	2	12	260117	260128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798258
86	NC_015519	TTTCAT	2	12	261050	261061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332798259
87	NC_015519	GTAGAG	2	12	262536	262547	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798260
88	NC_015519	AGAAAA	2	12	262738	262749	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798260
89	NC_015519	GTAAAA	2	12	264882	264893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798263
90	NC_015519	TTTTAT	2	12	267169	267180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015519	ATGGTG	2	12	269660	269671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332798269
92	NC_015519	TCATGA	2	12	269878	269889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798269
93	NC_015519	AATGAA	2	12	270110	270121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015519	TCATAA	2	12	270795	270806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332798271
95	NC_015519	ACAGTA	2	12	284417	284428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015519	AAAAAG	2	12	294559	294570	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015519	AAAACT	2	12	297566	297577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332798292
98	NC_015519	TGCTTT	2	12	297939	297950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332798292
99	NC_015519	TTAGCC	2	12	299922	299933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015519	CCAAGC	2	12	301141	301152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332798295
101	NC_015519	TGAAAT	2	12	301936	301947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798295
102	NC_015519	TAAAGG	2	12	304130	304141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798296
103	NC_015519	ATATTA	2	12	305469	305480	50 %	50 %	0 %	0 %	332798297
104	NC_015519	AAAGAA	2	12	306297	306308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798297
105	NC_015519	ATATGT	2	12	307433	307444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798298
106	NC_015519	GAAATA	2	12	308628	308639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798298
107	NC_015519	TTATGA	2	12	310680	310691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798300
108	NC_015519	GAATGG	2	12	311054	311065	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798300
109	NC_015519	CCGGAA	2	12	312454	312465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798301
110	NC_015519	TTATGA	2	12	313984	313995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798303
111	NC_015519	GATTAT	2	12	317969	317980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798306
112	NC_015519	GTCCAT	2	12	321562	321573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798308
113	NC_015519	ACTTTG	2	12	323358	323369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798309
114	NC_015519	CGGAGG	2	12	331098	331109	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798315
115	NC_015519	GAAGAT	2	12	334873	334884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798319
116	NC_015519	TAAAAA	2	12	337334	337345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798322
117	NC_015519	AAAACC	2	12	337732	337743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015519	AGGATG	3	18	338771	338788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798323
119	NC_015519	GTAAAA	2	12	342056	342067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798324
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207	NC_015519	TGATCA	2	12	582797	582808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798536
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216	NC_015519	TGCCGG	2	12	603444	603455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332798557
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220	NC_015519	GTTGCA	2	12	610304	610315	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798565
221	NC_015519	AGGTAT	2	12	610662	610673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798566
222	NC_015519	CAAATG	2	12	615834	615845	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798571
223	NC_015519	TGACGG	2	12	621045	621056	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	332798575
224	NC_015519	TTATGC	2	12	623619	623630	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798578
225	NC_015519	TACCGT	2	12	625603	625614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798579
226	NC_015519	AAGGAA	2	12	626167	626178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
227	NC_015519	CAAAAG	2	12	626865	626876	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798580
228	NC_015519	CATTTC	2	12	630527	630538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332798584
229	NC_015519	AAGGAA	2	12	630913	630924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798584
230	NC_015519	GTCCTC	2	12	636005	636016	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332798588
231	NC_015519	ACAAGA	2	12	639084	639095	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798590
232	NC_015519	AAAAGA	2	12	645888	645899	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798594
233	NC_015519	GATATA	2	12	649529	649540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798599
234	NC_015519	ACCATT	2	12	650684	650695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_015519	ACACCA	2	12	656368	656379	50 %	0 %	0 %	50 %	332798604
236	NC_015519	TAACAA	2	12	661764	661775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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349	NC_015519	GATTTG	2	12	951288	951299	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
350	NC_015519	AAATAA	2	12	951985	951996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798863
351	NC_015519	AAAAGC	2	12	952510	952521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798863
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353	NC_015519	TATCAT	2	12	960707	960718	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798869
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357	NC_015519	TAAATA	2	12	968540	968551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_015519	GGACAA	2	12	968584	968595	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
359	NC_015519	GTTTTT	2	12	972980	972991	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332798880
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362	NC_015519	TCAGAA	2	12	987710	987721	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798895
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370	NC_015519	TTGAAA	2	12	1001150	1001161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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381	NC_015519	TTTATA	2	12	1044410	1044421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_015519	ATGATA	2	12	1044717	1044728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798936
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422	NC_015519	TATAAT	2	12	1173867	1173878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_015519	TGATTC	2	12	1174689	1174700	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332799080
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442	NC_015519	AATATT	2	12	1213695	1213706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015519	TAAAAA	2	12	1214147	1214158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332799118
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445	NC_015519	AGTAGC	2	12	1222936	1222947	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332799121
446	NC_015519	ATGGTG	2	12	1224484	1224495	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332799123
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448	NC_015519	TTGATG	2	12	1229128	1229139	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332799129
449	NC_015519	TGAAAA	2	12	1230971	1230982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332799131
450	NC_015519	ACATTG	2	12	1234880	1234891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332799136
451	NC_015519	TTTATT	2	12	1235974	1235985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332799137
452	NC_015519	CGGTGC	2	12	1238693	1238704	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332799141
453	NC_015519	TAAATG	2	12	1242256	1242267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015519	GAAAAA	2	12	1243713	1243724	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332799147
455	NC_015519	AGGGGC	2	12	1244515	1244526	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332799148
456	NC_015519	ATTGAT	2	12	1244618	1244629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332799148
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458	NC_015519	TATTGC	2	12	1249155	1249166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332799150
459	NC_015519	TATTAA	2	12	1252095	1252106	50 %	50 %	0 %	0 %	332799155
460	NC_015519	GAACAA	2	12	1253232	1253243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332799157
461	NC_015519	TTTTGG	2	12	1254609	1254620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332799159
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463	NC_015519	AATACA	2	12	1258467	1258478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332799163
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497	NC_015519	TTCTAT	2	12	1329941	1329952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332799238
498	NC_015519	TTAAAT	2	12	1330154	1330165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_015519	GAAAAT	6	36	1330467	1330502	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332799239
500	NC_015519	AATGAA	2	12	1331347	1331358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332799240

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