MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GCTGAT	2	12	6430	6441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798030
2	NC_015519	GCTTTG	2	12	10224	10235	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332798032
3	NC_015519	TTTTAG	2	12	14683	14694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798038
4	NC_015519	CAGGGA	2	12	15149	15160	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332798039
5	NC_015519	CAGGAA	2	12	15954	15965	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332798039
6	NC_015519	TACCTA	2	12	29054	29065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798052
7	NC_015519	TTTTAG	2	12	35019	35030	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798058
8	NC_015519	TATTGA	2	12	36779	36790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798058
9	NC_015519	GGCTCA	2	12	39930	39941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798061
10	NC_015519	ACAGTA	2	12	40307	40318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798061
11	NC_015519	GGTATT	2	12	42472	42483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332798063
12	NC_015519	GCAGAT	2	12	48815	48826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332798068
13	NC_015519	TAATGC	2	12	57617	57628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798073
14	NC_015519	CATAAA	2	12	61170	61181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332798077
15	NC_015519	ATGCTG	2	12	65578	65589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798079
16	NC_015519	TTTGAC	2	12	68283	68294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798081
17	NC_015519	TAAAAA	2	12	69562	69573	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798082
18	NC_015519	TTGGCA	2	12	69943	69954	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798082
19	NC_015519	AAATAG	2	12	73537	73548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798084
20	NC_015519	GCAGGG	2	12	76313	76324	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798087
21	NC_015519	GGGGAT	2	12	76754	76765	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332798087
22	NC_015519	TATCCA	2	12	80922	80933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332798090
23	NC_015519	TTTAGA	2	12	84763	84774	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798092
24	NC_015519	AAAAGC	2	12	89016	89027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798098
25	NC_015519	ATGGGA	2	12	90397	90408	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798099
26	NC_015519	TGGGGT	2	12	91683	91694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332798101
27	NC_015519	AGAGGA	2	12	95675	95686	50 %	0 %	50 %	0 %	332798104
28	NC_015519	AAGAAA	4	24	95716	95739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798104
29	NC_015519	ATCCGG	2	12	98944	98955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798108
30	NC_015519	AAATGC	2	12	107951	107962	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798118
31	NC_015519	AAATAT	2	12	110591	110602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332798121
32	NC_015519	TCAGGT	2	12	114851	114862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332798126
33	NC_015519	AAATAA	2	12	115336	115347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798126
34	NC_015519	AGGAAG	2	12	116658	116669	50 %	0 %	50 %	0 %	332798126
35	NC_015519	CCATAC	2	12	118382	118393	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332798128
36	NC_015519	AAAGCT	2	12	121839	121850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798130
37	NC_015519	CCGATG	2	12	122517	122528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332798131
38	NC_015519	GAAAAA	2	12	125304	125315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798133
39	NC_015519	AAAATG	2	12	130056	130067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798138
40	NC_015519	GTTTAT	2	12	133733	133744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798139
41	NC_015519	GACAAA	2	12	145501	145512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798147
42	NC_015519	CCTTCT	2	12	146408	146419	0 %	50 %	0 %	50 %	332798148
43	NC_015519	TTGCTA	2	12	146922	146933	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798148
44	NC_015519	TTCCGG	2	12	153351	153362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332798153
45	NC_015519	GTAGAT	2	12	156855	156866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798156
46	NC_015519	GGTTGC	2	12	162855	162866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332798164
47	NC_015519	CTACGC	2	12	166479	166490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	332798167
48	NC_015519	TCTTAA	2	12	175606	175617	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798174
49	NC_015519	GTAGAG	2	12	175637	175648	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798174
50	NC_015519	AGGCGG	2	12	180376	180387	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798179
51	NC_015519	GACGAA	2	12	180611	180622	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332798179
52	NC_015519	GGGAAG	2	12	190902	190913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332798186
53	NC_015519	GGATGA	2	12	191164	191175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798186
54	NC_015519	AAATGC	2	12	196857	196868	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798191
55	NC_015519	TACTGC	2	12	198327	198338	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798192
56	NC_015519	AAAGGT	2	12	200203	200214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798196
57	NC_015519	TATATG	2	12	204733	204744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798198
58	NC_015519	AGACTC	2	12	205203	205214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332798198
59	NC_015519	GCAGGA	2	12	210444	210455	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332798203
60	NC_015519	TGCGGC	2	12	212945	212956	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	332798204
61	NC_015519	GAAACA	2	12	217754	217765	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798212
62	NC_015519	AAAAGG	2	12	218265	218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798214
63	NC_015519	AAAGCT	2	12	218407	218418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798214
64	NC_015519	TATGTT	2	12	225383	225394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332798228
65	NC_015519	TTGAAG	2	12	225625	225636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798229
66	NC_015519	AAAAGA	2	12	227195	227206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798233
67	NC_015519	CAAAAA	2	12	230193	230204	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	332798237
68	NC_015519	TTATAC	2	12	231607	231618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798239
69	NC_015519	TGCTCA	2	12	235246	235257	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798243
70	NC_015519	AGAAAA	2	12	245505	245516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798248
71	NC_015519	GCAACA	2	12	257829	257840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332798256
72	NC_015519	GCCCGG	2	12	257972	257983	0 %	0 %	50 %	50 %	332798256
73	NC_015519	GAATAT	2	12	260117	260128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798258
74	NC_015519	TTTCAT	2	12	261050	261061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332798259
75	NC_015519	GTAGAG	2	12	262536	262547	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798260
76	NC_015519	AGAAAA	2	12	262738	262749	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798260
77	NC_015519	GTAAAA	2	12	264882	264893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798263
78	NC_015519	ATGGTG	2	12	269660	269671	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332798269
79	NC_015519	TCATGA	2	12	269878	269889	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798269
80	NC_015519	TCATAA	2	12	270795	270806	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332798271
81	NC_015519	AAAACT	2	12	297566	297577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332798292
82	NC_015519	TGCTTT	2	12	297939	297950	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332798292
83	NC_015519	CCAAGC	2	12	301141	301152	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	332798295
84	NC_015519	TGAAAT	2	12	301936	301947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798295
85	NC_015519	TAAAGG	2	12	304130	304141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798296
86	NC_015519	ATATTA	2	12	305469	305480	50 %	50 %	0 %	0 %	332798297
87	NC_015519	AAAGAA	2	12	306297	306308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332798297
88	NC_015519	ATATGT	2	12	307433	307444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798298
89	NC_015519	GAAATA	2	12	308628	308639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798298
90	NC_015519	TTATGA	2	12	310680	310691	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798300
91	NC_015519	GAATGG	2	12	311054	311065	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798300
92	NC_015519	CCGGAA	2	12	312454	312465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332798301
93	NC_015519	TTATGA	2	12	313984	313995	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798303
94	NC_015519	GATTAT	2	12	317969	317980	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798306
95	NC_015519	GTCCAT	2	12	321562	321573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332798308
96	NC_015519	ACTTTG	2	12	323358	323369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798309
97	NC_015519	CGGAGG	2	12	331098	331109	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332798315
98	NC_015519	GAAGAT	2	12	334873	334884	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798319
99	NC_015519	TAAAAA	2	12	337334	337345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798322
100	NC_015519	AGGATG	3	18	338771	338788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332798323
101	NC_015519	GTAAAA	2	12	342056	342067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798324
102	NC_015519	TAGAAA	2	12	342543	342554	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798324
103	NC_015519	AAATCC	2	12	344857	344868	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332798327
104	NC_015519	AAAAAC	2	12	346408	346419	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	332798328
105	NC_015519	GATTCA	2	12	349250	349261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332798333
106	NC_015519	TAATAT	2	12	355665	355676	50 %	50 %	0 %	0 %	332798338
107	NC_015519	AGCTAA	2	12	360968	360979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332798343
108	NC_015519	TAAAAA	2	12	367467	367478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798348
109	NC_015519	TAAAAG	2	12	368658	368669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798349
110	NC_015519	GATGTT	2	12	370939	370950	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332798351
111	NC_015519	GAAATG	2	12	372125	372136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798353
112	NC_015519	CGGAGC	2	12	377595	377606	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332798358
113	NC_015519	GGAAAG	2	12	378749	378760	50 %	0 %	50 %	0 %	332798359
114	NC_015519	TGGCGG	2	12	379539	379550	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	332798359
115	NC_015519	ACTGTT	2	12	384630	384641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798363
116	NC_015519	AGGAAA	2	12	386730	386741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798365
117	NC_015519	ATTCAT	2	12	388078	388089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798366
118	NC_015519	AGAAAG	2	12	390432	390443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332798370
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220	NC_015519	TTGACT	2	12	709566	709577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798649
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228	NC_015519	CAAAGA	2	12	727498	727509	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332798665
229	NC_015519	AATATT	2	12	733386	733397	50 %	50 %	0 %	0 %	332798673
230	NC_015519	TGATAT	2	12	737160	737171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332798675
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232	NC_015519	CTATTG	2	12	746497	746508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332798679
233	NC_015519	TCAATT	2	12	749005	749016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332798683
234	NC_015519	AAATAA	2	12	750297	750308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332798684
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236	NC_015519	GATTAG	2	12	751065	751076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332798685
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336	NC_015519	ATAAAG	2	12	1078938	1078949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798971
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338	NC_015519	GATATA	2	12	1089551	1089562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798986
339	NC_015519	GATAAA	3	18	1089563	1089580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332798986
340	NC_015519	ACCGAA	2	12	1091516	1091527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332798989
341	NC_015519	GAGATA	2	12	1093853	1093864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332798997
342	NC_015519	ATATAG	2	12	1094593	1094604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332798998
343	NC_015519	GGGATT	2	12	1094835	1094846	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332798999
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458	NC_015519	GCTATA	2	12	1382639	1382650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332799291
459	NC_015519	ATTTAT	2	12	1388074	1388085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332799295
460	NC_015519	TAATTT	2	12	1388953	1388964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332799296
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462	NC_015519	TATAAT	2	12	1395432	1395443	50 %	50 %	0 %	0 %	332799302
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