MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 2074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	AAAAC	2	10	306	315	80 %	0 %	0 %	20 %	332798024
2	NC_015519	TCGCT	2	10	483	492	0 %	40 %	20 %	40 %	332798024
3	NC_015519	TAAAA	2	10	2743	2752	80 %	20 %	0 %	0 %	332798025
4	NC_015519	ATTTT	2	10	2817	2826	20 %	80 %	0 %	0 %	332798025
5	NC_015519	ATAAA	2	10	4629	4638	80 %	20 %	0 %	0 %	332798028
6	NC_015519	AAAAT	2	10	4970	4979	80 %	20 %	0 %	0 %	332798030
7	NC_015519	AAGGG	2	10	5889	5898	40 %	0 %	60 %	0 %	332798030
8	NC_015519	CAAAA	2	10	10517	10526	80 %	0 %	0 %	20 %	332798032
9	NC_015519	AACAC	2	10	11688	11697	60 %	0 %	0 %	40 %	332798034
10	NC_015519	TTTTA	2	10	13487	13496	20 %	80 %	0 %	0 %	332798037
11	NC_015519	ATATA	2	10	13972	13981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015519	CATTA	2	10	14516	14525	40 %	40 %	0 %	20 %	332798038
13	NC_015519	TGCAC	2	10	15722	15731	20 %	20 %	20 %	40 %	332798039
14	NC_015519	AAGAC	2	10	16363	16372	60 %	0 %	20 %	20 %	332798039
15	NC_015519	ATTCT	2	10	16561	16570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015519	TAGCA	2	10	16615	16624	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015519	AGGCA	2	10	17126	17135	40 %	0 %	40 %	20 %	332798040
18	NC_015519	GACAA	2	10	18440	18449	60 %	0 %	20 %	20 %	332798041
19	NC_015519	ATCCC	2	10	18678	18687	20 %	20 %	0 %	60 %	332798041
20	NC_015519	CTTAA	2	10	18828	18837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015519	TTTTC	2	10	19121	19130	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_015519	GCCAA	2	10	19637	19646	40 %	0 %	20 %	40 %	332798042
23	NC_015519	CGATT	2	10	20364	20373	20 %	40 %	20 %	20 %	332798042
24	NC_015519	GCAAA	2	10	20711	20720	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015519	ATTAC	2	10	22910	22919	40 %	40 %	0 %	20 %	332798045
26	NC_015519	ATTTT	2	10	28195	28204	20 %	80 %	0 %	0 %	332798050
27	NC_015519	AAATC	2	10	31874	31883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015519	AAACA	2	10	37124	37133	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015519	ATAAG	2	10	37218	37227	60 %	20 %	20 %	0 %	332798059
30	NC_015519	CAAGT	2	10	39510	39519	40 %	20 %	20 %	20 %	332798061
31	NC_015519	AATAC	2	10	41046	41055	60 %	20 %	0 %	20 %	332798062
32	NC_015519	ATATA	2	10	41662	41671	60 %	40 %	0 %	0 %	332798062
33	NC_015519	TGATA	2	10	42138	42147	40 %	40 %	20 %	0 %	332798063
34	NC_015519	GGCAA	2	10	45426	45435	40 %	0 %	40 %	20 %	332798066
35	NC_015519	TGTTT	2	10	48424	48433	0 %	80 %	20 %	0 %	332798068
36	NC_015519	TAATT	2	10	52511	52520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015519	AAAGA	2	10	53934	53943	80 %	0 %	20 %	0 %	332798071
38	NC_015519	ATTTA	2	10	54111	54120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015519	AATAC	2	10	55756	55765	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015519	ATATC	2	10	59869	59878	40 %	40 %	0 %	20 %	332798076
41	NC_015519	CATGA	2	10	61105	61114	40 %	20 %	20 %	20 %	332798077
42	NC_015519	TAAAT	2	10	61128	61137	60 %	40 %	0 %	0 %	332798077
43	NC_015519	AGAAA	2	10	62084	62093	80 %	0 %	20 %	0 %	332798077
44	NC_015519	CAAGT	2	10	63958	63967	40 %	20 %	20 %	20 %	332798078
45	NC_015519	GAAAT	2	10	67279	67288	60 %	20 %	20 %	0 %	332798081
46	NC_015519	ATGTG	2	10	69042	69051	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015519	CATCA	2	10	69062	69071	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_015519	GCTTA	2	10	70838	70847	20 %	40 %	20 %	20 %	332798083
49	NC_015519	GTATT	2	10	70894	70903	20 %	60 %	20 %	0 %	332798083
50	NC_015519	AATTG	2	10	74006	74015	40 %	40 %	20 %	0 %	332798084
51	NC_015519	AATAT	2	10	75645	75654	60 %	40 %	0 %	0 %	332798086
52	NC_015519	AAGAA	2	10	77362	77371	80 %	0 %	20 %	0 %	332798087
53	NC_015519	GTTTG	2	10	80996	81005	0 %	60 %	40 %	0 %	332798090
54	NC_015519	ACCGT	2	10	81596	81605	20 %	20 %	20 %	40 %	332798090
55	NC_015519	ATATG	2	10	82974	82983	40 %	40 %	20 %	0 %	332798091
56	NC_015519	ATTTT	2	10	85376	85385	20 %	80 %	0 %	0 %	332798093
57	NC_015519	TATAA	2	10	86452	86461	60 %	40 %	0 %	0 %	332798095
58	NC_015519	ATATG	2	10	86948	86957	40 %	40 %	20 %	0 %	332798095
59	NC_015519	GGATG	2	10	87340	87349	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015519	TTTTA	2	10	90484	90493	20 %	80 %	0 %	0 %	332798099
61	NC_015519	GTGAG	2	10	91225	91234	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015519	TGCTG	2	10	92038	92047	0 %	40 %	40 %	20 %	332798101
63	NC_015519	ATGAA	2	10	92517	92526	60 %	20 %	20 %	0 %	332798101
64	NC_015519	ATATT	2	10	93860	93869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015519	CCTTA	2	10	97218	97227	20 %	40 %	0 %	40 %	332798106
66	NC_015519	ATTTT	2	10	99304	99313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015519	ATAGA	2	10	99704	99713	60 %	20 %	20 %	0 %	332798109
68	NC_015519	AAAAT	2	10	101198	101207	80 %	20 %	0 %	0 %	332798110
69	NC_015519	AATAC	2	10	102071	102080	60 %	20 %	0 %	20 %	332798111
70	NC_015519	GTCAG	2	10	103257	103266	20 %	20 %	40 %	20 %	332798113
71	NC_015519	CAAAA	2	10	104881	104890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015519	CGGAC	2	10	105470	105479	20 %	0 %	40 %	40 %	332798116
73	NC_015519	AAACT	2	10	106419	106428	60 %	20 %	0 %	20 %	332798117
74	NC_015519	CGAAA	2	10	106544	106553	60 %	0 %	20 %	20 %	332798117
75	NC_015519	ACTAT	2	10	107208	107217	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015519	TAATT	2	10	107302	107311	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015519	TTGGT	2	10	107859	107868	0 %	60 %	40 %	0 %	332798118
78	NC_015519	AGAAA	2	10	108874	108883	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015519	ACAGA	2	10	115761	115770	60 %	0 %	20 %	20 %	332798126
80	NC_015519	ATTTC	2	10	117853	117862	20 %	60 %	0 %	20 %	332798128
81	NC_015519	TCAGG	2	10	118163	118172	20 %	20 %	40 %	20 %	332798128
82	NC_015519	GTCAA	2	10	118354	118363	40 %	20 %	20 %	20 %	332798128
83	NC_015519	TGCTT	2	10	118920	118929	0 %	60 %	20 %	20 %	332798129
84	NC_015519	CTTCA	2	10	119932	119941	20 %	40 %	0 %	40 %	332798129
85	NC_015519	ATTTG	2	10	121969	121978	20 %	60 %	20 %	0 %	332798130
86	NC_015519	GTGAT	2	10	122610	122619	20 %	40 %	40 %	0 %	332798131
87	NC_015519	GAAAG	2	10	124469	124478	60 %	0 %	40 %	0 %	332798133
88	NC_015519	TAAAA	2	10	125528	125537	80 %	20 %	0 %	0 %	332798133
89	NC_015519	AGGAG	2	10	125994	126003	40 %	0 %	60 %	0 %	332798134
90	NC_015519	TTATT	2	10	128886	128895	20 %	80 %	0 %	0 %	332798137
91	NC_015519	TGATT	2	10	128937	128946	20 %	60 %	20 %	0 %	332798137
92	NC_015519	TTATA	2	10	129306	129315	40 %	60 %	0 %	0 %	332798137
93	NC_015519	TTTAT	2	10	129717	129726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015519	AGTTT	2	10	130364	130373	20 %	60 %	20 %	0 %	332798138
95	NC_015519	GGGAG	2	10	133984	133993	20 %	0 %	80 %	0 %	332798139
96	NC_015519	ATGAA	2	10	134564	134573	60 %	20 %	20 %	0 %	332798140
97	NC_015519	CATAT	2	10	135336	135345	40 %	40 %	0 %	20 %	332798140
98	NC_015519	TATAA	2	10	135640	135649	60 %	40 %	0 %	0 %	332798140
99	NC_015519	ATTAT	2	10	139235	139244	40 %	60 %	0 %	0 %	332798141
100	NC_015519	CAAAT	2	10	140566	140575	60 %	20 %	0 %	20 %	332798143
101	NC_015519	ACGAA	2	10	142103	142112	60 %	0 %	20 %	20 %	332798144
102	NC_015519	AATTT	2	10	143354	143363	40 %	60 %	0 %	0 %	332798145
103	NC_015519	AGGGA	2	10	143450	143459	40 %	0 %	60 %	0 %	332798145
104	NC_015519	TTAAA	2	10	144101	144110	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015519	ATTAA	2	10	144118	144127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015519	GAGGT	2	10	144384	144393	20 %	20 %	60 %	0 %	332798147
107	NC_015519	AAGGC	2	10	144765	144774	40 %	0 %	40 %	20 %	332798147
108	NC_015519	GCTGT	2	10	145209	145218	0 %	40 %	40 %	20 %	332798147
109	NC_015519	GTTTG	2	10	147024	147033	0 %	60 %	40 %	0 %	332798148
110	NC_015519	ATTTG	2	10	148485	148494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015519	ATATT	2	10	148621	148630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015519	TAACT	2	10	148695	148704	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015519	ATCCA	2	10	152044	152053	40 %	20 %	0 %	40 %	332798151
114	NC_015519	TTATT	2	10	152604	152613	20 %	80 %	0 %	0 %	332798152
115	NC_015519	TGACA	2	10	154188	154197	40 %	20 %	20 %	20 %	332798153
116	NC_015519	CAATA	2	10	155301	155310	60 %	20 %	0 %	20 %	332798154
117	NC_015519	ACTAA	2	10	156978	156987	60 %	20 %	0 %	20 %	332798156
118	NC_015519	AACGG	2	10	157412	157421	40 %	0 %	40 %	20 %	332798158
119	NC_015519	AAATA	2	10	158450	158459	80 %	20 %	0 %	0 %	332798159
120	NC_015519	TAATA	2	10	161570	161579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015519	CAGGG	2	10	162389	162398	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015519	AAGGC	2	10	163297	163306	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015519	AGATG	2	10	163429	163438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015519	GCCGT	2	10	164348	164357	0 %	20 %	40 %	40 %	332798165
125	NC_015519	TGCCA	2	10	164589	164598	20 %	20 %	20 %	40 %	332798165
126	NC_015519	TCCAA	2	10	164805	164814	40 %	20 %	0 %	40 %	332798165
127	NC_015519	TAGGG	2	10	166132	166141	20 %	20 %	60 %	0 %	332798167
128	NC_015519	CGCTT	2	10	166714	166723	0 %	40 %	20 %	40 %	332798167
129	NC_015519	ACGGT	2	10	167826	167835	20 %	20 %	40 %	20 %	332798167
130	NC_015519	TATAT	3	15	168782	168796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015519	GAATA	2	10	168807	168816	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015519	ATGCC	2	10	170105	170114	20 %	20 %	20 %	40 %	332798169
133	NC_015519	CATAA	2	10	170174	170183	60 %	20 %	0 %	20 %	332798169
134	NC_015519	GGTTT	2	10	170444	170453	0 %	60 %	40 %	0 %	332798170
135	NC_015519	TGCGG	2	10	170893	170902	0 %	20 %	60 %	20 %	332798171
136	NC_015519	GATAA	2	10	171947	171956	60 %	20 %	20 %	0 %	332798172
137	NC_015519	AGGGA	2	10	172503	172512	40 %	0 %	60 %	0 %	332798172
138	NC_015519	ATAAC	2	10	173214	173223	60 %	20 %	0 %	20 %	332798172
139	NC_015519	TAGAG	2	10	174122	174131	40 %	20 %	40 %	0 %	332798173
140	NC_015519	TGATA	2	10	175135	175144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_015519	ATTTT	2	10	345097	345106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_015519	AAAGA	2	10	345269	345278	80 %	0 %	20 %	0 %	332798328
251	NC_015519	TTTGA	2	10	346517	346526	20 %	60 %	20 %	0 %	332798329
252	NC_015519	ATTTA	3	15	348931	348945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015519	GGTAA	2	10	349338	349347	40 %	20 %	40 %	0 %	332798333
254	NC_015519	TGGGG	2	10	350081	350090	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015519	TAATT	2	10	351194	351203	40 %	60 %	0 %	0 %	332798335
256	NC_015519	ACAGT	2	10	351451	351460	40 %	20 %	20 %	20 %	332798335
257	NC_015519	ACCGA	2	10	351702	351711	40 %	0 %	20 %	40 %	332798335
258	NC_015519	AATTT	2	10	351753	351762	40 %	60 %	0 %	0 %	332798335
259	NC_015519	ATATT	2	10	351922	351931	40 %	60 %	0 %	0 %	332798335
260	NC_015519	TATCA	2	10	354650	354659	40 %	40 %	0 %	20 %	332798337
261	NC_015519	ATTAT	2	10	356738	356747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015519	TACAA	2	10	360178	360187	60 %	20 %	0 %	20 %	332798342
263	NC_015519	TTACA	2	10	363874	363883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
264	NC_015519	AAAAC	2	10	368081	368090	80 %	0 %	0 %	20 %	332798349
265	NC_015519	TAAAA	2	10	370104	370113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015519	TACAC	2	10	370996	371005	40 %	20 %	0 %	40 %	332798351
267	NC_015519	TAGTA	2	10	371068	371077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_015519	CAGGT	2	10	373613	373622	20 %	20 %	40 %	20 %	332798354
269	NC_015519	GTAAT	2	10	374400	374409	40 %	40 %	20 %	0 %	332798355
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