MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 5485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015519	GTT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015519	TAT	2	6	37	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015519	TTA	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015519	TTC	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015519	GAG	2	6	77	82	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015519	CAT	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015519	TTA	2	6	1591	1596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015519	TAC	5	15	1626	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015519	ATA	2	6	10830	10835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015519	GGT	2	6	12323	12328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015519	AGG	2	6	14018	14023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015519	GCA	2	6	16589	16594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015519	AGT	2	6	16694	16699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015519	ATA	2	6	18817	18822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015519	AGT	2	6	18913	18918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015519	ATT	2	6	18981	18986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015519	AGG	2	6	19212	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015519	TGG	2	6	20751	20756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015519	AAG	2	6	20841	20846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015519	TGA	2	6	22661	22666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015519	ATA	2	6	22807	22812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015519	AGG	2	6	26957	26962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015519	ATA	2	6	27164	27169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015519	ATG	2	6	28434	28439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015519	AGG	2	6	28453	28458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015519	TTG	2	6	28505	28510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015519	TCC	2	6	30518	30523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_015519	ATA	2	6	31350	31355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015519	TAA	2	6	31420	31425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015519	CAT	2	6	31454	31459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015519	CAT	2	6	31463	31468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015519	TAC	2	6	31589	31594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015519	ATT	2	6	31660	31665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015519	CTG	2	6	31666	31671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015519	TAC	3	9	31770	31778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015519	AAG	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015519	AAT	2	6	31926	31931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015519	CTT	2	6	32133	32138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015519	TGA	2	6	32205	32210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015519	ATA	3	9	32214	32222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015519	AAG	2	6	32245	32250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015519	TAG	2	6	32385	32390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015519	GGT	2	6	32454	32459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015519	AGG	2	6	32546	32551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015519	AGA	3	9	33455	33463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015519	TAG	2	6	33473	33478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015519	TCT	2	6	33481	33486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015519	TGT	2	6	33510	33515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015519	TAC	2	6	33893	33898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_015519	ATA	2	6	33958	33963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015519	AAG	2	6	36869	36874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015519	CCT	2	6	36925	36930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015519	AAT	2	6	36984	36989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015519	TAA	2	6	37031	37036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015519	TTA	2	6	37043	37048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015519	TAT	2	6	37156	37161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015519	AGA	2	6	37869	37874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015519	AAG	2	6	40771	40776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015519	GTT	2	6	44698	44703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015519	TTG	2	6	44740	44745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015519	CTT	2	6	44800	44805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015519	AAG	2	6	44814	44819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015519	AAG	2	6	44980	44985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015519	CGG	2	6	47463	47468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015519	TAA	2	6	50032	50037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015519	TGT	2	6	50043	50048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015519	ATT	2	6	50056	50061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015519	ATA	2	6	50067	50072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015519	TAA	2	6	50099	50104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015519	TTA	2	6	50734	50739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015519	TTA	2	6	50750	50755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015519	CTA	2	6	50762	50767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015519	TAT	2	6	50905	50910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015519	GAA	2	6	50954	50959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015519	ATA	2	6	50977	50982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015519	CAA	2	6	51153	51158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015519	GAA	2	6	51244	51249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015519	TTA	2	6	51256	51261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015519	TCC	2	6	52481	52486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_015519	ATT	2	6	54047	54052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015519	CTA	2	6	54234	54239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015519	TAA	2	6	54288	54293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015519	CAA	2	6	54315	54320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015519	ACA	2	6	54366	54371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015519	AAC	2	6	54405	54410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015519	AAT	2	6	54414	54419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015519	AGG	2	6	54431	54436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015519	AAT	2	6	54467	54472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015519	ATT	2	6	54498	54503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015519	ATG	2	6	54693	54698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015519	TAA	2	6	54788	54793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015519	GAC	2	6	54799	54804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015519	ACG	2	6	54984	54989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015519	TGG	2	6	55048	55053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015519	TGC	2	6	55099	55104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015519	TCC	2	6	55258	55263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015519	CCG	2	6	55322	55327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015519	GAA	2	6	55359	55364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015519	CTT	2	6	55390	55395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015519	TGA	2	6	55416	55421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015519	TTA	2	6	55521	55526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015519	TGC	2	6	55536	55541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015519	TAC	2	6	55584	55589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015519	GAT	2	6	55591	55596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015519	AGA	2	6	55630	55635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015519	GAT	2	6	55735	55740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015519	GAA	2	6	55863	55868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015519	ATT	2	6	55871	55876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015519	AAT	2	6	56366	56371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015519	TAT	2	6	56387	56392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015519	ATT	2	6	56418	56423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015519	AAC	2	6	56425	56430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015519	TCC	2	6	59495	59500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015519	GTA	2	6	59533	59538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015519	GGA	2	6	59660	59665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015519	AAC	2	6	60505	60510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015519	TAA	2	6	60516	60521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015519	ATA	2	6	60600	60605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015519	CTG	2	6	60637	60642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015519	GAG	2	6	60649	60654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015519	ATT	2	6	62546	62551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015519	TAA	2	6	62657	62662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015519	TGC	2	6	64062	64067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015519	ATA	3	9	64099	64107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015519	ATA	2	6	64116	64121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015519	CAA	2	6	64203	64208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015519	AAG	2	6	64232	64237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015519	ATA	2	6	64264	64269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015519	GGA	2	6	64309	64314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015519	ATG	2	6	68430	68435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015519	TGC	2	6	68456	68461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015519	GTA	2	6	68481	68486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015519	GGT	2	6	68538	68543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015519	TAA	2	6	68653	68658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015519	TAA	2	6	68689	68694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015519	GCA	2	6	68770	68775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015519	GTT	2	6	68935	68940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015519	ACT	2	6	68957	68962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015519	TGT	2	6	68976	68981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015519	AAC	2	6	69056	69061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015519	CAA	2	6	69153	69158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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