MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	GAGGAT	2	12	278	289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795694
2	NC_015518	AAAGAT	2	12	1063	1074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795694
3	NC_015518	TTCTCC	2	12	1981	1992	0 %	50 %	0 %	50 %	332795697
4	NC_015518	CCTTTA	2	12	2046	2057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332795697
5	NC_015518	AAACCT	2	12	2621	2632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795697
6	NC_015518	AAATAA	2	12	5512	5523	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795701
7	NC_015518	TATAGT	2	12	10165	10176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795706
8	NC_015518	TTAAGT	2	12	11654	11665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795706
9	NC_015518	AACAGA	2	12	12991	13002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332795708
10	NC_015518	TATAAT	2	12	14156	14167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015518	TAAGAT	2	12	14212	14223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795709
12	NC_015518	TTTCTC	2	12	18013	18024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795714
13	NC_015518	GCAGAA	2	12	28434	28445	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795721
14	NC_015518	TGACTA	2	12	40432	40443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795737
15	NC_015518	CTGTTT	2	12	43537	43548	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332795741
16	NC_015518	ACTTAC	2	12	43636	43647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795741
17	NC_015518	TCTCGC	2	12	45712	45723	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	332795743
18	NC_015518	AAGGTA	2	12	46804	46815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795744
19	NC_015518	TCATAA	2	12	51291	51302	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795750
20	NC_015518	AAGGAA	2	12	52234	52245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795751
21	NC_015518	ATTTTT	2	12	55185	55196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015518	TTTCAG	2	12	55821	55832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795754
23	NC_015518	CTATTA	2	12	65729	65740	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795763
24	NC_015518	AAATAT	2	12	67198	67209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795764
25	NC_015518	TCCTTC	2	12	68176	68187	0 %	50 %	0 %	50 %	332795765
26	NC_015518	ATTCAT	2	12	71453	71464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795768
27	NC_015518	CTATTA	2	12	73281	73292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795770
28	NC_015518	AGAAAG	2	12	73686	73697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795771
29	NC_015518	TGATAC	2	12	74131	74142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795771
30	NC_015518	TTGTGT	2	12	77740	77751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795776
31	NC_015518	AGATAT	2	12	89529	89540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795787
32	NC_015518	ACAAAA	2	12	90161	90172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015518	AGCTAA	2	12	91461	91472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795789
34	NC_015518	TTAAAT	2	12	92514	92525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015518	TCCTTT	2	12	96115	96126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795793
36	NC_015518	TATTGC	2	12	97888	97899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795794
37	NC_015518	TTATAT	2	12	98826	98837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795794
38	NC_015518	GAAATG	2	12	100403	100414	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795795
39	NC_015518	TCATTA	2	12	102304	102315	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795798
40	NC_015518	GAACGA	2	12	104320	104331	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795801
41	NC_015518	TAGCCT	2	12	109860	109871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332795807
42	NC_015518	TTTAGG	2	12	114756	114767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795812
43	NC_015518	AATAAA	2	12	118607	118618	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795814
44	NC_015518	ATCTCC	2	12	119839	119850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332795815
45	NC_015518	AAGCAA	2	12	124212	124223	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332795818
46	NC_015518	TCCTTT	2	12	126183	126194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795821
47	NC_015518	TTTTTA	2	12	127637	127648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015518	GAATAA	2	12	131539	131550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795826
49	NC_015518	TTTAAA	2	12	134398	134409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015518	TAAAAA	2	12	134435	134446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015518	ATAATC	2	12	136717	136728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795832
52	NC_015518	TATTGG	2	12	137187	137198	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795833
53	NC_015518	AGCAAT	2	12	140170	140181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795835
54	NC_015518	GCATTT	2	12	140724	140735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795835
55	NC_015518	AGAAGG	2	12	143192	143203	50 %	0 %	50 %	0 %	332795837
56	NC_015518	ACTATT	2	12	145693	145704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795839
57	NC_015518	AAAAAT	2	12	148544	148555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795840
58	NC_015518	TCCGCC	2	12	157482	157493	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	332795850
59	NC_015518	ATTGTT	2	12	157730	157741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332795851
60	NC_015518	TTTTCC	2	12	159414	159425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795852
61	NC_015518	AGATGG	2	12	160672	160683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795853
62	NC_015518	ATATAA	2	12	161856	161867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015518	ATAACA	2	12	165251	165262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332795855
64	NC_015518	GGAAAA	2	12	166979	166990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795857
65	NC_015518	AAATAA	2	12	167316	167327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332795857
66	NC_015518	GAAATT	2	12	167472	167483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015518	AAGCGG	2	12	168739	168750	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015518	ATTCCT	2	12	171029	171040	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332795860
69	NC_015518	TCATTG	2	12	171243	171254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795860
70	NC_015518	ATAGGT	2	12	172215	172226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795860
71	NC_015518	ATTTAA	2	12	174194	174205	50 %	50 %	0 %	0 %	332795861
72	NC_015518	TCAATT	2	12	174857	174868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332795862
73	NC_015518	GGCATA	2	12	177120	177131	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795863
74	NC_015518	AGGAAA	2	12	178001	178012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795864
75	NC_015518	GGCATT	2	12	178658	178669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332795865
76	NC_015518	TAGTAT	2	12	180373	180384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015518	ATTTAG	2	12	183054	183065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795871
78	NC_015518	GTCAAG	2	12	184000	184011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795872
79	NC_015518	ATTGTA	2	12	190523	190534	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795878
80	NC_015518	AAATAC	2	12	191231	191242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332795878
81	NC_015518	AAATAT	2	12	195028	195039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795881
82	NC_015518	ATATAA	2	12	195365	195376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015518	ATTCAA	2	12	196452	196463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795882
84	NC_015518	TGCTTT	2	12	198059	198070	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332795885
85	NC_015518	TAGGAG	2	12	201480	201491	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795888
86	NC_015518	TCTTCA	2	12	202757	202768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015518	TAACAT	2	12	204101	204112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332795892
88	NC_015518	CCTTCT	2	12	207785	207796	0 %	50 %	0 %	50 %	332795897
89	NC_015518	TTAATT	2	12	210212	210223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795901
90	NC_015518	TTTACT	2	12	215034	215045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332795904
91	NC_015518	ATATAA	2	12	218532	218543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015518	TGACTA	2	12	223926	223937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015518	ATTAAT	2	12	224444	224455	50 %	50 %	0 %	0 %	332795914
94	NC_015518	CAAGAG	2	12	226099	226110	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332795916
95	NC_015518	TATTGG	2	12	232182	232193	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795924
96	NC_015518	TTAGGA	2	12	233697	233708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795925
97	NC_015518	TGGATA	2	12	234581	234592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795925
98	NC_015518	TGGAGG	2	12	237227	237238	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	332795926
99	NC_015518	TAGCTT	2	12	238732	238743	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332795929
100	NC_015518	TATAAT	2	12	240074	240085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015518	TATAAA	2	12	240256	240267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015518	GGTATT	2	12	243728	243739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332795937
103	NC_015518	TTATAT	2	12	243883	243894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015518	TAAGAT	2	12	245028	245039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795940
105	NC_015518	TAATGT	2	12	245252	245263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332795940
106	NC_015518	AAATGA	2	12	245438	245449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795940
107	NC_015518	GGGCAA	2	12	251064	251075	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332795944
108	NC_015518	CTTTCT	2	12	251353	251364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795944
109	NC_015518	CTCTAG	2	12	253670	253681	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332795947
110	NC_015518	TCCTTT	2	12	260199	260210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795955
111	NC_015518	TTTATT	2	12	260717	260728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015518	AGCTAA	2	12	270414	270425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332795966
113	NC_015518	AATGCG	2	12	274037	274048	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332795971
114	NC_015518	TAAAAA	2	12	276666	276677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015518	CTTCTC	2	12	282503	282514	0 %	50 %	0 %	50 %	332795980
116	NC_015518	GAAGTA	2	12	283066	283077	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332795980
117	NC_015518	AATCCA	2	12	284223	284234	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795981
118	NC_015518	TCCAAA	2	12	285581	285592	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332795982
119	NC_015518	TAATGA	2	12	290351	290362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015518	TATAGA	2	12	294707	294718	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332795989
121	NC_015518	TGGAGA	2	12	295131	295142	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	332795990
122	NC_015518	GCCTAA	2	12	295290	295301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332795990
123	NC_015518	ATAATT	2	12	296322	296333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015518	TCTTTT	2	12	298756	298767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015518	CTACTC	2	12	299251	299262	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332795994
126	NC_015518	TTACAG	2	12	300034	300045	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332795994
127	NC_015518	GATAAA	2	12	300475	300486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332795995
128	NC_015518	AGGTAA	2	12	305999	306010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015518	TTCCTT	2	12	306893	306904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332796003
130	NC_015518	TCGTAT	2	12	309254	309265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_015518	CAGATA	2	12	309484	309495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332796005
132	NC_015518	GATTTA	2	12	312488	312499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332796008
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141	NC_015518	GCCTAT	2	12	339441	339452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332796031
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143	NC_015518	TATTAA	2	12	347997	348008	50 %	50 %	0 %	0 %	332796036
144	NC_015518	AATTTT	2	12	354443	354454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015518	GACCTT	2	12	356202	356213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015518	TTAAAA	2	12	359406	359417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_015518	AATCTA	2	12	381227	381238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_015518	ATTAAA	2	12	384268	384279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332796071
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156	NC_015518	TATAAA	2	12	388035	388046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332796075
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168	NC_015518	ATTATA	2	12	411397	411408	50 %	50 %	0 %	0 %	332796100
169	NC_015518	AGCATA	2	12	416517	416528	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332796106
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175	NC_015518	TTTGTT	2	12	435591	435602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015518	AAAAGT	2	12	435621	435632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_015518	CAGGGG	2	12	453788	453799	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	332796147
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220	NC_015518	TCAGTA	2	12	577416	577427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332796291
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222	NC_015518	TCTATT	2	12	578403	578414	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332796292
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233	NC_015518	TTAAAT	2	12	604138	604149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_015518	AATAGA	2	12	611893	611904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332796326
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239	NC_015518	AAAAAT	2	12	638934	638945	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332796361
240	NC_015518	ATTTTC	2	12	641263	641274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332796363
241	NC_015518	TGTAAC	2	12	646519	646530	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332796370
242	NC_015518	AGAGAA	2	12	647085	647096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332796371
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244	NC_015518	GCATTA	2	12	652285	652296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332796380
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247	NC_015518	TAGGCT	2	12	656213	656224	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332796386
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249	NC_015518	ATCCAG	2	12	656810	656821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332796387
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266	NC_015518	ACTCCT	2	12	692470	692481	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	332796424
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269	NC_015518	TTAAGT	2	12	695332	695343	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332796427
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334	NC_015518	GTGCTG	2	12	858114	858125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332796630
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340	NC_015518	ATTTAT	2	12	868805	868816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332796644
341	NC_015518	ATTTAT	2	12	868929	868940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332796644
342	NC_015518	TTTATG	2	12	869055	869066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332796644
343	NC_015518	CCGCTG	2	12	869883	869894	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332796644
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347	NC_015518	TTTTAT	2	12	891384	891395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_015518	AACTTT	2	12	902556	902567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332796684
349	NC_015518	ATTAAT	2	12	903609	903620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_015518	AATGAT	2	12	904147	904158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332796686
351	NC_015518	ATTACC	2	12	906736	906747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332796689
352	NC_015518	AGGAGA	2	12	908084	908095	50 %	0 %	50 %	0 %	332796690
353	NC_015518	TAAATA	2	12	908307	908318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332796690
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