MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	TATAAT	2	12	14156	14167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015518	ATTTTT	2	12	55185	55196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015518	ACAAAA	2	12	90161	90172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015518	TTAAAT	2	12	92514	92525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015518	TTTTTA	2	12	127637	127648	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015518	TTTAAA	2	12	134398	134409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015518	TAAAAA	2	12	134435	134446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015518	ATATAA	2	12	161856	161867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015518	GAAATT	2	12	167472	167483	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015518	AAGCGG	2	12	168739	168750	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015518	TAGTAT	2	12	180373	180384	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015518	ATATAA	2	12	195365	195376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015518	TCTTCA	2	12	202757	202768	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015518	ATATAA	2	12	218532	218543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015518	TGACTA	2	12	223926	223937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015518	TATAAT	2	12	240074	240085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015518	TATAAA	2	12	240256	240267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015518	TTATAT	2	12	243883	243894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015518	TTTATT	2	12	260717	260728	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015518	TAAAAA	2	12	276666	276677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015518	TAATGA	2	12	290351	290362	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015518	ATAATT	2	12	296322	296333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015518	TCTTTT	2	12	298756	298767	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015518	AGGTAA	2	12	305999	306010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015518	TCGTAT	2	12	309254	309265	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015518	AATTTT	2	12	354443	354454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015518	GACCTT	2	12	356202	356213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015518	TTAAAA	2	12	359406	359417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015518	TTTTTA	2	12	374931	374942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015518	AATCTA	2	12	381227	381238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015518	CCTAAA	2	12	384856	384867	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015518	TTCATC	2	12	435527	435538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015518	TTTGTT	2	12	435591	435602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015518	AAAAGT	2	12	435621	435632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015518	TTTATG	2	12	441297	441308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015518	ATTCTC	2	12	453161	453172	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015518	TAAAAA	2	12	566708	566719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015518	GAAAGT	2	12	573663	573674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015518	AATATT	2	12	577565	577576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015518	TTAAAT	2	12	604138	604149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015518	ATTATA	2	12	690769	690780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015518	GTTAAA	2	12	759491	759502	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015518	AAATAA	2	12	772692	772703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015518	TTCTTT	2	12	847604	847615	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015518	TAATAT	2	12	868326	868337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015518	TTTTAT	2	12	891384	891395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015518	ATTAAT	2	12	903609	903620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015518	GTTAAA	2	12	910147	910158	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015518	TTTTTA	2	12	923416	923427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015518	AATACA	2	12	950603	950614	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015518	AGAAAT	2	12	1048489	1048500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015518	TTATTT	2	12	1093854	1093865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015518	GGGCTT	2	12	1119010	1119021	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015518	AAGATG	2	12	1170389	1170400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015518	AAAATA	2	12	1200776	1200787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015518	CCCGCA	2	12	1293579	1293590	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015518	GAAAGG	2	12	1299276	1299287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015518	ATTTTA	2	12	1315536	1315547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015518	ATTTAT	2	12	1327161	1327172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015518	TTAAAT	2	12	1347140	1347151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015518	AAATTC	2	12	1400836	1400847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015518	TTGTAT	2	12	1402527	1402538	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015518	TAATTT	2	12	1415184	1415195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015518	TACTTT	2	12	1430485	1430496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015518	TAATTT	2	12	1441745	1441756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015518	TAAATA	2	12	1448472	1448483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015518	AAATCT	2	12	1452178	1452189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015518	ATGTCA	2	12	1463544	1463555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_015518	GTATGT	2	12	1490243	1490254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015518	TACTGG	2	12	1490278	1490289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015518	TAAATC	2	12	1503010	1503021	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015518	TATTTT	2	12	1505227	1505238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015518	TTAACT	2	12	1513149	1513160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015518	AAAAGA	2	12	1519962	1519973	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015518	ATCTCA	2	12	1556222	1556233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015518	TTGCAT	2	12	1557123	1557134	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015518	CCCTTT	2	12	1584259	1584270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015518	AATTGA	2	12	1588716	1588727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015518	AATTAA	2	12	1599597	1599608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015518	CTAACT	2	12	1611269	1611280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015518	ATTTAA	2	12	1623720	1623731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015518	CCGGAA	2	12	1664216	1664227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015518	ATAAAA	2	12	1698571	1698582	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015518	TTCTTT	2	12	1718982	1718993	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015518	TTATAA	2	12	1734106	1734117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015518	AAGTAA	2	12	1745494	1745505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015518	TTTACT	2	12	1750468	1750479	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_015518	AAAAGA	2	12	1751022	1751033	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015518	CTATTT	2	12	1803850	1803861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_015518	TACTTC	2	12	1829080	1829091	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015518	TATAAA	2	12	1843919	1843930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015518	ATATAA	2	12	1844200	1844211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015518	CTTTTT	2	12	1856642	1856653	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015518	ATACTT	2	12	1882640	1882651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_015518	AAATAA	2	12	1897593	1897604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015518	GGGGGT	2	12	1945334	1945345	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015518	TCAAAT	2	12	1946018	1946029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_015518	ATATTT	2	12	2024721	2024732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015518	AAGATA	2	12	2044903	2044914	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015518	CTTGAC	2	12	2049466	2049477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015518	GTTAAT	2	12	2071754	2071765	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015518	GATCAT	2	12	2100955	2100966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015518	AATAGG	2	12	2125552	2125563	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015518	ATTAGC	2	12	2125663	2125674	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.