MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	TTCCA	2	10	900	909	20 %	40 %	0 %	40 %	332795694
2	NC_015518	AATTC	2	10	2106	2115	40 %	40 %	0 %	20 %	332795697
3	NC_015518	ATCTC	2	10	2363	2372	20 %	40 %	0 %	40 %	332795697
4	NC_015518	GAAGT	2	10	4005	4014	40 %	20 %	40 %	0 %	332795700
5	NC_015518	TTATC	2	10	6347	6356	20 %	60 %	0 %	20 %	332795703
6	NC_015518	GTCTG	2	10	6422	6431	0 %	40 %	40 %	20 %	332795703
7	NC_015518	TTTTA	2	10	7720	7729	20 %	80 %	0 %	0 %	332795704
8	NC_015518	GTATA	2	10	8537	8546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015518	TATTT	2	10	8818	8827	20 %	80 %	0 %	0 %	332795705
10	NC_015518	TTTTA	2	10	9146	9155	20 %	80 %	0 %	0 %	332795705
11	NC_015518	AATTT	2	10	9648	9657	40 %	60 %	0 %	0 %	332795706
12	NC_015518	ATTTA	2	10	10107	10116	40 %	60 %	0 %	0 %	332795706
13	NC_015518	AGAAA	2	10	11570	11579	80 %	0 %	20 %	0 %	332795706
14	NC_015518	TACTA	2	10	12083	12092	40 %	40 %	0 %	20 %	332795707
15	NC_015518	CTTAT	2	10	12411	12420	20 %	60 %	0 %	20 %	332795707
16	NC_015518	ATAGT	2	10	13975	13984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015518	AAGGT	2	10	14059	14068	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015518	TATAG	2	10	14276	14285	40 %	40 %	20 %	0 %	332795709
19	NC_015518	AATCC	2	10	19511	19520	40 %	20 %	0 %	40 %	332795714
20	NC_015518	AAGTT	2	10	19936	19945	40 %	40 %	20 %	0 %	332795715
21	NC_015518	ATAAA	2	10	20607	20616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015518	AACCT	2	10	20679	20688	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015518	AGATA	2	10	21137	21146	60 %	20 %	20 %	0 %	332795716
24	NC_015518	ATTTA	2	10	22706	22715	40 %	60 %	0 %	0 %	332795718
25	NC_015518	TCAAA	2	10	23086	23095	60 %	20 %	0 %	20 %	332795718
26	NC_015518	TAAAA	2	10	26330	26339	80 %	20 %	0 %	0 %	332795719
27	NC_015518	TAAAG	2	10	28951	28960	60 %	20 %	20 %	0 %	332795722
28	NC_015518	ATAAA	2	10	31034	31043	80 %	20 %	0 %	0 %	332795724
29	NC_015518	AAATG	2	10	31127	31136	60 %	20 %	20 %	0 %	332795724
30	NC_015518	TGTAT	2	10	31659	31668	20 %	60 %	20 %	0 %	332795725
31	NC_015518	ATTGC	2	10	32352	32361	20 %	40 %	20 %	20 %	332795727
32	NC_015518	GTAAT	2	10	32421	32430	40 %	40 %	20 %	0 %	332795727
33	NC_015518	CCAGC	2	10	32623	32632	20 %	0 %	20 %	60 %	332795727
34	NC_015518	ATTTG	2	10	33158	33167	20 %	60 %	20 %	0 %	332795727
35	NC_015518	TATAA	2	10	34035	34044	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015518	AAAGA	2	10	34071	34080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015518	GGAAA	2	10	41055	41064	60 %	0 %	40 %	0 %	332795737
38	NC_015518	CTACT	2	10	41364	41373	20 %	40 %	0 %	40 %	332795738
39	NC_015518	GATAA	2	10	42950	42959	60 %	20 %	20 %	0 %	332795740
40	NC_015518	TCTTT	2	10	45592	45601	0 %	80 %	0 %	20 %	332795743
41	NC_015518	AAAAT	2	10	46183	46192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015518	AGAAA	2	10	46646	46655	80 %	0 %	20 %	0 %	332795744
43	NC_015518	AAAAG	2	10	47195	47204	80 %	0 %	20 %	0 %	332795744
44	NC_015518	ATTCT	2	10	48086	48095	20 %	60 %	0 %	20 %	332795745
45	NC_015518	CGTCA	2	10	50417	50426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_015518	AAAAT	2	10	50455	50464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015518	GAAAT	2	10	50736	50745	60 %	20 %	20 %	0 %	332795749
48	NC_015518	ACTCT	2	10	52629	52638	20 %	40 %	0 %	40 %	332795751
49	NC_015518	AAAGT	2	10	55805	55814	60 %	20 %	20 %	0 %	332795754
50	NC_015518	AAAGG	2	10	55931	55940	60 %	0 %	40 %	0 %	332795754
51	NC_015518	TATAA	2	10	56967	56976	60 %	40 %	0 %	0 %	332795755
52	NC_015518	TTTTC	2	10	57239	57248	0 %	80 %	0 %	20 %	332795755
53	NC_015518	TACCT	2	10	57351	57360	20 %	40 %	0 %	40 %	332795755
54	NC_015518	TATAA	2	10	57570	57579	60 %	40 %	0 %	0 %	332795755
55	NC_015518	CCTAT	2	10	57580	57589	20 %	40 %	0 %	40 %	332795755
56	NC_015518	ATGCC	2	10	57953	57962	20 %	20 %	20 %	40 %	332795755
57	NC_015518	TATCT	2	10	59528	59537	20 %	60 %	0 %	20 %	332795757
58	NC_015518	TTGAA	2	10	60398	60407	40 %	40 %	20 %	0 %	332795758
59	NC_015518	ATGAA	2	10	61876	61885	60 %	20 %	20 %	0 %	332795759
60	NC_015518	TATGC	2	10	63342	63351	20 %	40 %	20 %	20 %	332795760
61	NC_015518	AATTA	2	10	64094	64103	60 %	40 %	0 %	0 %	332795760
62	NC_015518	TTAAA	2	10	65189	65198	60 %	40 %	0 %	0 %	332795761
63	NC_015518	TTTTA	2	10	65688	65697	20 %	80 %	0 %	0 %	332795763
64	NC_015518	AAATG	2	10	67073	67082	60 %	20 %	20 %	0 %	332795764
65	NC_015518	TGAAA	2	10	67411	67420	60 %	20 %	20 %	0 %	332795764
66	NC_015518	GAGTA	2	10	67599	67608	40 %	20 %	40 %	0 %	332795764
67	NC_015518	ATTAA	2	10	68489	68498	60 %	40 %	0 %	0 %	332795765
68	NC_015518	TAGAA	2	10	68859	68868	60 %	20 %	20 %	0 %	332795765
69	NC_015518	TATAA	2	10	69157	69166	60 %	40 %	0 %	0 %	332795765
70	NC_015518	TTTCC	2	10	69540	69549	0 %	60 %	0 %	40 %	332795765
71	NC_015518	AAGGA	2	10	69779	69788	60 %	0 %	40 %	0 %	332795766
72	NC_015518	AATAT	2	10	70400	70409	60 %	40 %	0 %	0 %	332795767
73	NC_015518	TATTT	2	10	71671	71680	20 %	80 %	0 %	0 %	332795769
74	NC_015518	ATTTT	2	10	73310	73319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015518	CTAGA	2	10	73539	73548	40 %	20 %	20 %	20 %	332795771
76	NC_015518	AGTTG	2	10	73837	73846	20 %	40 %	40 %	0 %	332795771
77	NC_015518	TATCT	2	10	75327	75336	20 %	60 %	0 %	20 %	332795772
78	NC_015518	TTTTA	2	10	75477	75486	20 %	80 %	0 %	0 %	332795772
79	NC_015518	TTTCT	2	10	76336	76345	0 %	80 %	0 %	20 %	332795773
80	NC_015518	ATAAA	2	10	76633	76642	80 %	20 %	0 %	0 %	332795774
81	NC_015518	TAATA	2	10	77110	77119	60 %	40 %	0 %	0 %	332795775
82	NC_015518	AGTAT	2	10	78552	78561	40 %	40 %	20 %	0 %	332795776
83	NC_015518	ATTCT	2	10	79059	79068	20 %	60 %	0 %	20 %	332795777
84	NC_015518	TTAAT	2	10	79567	79576	40 %	60 %	0 %	0 %	332795777
85	NC_015518	TGATT	2	10	79908	79917	20 %	60 %	20 %	0 %	332795777
86	NC_015518	CTATT	2	10	80206	80215	20 %	60 %	0 %	20 %	332795777
87	NC_015518	TAGAT	2	10	80482	80491	40 %	40 %	20 %	0 %	332795778
88	NC_015518	TTATC	2	10	82072	82081	20 %	60 %	0 %	20 %	332795779
89	NC_015518	CTTTA	2	10	82488	82497	20 %	60 %	0 %	20 %	332795780
90	NC_015518	CCAGC	2	10	84038	84047	20 %	0 %	20 %	60 %	332795781
91	NC_015518	AAAGC	2	10	84065	84074	60 %	0 %	20 %	20 %	332795781
92	NC_015518	GATAT	2	10	84515	84524	40 %	40 %	20 %	0 %	332795781
93	NC_015518	TCATA	2	10	85154	85163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015518	CTATA	2	10	87195	87204	40 %	40 %	0 %	20 %	332795785
95	NC_015518	TTTTA	2	10	87305	87314	20 %	80 %	0 %	0 %	332795785
96	NC_015518	TTTTA	2	10	87322	87331	20 %	80 %	0 %	0 %	332795785
97	NC_015518	TTTAT	2	10	88029	88038	20 %	80 %	0 %	0 %	332795785
98	NC_015518	GATTT	2	10	88863	88872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015518	AGCAT	2	10	90329	90338	40 %	20 %	20 %	20 %	332795788
100	NC_015518	AAAGT	2	10	90540	90549	60 %	20 %	20 %	0 %	332795788
101	NC_015518	GAAAA	2	10	91597	91606	80 %	0 %	20 %	0 %	332795789
102	NC_015518	AAGTA	2	10	91764	91773	60 %	20 %	20 %	0 %	332795789
103	NC_015518	TTTCT	2	10	91856	91865	0 %	80 %	0 %	20 %	332795789
104	NC_015518	GATTT	2	10	91927	91936	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015518	GGAAA	2	10	92144	92153	60 %	0 %	40 %	0 %	332795790
106	NC_015518	GAAAT	2	10	92276	92285	60 %	20 %	20 %	0 %	332795790
107	NC_015518	AAAGA	2	10	92557	92566	80 %	0 %	20 %	0 %	332795791
108	NC_015518	TGGTT	2	10	92910	92919	0 %	60 %	40 %	0 %	332795791
109	NC_015518	CTTAG	2	10	92964	92973	20 %	40 %	20 %	20 %	332795791
110	NC_015518	ATTAT	2	10	93036	93045	40 %	60 %	0 %	0 %	332795791
111	NC_015518	TTTCC	2	10	95535	95544	0 %	60 %	0 %	40 %	332795793
112	NC_015518	TTGAG	2	10	96958	96967	20 %	40 %	40 %	0 %	332795794
113	NC_015518	GATAA	2	10	98341	98350	60 %	20 %	20 %	0 %	332795794
114	NC_015518	AGTTA	2	10	98353	98362	40 %	40 %	20 %	0 %	332795794
115	NC_015518	AAAAT	2	10	100176	100185	80 %	20 %	0 %	0 %	332795795
116	NC_015518	CTTTT	2	10	102688	102697	0 %	80 %	0 %	20 %	332795798
117	NC_015518	TACCT	2	10	104229	104238	20 %	40 %	0 %	40 %	332795801
118	NC_015518	AAAAG	2	10	105166	105175	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015518	AATGG	2	10	105281	105290	40 %	20 %	40 %	0 %	332795803
120	NC_015518	TAATC	2	10	105774	105783	40 %	40 %	0 %	20 %	332795804
121	NC_015518	GATAA	2	10	107714	107723	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015518	ATTTA	2	10	109080	109089	40 %	60 %	0 %	0 %	332795807
123	NC_015518	AAATG	2	10	109246	109255	60 %	20 %	20 %	0 %	332795807
124	NC_015518	ATAAA	2	10	110298	110307	80 %	20 %	0 %	0 %	332795807
125	NC_015518	TAAGG	2	10	110831	110840	40 %	20 %	40 %	0 %	332795808
126	NC_015518	AGTTA	2	10	111093	111102	40 %	40 %	20 %	0 %	332795809
127	NC_015518	TTTTA	2	10	112139	112148	20 %	80 %	0 %	0 %	332795810
128	NC_015518	TTATT	2	10	112498	112507	20 %	80 %	0 %	0 %	332795810
129	NC_015518	AGAAT	2	10	113640	113649	60 %	20 %	20 %	0 %	332795811
130	NC_015518	AAGAA	2	10	117532	117541	80 %	0 %	20 %	0 %	332795814
131	NC_015518	CCTTT	2	10	117616	117625	0 %	60 %	0 %	40 %	332795814
132	NC_015518	TTGCT	2	10	118915	118924	0 %	60 %	20 %	20 %	332795815
133	NC_015518	GAATT	2	10	119259	119268	40 %	40 %	20 %	0 %	332795815
134	NC_015518	TAGAA	2	10	119661	119670	60 %	20 %	20 %	0 %	332795815
135	NC_015518	AGCAG	2	10	123752	123761	40 %	0 %	40 %	20 %	332795817
136	NC_015518	ATCAT	2	10	124474	124483	40 %	40 %	0 %	20 %	332795819
137	NC_015518	ATAAA	2	10	125818	125827	80 %	20 %	0 %	0 %	332795820
138	NC_015518	ATCTA	2	10	126470	126479	40 %	40 %	0 %	20 %	332795821
139	NC_015518	TAATC	2	10	126523	126532	40 %	40 %	0 %	20 %	332795821
140	NC_015518	GCTAT	2	10	127002	127011	20 %	40 %	20 %	20 %	332795822
141	NC_015518	TAATG	2	10	127401	127410	40 %	40 %	20 %	0 %	332795822
142	NC_015518	TTATA	3	15	127763	127777	40 %	60 %	0 %	0 %	332795823
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146	NC_015518	AACTT	2	10	131075	131084	40 %	40 %	0 %	20 %	332795826
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151	NC_015518	TTTTC	2	10	134300	134309	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015518	CTTTT	2	10	134793	134802	0 %	80 %	0 %	20 %	332795831
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157	NC_015518	CTTCT	2	10	140479	140488	0 %	60 %	0 %	40 %	332795835
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161	NC_015518	AGATC	2	10	144213	144222	40 %	20 %	20 %	20 %	332795838
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164	NC_015518	CTTTC	2	10	149919	149928	0 %	60 %	0 %	40 %	332795843
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174	NC_015518	TATAA	2	10	165158	165167	60 %	40 %	0 %	0 %	332795855
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182	NC_015518	TTGTT	2	10	172318	172327	0 %	80 %	20 %	0 %	332795860
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186	NC_015518	TTTTA	2	10	173482	173491	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015518	ATTAT	2	10	173562	173571	40 %	60 %	0 %	0 %	332795861
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199	NC_015518	TATCA	2	10	182390	182399	40 %	40 %	0 %	20 %	332795870
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249	NC_015518	TATCT	2	10	244017	244026	20 %	60 %	0 %	20 %	332795938
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251	NC_015518	ATTTT	2	10	247153	247162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015518	TTTAA	2	10	248455	248464	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_015518	ACTCT	2	10	248555	248564	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_015518	AAAAG	2	10	249683	249692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_015518	AAACA	2	10	249708	249717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_015518	TTTCA	2	10	249822	249831	20 %	60 %	0 %	20 %	332795943
257	NC_015518	CGTAG	2	10	250048	250057	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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259	NC_015518	TACCT	2	10	252441	252450	20 %	40 %	0 %	40 %	332795945
260	NC_015518	TTCCA	2	10	252486	252495	20 %	40 %	0 %	40 %	332795945
261	NC_015518	ATTTT	2	10	252541	252550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_015518	TTATT	2	10	253311	253320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_015518	CTTTG	2	10	256179	256188	0 %	60 %	20 %	20 %	332795950
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265	NC_015518	AGATG	2	10	258439	258448	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
266	NC_015518	CTTCC	2	10	261870	261879	0 %	40 %	0 %	60 %	332795958
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269	NC_015518	TCCTC	2	10	264812	264821	0 %	40 %	0 %	60 %	332795961
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405	NC_015518	TCTAA	2	10	407109	407118	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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443	NC_015518	TTTAT	2	10	435541	435550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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