MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 1009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	CTCA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015518	TCTT	2	8	6074	6081	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015518	CTTG	2	8	8624	8631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015518	TAAG	2	8	8670	8677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015518	TAGA	2	8	13825	13832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015518	TAAT	2	8	14047	14054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015518	TATT	2	8	14179	14186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015518	GATT	2	8	20716	20723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015518	ACAA	2	8	31990	31997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015518	TAAA	2	8	34059	34066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015518	ATAA	2	8	34082	34089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015518	ATTT	2	8	36571	36578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015518	TCAG	2	8	50380	50387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015518	TTCA	2	8	50399	50406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015518	AACT	2	8	50435	50442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015518	TATG	2	8	52713	52720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015518	AAAG	2	8	62111	62118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015518	ATAA	2	8	62290	62297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015518	GATT	2	8	62755	62762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015518	TAAA	2	8	62855	62862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015518	AAAT	2	8	63082	63089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015518	TTCA	2	8	63216	63223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015518	GTCG	2	8	66593	66600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015518	TTCT	2	8	77548	77555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015518	AAAT	2	8	85264	85271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015518	ATGT	2	8	86019	86026	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015518	TAAA	2	8	86038	86045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015518	TTTA	2	8	88846	88853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015518	TATT	2	8	92464	92471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015518	TTTA	2	8	95294	95301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015518	TGCA	2	8	95389	95396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_015518	AAAC	2	8	103156	103163	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015518	AAAG	2	8	104083	104090	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015518	AGAA	2	8	105095	105102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015518	GTTT	2	8	106337	106344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015518	TTTA	2	8	107622	107629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015518	AAAT	2	8	126546	126553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015518	GAAA	2	8	126660	126667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015518	AAGA	2	8	128641	128648	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015518	TTTA	2	8	134537	134544	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015518	CTTT	2	8	141554	141561	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015518	TCTT	2	8	141605	141612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015518	ACTT	2	8	142977	142984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015518	TCTA	2	8	144800	144807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015518	GACT	2	8	144919	144926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015518	GATA	2	8	144933	144940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015518	TGAA	2	8	144967	144974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015518	ATTA	2	8	144985	144992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015518	TAAG	2	8	149085	149092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015518	ATAA	2	8	152195	152202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015518	TCTT	2	8	152250	152257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015518	AAAG	2	8	152428	152435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015518	GGAT	2	8	152465	152472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015518	TCCT	2	8	153764	153771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015518	TTTA	2	8	153799	153806	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015518	ACTA	2	8	155793	155800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015518	TTAA	2	8	161833	161840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015518	TTCT	2	8	161895	161902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015518	ATTT	2	8	168055	168062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015518	TACT	2	8	168533	168540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015518	TTAC	2	8	169095	169102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015518	AAAT	2	8	169162	169169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015518	AAAT	2	8	170877	170884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015518	TAAA	2	8	170952	170959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015518	TTAT	2	8	173270	173277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015518	AATT	2	8	173383	173390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015518	TGAA	2	8	173511	173518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015518	ATTA	2	8	174686	174693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015518	GAAA	2	8	180879	180886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015518	AGTA	2	8	180895	180902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015518	CTTA	2	8	183554	183561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015518	AGGA	2	8	184887	184894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015518	GGAT	2	8	185272	185279	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015518	AATA	2	8	186558	186565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015518	AATT	2	8	187112	187119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015518	TATT	2	8	190363	190370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015518	TTTC	2	8	190468	190475	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015518	TATT	2	8	195344	195351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015518	AAGA	2	8	199535	199542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015518	ATTT	2	8	201216	201223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015518	AAGG	2	8	202794	202801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015518	CATA	2	8	206385	206392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015518	AATA	2	8	206515	206522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015518	TAAT	2	8	206903	206910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015518	AAGA	2	8	207700	207707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015518	AAAT	2	8	208869	208876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015518	AGAA	2	8	209638	209645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015518	TATC	2	8	213732	213739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015518	TGCA	2	8	214040	214047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015518	GAAA	2	8	214329	214336	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015518	ATTA	2	8	214449	214456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015518	TTTG	2	8	218725	218732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015518	ATAA	2	8	220074	220081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015518	GAAA	2	8	221809	221816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015518	TTAA	2	8	224555	224562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015518	TTAA	2	8	224601	224608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015518	TTTA	2	8	225036	225043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015518	TAAA	2	8	225454	225461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015518	ACTA	2	8	225515	225522	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015518	TCAA	2	8	227052	227059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015518	AATA	2	8	227188	227195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015518	ATTT	2	8	227766	227773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015518	TAAA	2	8	227822	227829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015518	TCTT	2	8	227850	227857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015518	TATT	2	8	238062	238069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015518	TAAA	2	8	241883	241890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015518	TTAG	2	8	243555	243562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015518	TCTT	2	8	243908	243915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015518	ATTT	2	8	243974	243981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015518	TTTA	2	8	244567	244574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015518	ATTA	2	8	246729	246736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015518	TTTC	2	8	247299	247306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015518	AGGA	2	8	247387	247394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015518	AAGA	2	8	249655	249662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015518	TAAC	2	8	250090	250097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015518	CTTT	2	8	252524	252531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015518	GAAA	2	8	252570	252577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015518	TCTT	2	8	253260	253267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015518	TTTC	2	8	253276	253283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015518	AAAG	2	8	257191	257198	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015518	TTAG	2	8	257495	257502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015518	TACT	3	12	258656	258667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015518	ATTT	2	8	260685	260692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015518	TTCA	2	8	263845	263852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015518	GAAA	2	8	265880	265887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015518	CCTT	2	8	266775	266782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015518	TCCT	2	8	266979	266986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015518	TTCA	2	8	267002	267009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015518	AAAG	2	8	270262	270269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015518	TAAT	2	8	271118	271125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015518	TCAA	2	8	271666	271673	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015518	TTTC	2	8	277084	277091	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015518	TTCC	2	8	277195	277202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015518	TGTT	2	8	285321	285328	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015518	TCTA	2	8	286666	286673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015518	TTCT	2	8	288099	288106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015518	AATG	2	8	290303	290310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015518	TAGA	2	8	290394	290401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015518	TAGT	2	8	291657	291664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015518	AAAT	2	8	292055	292062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015518	TCTT	2	8	292108	292115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015518	ATTA	2	8	292548	292555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015518	AAGG	2	8	292695	292702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015518	CTTC	2	8	295802	295809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015518	GAAA	2	8	296148	296155	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015518	TAAA	2	8	296293	296300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015518	ATGA	2	8	296306	296313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015518	CTTC	2	8	297077	297084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015518	AGGA	2	8	298723	298730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015518	TCAA	2	8	298746	298753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015518	GAAA	2	8	304039	304046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015518	ATTT	2	8	305041	305048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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