MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidianus hospitalis W1 chromosome

Total Repeats: 28206

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015518	AGA	2	6	130	135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
2	NC_015518	TAA	2	6	138	143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
3	NC_015518	TGT	2	6	235	240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795694
4	NC_015518	AGA	2	6	262	267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
5	NC_015518	CTC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795694
6	NC_015518	AAG	2	6	496	501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795694
7	NC_015518	TAT	2	6	606	611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795694
8	NC_015518	AGC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795694
9	NC_015518	AGC	2	6	796	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795694
10	NC_015518	TAA	2	6	825	830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
11	NC_015518	TTG	2	6	855	860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795694
12	NC_015518	GTA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795694
13	NC_015518	ATA	2	6	1031	1036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
14	NC_015518	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795694
15	NC_015518	AGG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795694
16	NC_015518	GAA	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
17	NC_015518	AGA	3	9	1289	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
18	NC_015518	TAT	2	6	1356	1361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795695
19	NC_015518	GAA	2	6	1416	1421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
20	NC_015518	CAG	2	6	1425	1430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795695
21	NC_015518	AGA	2	6	1498	1503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795695
22	NC_015518	CAT	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795696
23	NC_015518	GTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795696
24	NC_015518	TAT	2	6	1635	1640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795696
25	NC_015518	GAT	3	9	1659	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795696
26	NC_015518	ATC	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795696
27	NC_015518	ATT	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
28	NC_015518	TTC	2	6	2086	2091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
29	NC_015518	TCT	2	6	2117	2122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
30	NC_015518	ATT	2	6	2210	2215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
31	NC_015518	CTC	2	6	2262	2267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795697
32	NC_015518	AAT	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795697
33	NC_015518	TCT	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
34	NC_015518	GTC	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795697
35	NC_015518	TCT	2	6	2495	2500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795697
36	NC_015518	TTA	2	6	2517	2522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795697
37	NC_015518	ATG	2	6	2656	2661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795697
38	NC_015518	ACT	2	6	2715	2720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795698
39	NC_015518	CTA	2	6	2849	2854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795698
40	NC_015518	TCT	2	6	2863	2868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795698
41	NC_015518	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795698
42	NC_015518	GAT	2	6	2983	2988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795698
43	NC_015518	ATT	2	6	2995	3000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795698
44	NC_015518	CTC	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795699
45	NC_015518	CTT	2	6	3120	3125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795699
46	NC_015518	TAT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795699
47	NC_015518	TAT	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795699
48	NC_015518	ATT	2	6	3391	3396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795700
49	NC_015518	TAC	3	9	3411	3419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
50	NC_015518	ACA	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795700
51	NC_015518	ATA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795700
52	NC_015518	AAT	2	6	3758	3763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795700
53	NC_015518	AGG	2	6	3940	3945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795700
54	NC_015518	GAA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795700
55	NC_015518	CAA	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795700
56	NC_015518	CTT	2	6	4077	4082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
57	NC_015518	AAG	2	6	4296	4301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795700
58	NC_015518	TCT	2	6	4331	4336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
59	NC_015518	ATT	2	6	4480	4485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795700
60	NC_015518	TTC	2	6	4498	4503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795700
61	NC_015518	ATC	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
62	NC_015518	ACT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795700
63	NC_015518	TAA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
64	NC_015518	ATA	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
65	NC_015518	AGT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795701
66	NC_015518	TCC	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795701
67	NC_015518	GTA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795701
68	NC_015518	TAT	2	6	4990	4995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795701
69	NC_015518	CTG	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
70	NC_015518	CTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
71	NC_015518	TAT	2	6	5231	5236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795701
72	NC_015518	CAG	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795701
73	NC_015518	AGG	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332795701
74	NC_015518	TAA	2	6	5417	5422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795701
75	NC_015518	CAG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332795701
76	NC_015518	TGC	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795701
77	NC_015518	ACA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795701
78	NC_015518	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795702
79	NC_015518	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795702
80	NC_015518	GAA	2	6	5980	5985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795702
81	NC_015518	AGT	2	6	6018	6023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795702
82	NC_015518	TCT	3	9	6229	6237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795703
83	NC_015518	TTA	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795703
84	NC_015518	TTA	3	9	6314	6322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795703
85	NC_015518	CTT	2	6	6407	6412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795703
86	NC_015518	ATG	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795704
87	NC_015518	ATT	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
88	NC_015518	GAA	4	12	6877	6888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795704
89	NC_015518	CCA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332795704
90	NC_015518	TAT	2	6	7006	7011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
91	NC_015518	ATA	2	6	7081	7086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
92	NC_015518	AAT	2	6	7193	7198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
93	NC_015518	CAT	2	6	7387	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
94	NC_015518	AAC	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795704
95	NC_015518	CAT	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
96	NC_015518	TCA	2	6	7419	7424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
97	NC_015518	TTA	2	6	7425	7430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
98	NC_015518	AAG	2	6	7437	7442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795704
99	NC_015518	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
100	NC_015518	TAT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
101	NC_015518	CCA	3	9	7534	7542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332795704
102	NC_015518	ATT	2	6	7618	7623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
103	NC_015518	TAA	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
104	NC_015518	ATA	2	6	7796	7801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
105	NC_015518	CAT	2	6	7840	7845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
106	NC_015518	GAA	2	6	7855	7860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795704
107	NC_015518	ATA	2	6	7943	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795704
108	NC_015518	AGA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795704
109	NC_015518	AAG	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795704
110	NC_015518	CAT	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
111	NC_015518	TCA	2	6	8195	8200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
112	NC_015518	CTA	2	6	8202	8207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
113	NC_015518	TCT	2	6	8240	8245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795704
114	NC_015518	TTC	2	6	8264	8269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795704
115	NC_015518	AGT	2	6	8387	8392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795704
116	NC_015518	CTT	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795704
117	NC_015518	CTT	2	6	8435	8440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795704
118	NC_015518	AGT	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795704
119	NC_015518	TAT	2	6	8455	8460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795704
120	NC_015518	TCA	2	6	8472	8477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795704
121	NC_015518	GTA	2	6	8791	8796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795705
122	NC_015518	TGA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795705
123	NC_015518	TAA	2	6	9029	9034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795705
124	NC_015518	TCT	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795705
125	NC_015518	CAT	2	6	9181	9186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332795705
126	NC_015518	TGT	2	6	9197	9202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332795705
127	NC_015518	TGC	2	6	9248	9253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332795705
128	NC_015518	ACA	2	6	9417	9422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332795705
129	NC_015518	ATG	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795705
130	NC_015518	ATT	2	6	9438	9443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795705
131	NC_015518	CTT	2	6	9483	9488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795705
132	NC_015518	AGA	2	6	9703	9708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795706
133	NC_015518	ATT	2	6	9827	9832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795706
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142	NC_015518	TTA	2	6	10236	10241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332795706
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161	NC_015518	TGA	2	6	11548	11553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795706
162	NC_015518	TGA	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332795706
163	NC_015518	ATA	2	6	11772	11777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795706
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257	NC_015518	ATA	2	6	18163	18168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332795714
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261	NC_015518	GAA	2	6	18454	18459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332795714
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264	NC_015518	CTT	2	6	18573	18578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332795714
265	NC_015518	TCC	2	6	18580	18585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332795714
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