MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	AAAAGA	2	12	4910	4921	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687282
2	NC_015517	AAGAAA	2	12	12986	12997	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687291
3	NC_015517	ATATAG	2	12	13286	13297	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687291
4	NC_015517	TTTTTG	2	12	15093	15104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687293
5	NC_015517	TTATAT	2	12	18250	18261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687296
6	NC_015517	AATTGA	2	12	18430	18441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687296
7	NC_015517	TGCTTT	2	12	21058	21069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687298
8	NC_015517	CTTAAC	2	12	22564	22575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332687298
9	NC_015517	TAAAAC	2	12	23131	23142	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687299
10	NC_015517	TTTTGT	2	12	24221	24232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687300
11	NC_015517	AGCAAA	2	12	24325	24336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687300
12	NC_015517	AAATTT	2	12	26334	26345	50 %	50 %	0 %	0 %	332687302
13	NC_015517	ATAACT	2	12	29051	29062	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687304
14	NC_015517	TTTTAG	2	12	33949	33960	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687309
15	NC_015517	TACAAT	2	12	35055	35066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687310
16	NC_015517	ACGAAA	2	12	35869	35880	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687311
17	NC_015517	TTATGC	2	12	41288	41299	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332687314
18	NC_015517	TTTTTA	2	12	43339	43350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687316
19	NC_015517	ACCAAG	2	12	46379	46390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332687319
20	NC_015517	AAAATA	2	12	51777	51788	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687323
21	NC_015517	TGATTT	2	12	51889	51900	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687323
22	NC_015517	CTAATG	2	12	58844	58855	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687330
23	NC_015517	TATCAA	2	12	59516	59527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687330
24	NC_015517	TGAAAA	2	12	60478	60489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687331
25	NC_015517	TGATTT	2	12	60613	60624	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687331
26	NC_015517	ATTTGA	2	12	64641	64652	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687335
27	NC_015517	GGAAAA	2	12	66603	66614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332687337
28	NC_015517	AATTTT	2	12	69593	69604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687339
29	NC_015517	GTAAAA	2	12	78652	78663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687345
30	NC_015517	GAAAAA	2	12	79118	79129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332687346
31	NC_015517	TCAAAA	2	12	80234	80245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687347
32	NC_015517	ATTAGG	2	12	80506	80517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332687348
33	NC_015517	TTCTAT	2	12	80641	80652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332687348
34	NC_015517	TTTTTA	2	12	81298	81309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687349
35	NC_015517	GTCCAA	2	12	82353	82364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332687349
36	NC_015517	AATTAC	2	12	83877	83888	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687350
37	NC_015517	ATTTTT	2	12	90087	90098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687354
38	NC_015517	ATTTTT	2	12	91777	91788	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332687356
39	NC_015517	TTTTGA	2	12	94369	94380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332687360
40	NC_015517	ATTTAT	2	12	96346	96357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687361
41	NC_015517	ATGTTG	2	12	96843	96854	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332687361
42	NC_015517	GATTAT	2	12	98956	98967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687362
43	NC_015517	ATTTAA	2	12	100321	100332	50 %	50 %	0 %	0 %	332687363
44	NC_015517	GAAATA	2	12	102142	102153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332687364
45	NC_015517	ATATTT	2	12	103619	103630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687365
46	NC_015517	CAATTG	2	12	108229	108240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687368
47	NC_015517	TTTAAT	2	12	111304	111315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687370
48	NC_015517	ATATTA	2	12	111863	111874	50 %	50 %	0 %	0 %	332687370
49	NC_015517	CATCTT	2	12	117734	117745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332687374
50	NC_015517	AAGATG	2	12	119922	119933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687375
51	NC_015517	TGATAA	2	12	124977	124988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332687379
52	NC_015517	ATTAAT	2	12	125791	125802	50 %	50 %	0 %	0 %	332687379
53	NC_015517	ATTAAA	2	12	126352	126363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332687379
54	NC_015517	GCAATT	2	12	129426	129437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687381
55	NC_015517	AATTTA	2	12	136635	136646	50 %	50 %	0 %	0 %	332687388
56	NC_015517	CACAAT	2	12	138191	138202	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332687389
57	NC_015517	AAATAA	2	12	138692	138703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687389
58	NC_015517	GTAAAG	2	12	139467	139478	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687389
59	NC_015517	ACATTG	2	12	148109	148120	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332687396
60	NC_015517	CCTGTT	2	12	148418	148429	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332687396
61	NC_015517	TTGCAT	2	12	148719	148730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332687396
62	NC_015517	CTTTTG	2	12	149377	149388	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687397
63	NC_015517	CTGTTT	2	12	149857	149868	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332687397
64	NC_015517	AATACA	2	12	150930	150941	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687399
65	NC_015517	CTACAC	2	12	151824	151835	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332687400
66	NC_015517	ATAAAA	2	12	152415	152426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332687400
67	NC_015517	TTTTTG	2	12	158028	158039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	332687405
68	NC_015517	AAAGAC	2	12	158697	158708	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332687406
69	NC_015517	ATTAAA	2	12	159358	159369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332687406
70	NC_015517	AGGATA	2	12	163551	163562	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332687411
71	NC_015517	ACATAA	2	12	166613	166624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332687413
72	NC_015517	TATTGA	2	12	167339	167350	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332687413
73	NC_015517	TCATTA	2	12	167780	167791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332687413
74	NC_015517	AATACT	2	12	172269	172280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332687418
75	NC_015517	TAATTT	2	12	174892	174903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332687419
76	NC_015517	AACCAA	2	12	174953	174964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332687419
77	NC_015517	GCTTCA	2	12	176809	176820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332687420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.