MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 211

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	TAAAA	2	10	407	416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015517	ATTTT	2	10	2349	2358	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015517	TATAA	2	10	2842	2851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015517	AAAAG	2	10	3477	3486	80 %	0 %	20 %	0 %	332687280
5	NC_015517	GAAAA	2	10	4290	4299	80 %	0 %	20 %	0 %	332687282
6	NC_015517	TTTTA	2	10	5509	5518	20 %	80 %	0 %	0 %	332687283
7	NC_015517	ATTTT	2	10	5734	5743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015517	TCTTT	2	10	5917	5926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015517	ACAAA	2	10	6374	6383	80 %	0 %	0 %	20 %	332687284
10	NC_015517	CTTTT	2	10	7020	7029	0 %	80 %	0 %	20 %	332687285
11	NC_015517	CTTTT	2	10	7432	7441	0 %	80 %	0 %	20 %	332687285
12	NC_015517	CATCT	2	10	7646	7655	20 %	40 %	0 %	40 %	332687286
13	NC_015517	TTGGA	2	10	9058	9067	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015517	TAAAA	2	10	9735	9744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015517	GAAGT	2	10	9747	9756	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015517	ATAAC	2	10	9780	9789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015517	ATTTT	2	10	10346	10355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015517	AATTT	2	10	11508	11517	40 %	60 %	0 %	0 %	332687290
19	NC_015517	TCTAT	2	10	12301	12310	20 %	60 %	0 %	20 %	332687291
20	NC_015517	ATTTA	2	10	12747	12756	40 %	60 %	0 %	0 %	332687291
21	NC_015517	AATTA	2	10	13245	13254	60 %	40 %	0 %	0 %	332687291
22	NC_015517	ATTGA	2	10	13658	13667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015517	CAATT	2	10	13852	13861	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015517	TATAG	2	10	14033	14042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015517	TGAAT	2	10	14517	14526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015517	ACTTC	2	10	15729	15738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_015517	AAATT	2	10	16367	16376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015517	TAGCA	2	10	19061	19070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015517	TCAAT	2	10	22114	22123	40 %	40 %	0 %	20 %	332687298
30	NC_015517	AAAAT	2	10	22337	22346	80 %	20 %	0 %	0 %	332687298
31	NC_015517	CTAAA	2	10	23010	23019	60 %	20 %	0 %	20 %	332687299
32	NC_015517	TAAAA	2	10	23446	23455	80 %	20 %	0 %	0 %	332687299
33	NC_015517	TATAG	2	10	23491	23500	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015517	GAAGA	2	10	23541	23550	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015517	TAGTA	2	10	23583	23592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015517	TAATT	2	10	23792	23801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015517	TCAAA	2	10	24180	24189	60 %	20 %	0 %	20 %	332687300
38	NC_015517	AAACA	2	10	24339	24348	80 %	0 %	0 %	20 %	332687300
39	NC_015517	ATAAA	2	10	24467	24476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015517	TTATT	2	10	25511	25520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015517	GATAA	2	10	28017	28026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015517	TTTTA	2	10	28589	28598	20 %	80 %	0 %	0 %	332687303
43	NC_015517	ATTTT	2	10	29293	29302	20 %	80 %	0 %	0 %	332687304
44	NC_015517	AAAAG	2	10	29360	29369	80 %	0 %	20 %	0 %	332687304
45	NC_015517	TGTAT	2	10	29580	29589	20 %	60 %	20 %	0 %	332687304
46	NC_015517	CTTTT	2	10	30178	30187	0 %	80 %	0 %	20 %	332687305
47	NC_015517	TCTTT	2	10	30199	30208	0 %	80 %	0 %	20 %	332687305
48	NC_015517	AACAT	2	10	30585	30594	60 %	20 %	0 %	20 %	332687306
49	NC_015517	CCAAT	2	10	32644	32653	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015517	TATTT	2	10	33161	33170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015517	AAAGA	2	10	36654	36663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015517	TAAAT	2	10	36910	36919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015517	AAAAT	2	10	37200	37209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015517	ATTTA	2	10	37434	37443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015517	AAATA	2	10	37889	37898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015517	TATAA	2	10	38177	38186	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015517	CTTTT	2	10	38598	38607	0 %	80 %	0 %	20 %	332687313
58	NC_015517	TTTTG	2	10	38626	38635	0 %	80 %	20 %	0 %	332687313
59	NC_015517	TATCT	2	10	39126	39135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015517	AAATT	2	10	39773	39782	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015517	TTATT	2	10	39824	39833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015517	TTGAA	2	10	39904	39913	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015517	AAAAC	2	10	40296	40305	80 %	0 %	0 %	20 %	332687314
64	NC_015517	AATTA	2	10	41074	41083	60 %	40 %	0 %	0 %	332687314
65	NC_015517	TTTTG	2	10	41174	41183	0 %	80 %	20 %	0 %	332687314
66	NC_015517	ATGGG	2	10	42367	42376	20 %	20 %	60 %	0 %	332687315
67	NC_015517	TATCT	2	10	43247	43256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015517	AAATC	2	10	43385	43394	60 %	20 %	0 %	20 %	332687316
69	NC_015517	CAAAA	2	10	44566	44575	80 %	0 %	0 %	20 %	332687316
70	NC_015517	AATAA	2	10	48226	48235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015517	TTATT	2	10	48337	48346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015517	ATTCT	2	10	49445	49454	20 %	60 %	0 %	20 %	332687321
73	NC_015517	AATTA	2	10	49910	49919	60 %	40 %	0 %	0 %	332687321
74	NC_015517	CACTT	2	10	50126	50135	20 %	40 %	0 %	40 %	332687321
75	NC_015517	GTGAT	2	10	50389	50398	20 %	40 %	40 %	0 %	332687321
76	NC_015517	TCCAG	2	10	50561	50570	20 %	20 %	20 %	40 %	332687321
77	NC_015517	ATTTA	2	10	51439	51448	40 %	60 %	0 %	0 %	332687322
78	NC_015517	TAAAG	2	10	53677	53686	60 %	20 %	20 %	0 %	332687325
79	NC_015517	ATAAA	2	10	54676	54685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015517	AGGTA	2	10	55171	55180	40 %	20 %	40 %	0 %	332687327
81	NC_015517	AATCC	2	10	58488	58497	40 %	20 %	0 %	40 %	332687330
82	NC_015517	TTTGA	2	10	59430	59439	20 %	60 %	20 %	0 %	332687330
83	NC_015517	ACCAA	2	10	59640	59649	60 %	0 %	0 %	40 %	332687330
84	NC_015517	AAAGA	2	10	59697	59706	80 %	0 %	20 %	0 %	332687330
85	NC_015517	ACTTA	2	10	61074	61083	40 %	40 %	0 %	20 %	332687331
86	NC_015517	ATATT	2	10	62986	62995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015517	AGAAA	2	10	63684	63693	80 %	0 %	20 %	0 %	332687334
88	NC_015517	AAATG	2	10	64192	64201	60 %	20 %	20 %	0 %	332687334
89	NC_015517	TAAAT	2	10	64597	64606	60 %	40 %	0 %	0 %	332687335
90	NC_015517	TGATT	2	10	65680	65689	20 %	60 %	20 %	0 %	332687336
91	NC_015517	TGGAT	2	10	65758	65767	20 %	40 %	40 %	0 %	332687336
92	NC_015517	ATTTC	2	10	65769	65778	20 %	60 %	0 %	20 %	332687336
93	NC_015517	ATAAA	2	10	66198	66207	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015517	CAAAA	2	10	66306	66315	80 %	0 %	0 %	20 %	332687337
95	NC_015517	AATTA	2	10	66734	66743	60 %	40 %	0 %	0 %	332687337
96	NC_015517	GTTTT	2	10	66811	66820	0 %	80 %	20 %	0 %	332687337
97	NC_015517	TTTAT	2	10	66939	66948	20 %	80 %	0 %	0 %	332687337
98	NC_015517	GATGG	2	10	68794	68803	20 %	20 %	60 %	0 %	332687338
99	NC_015517	ATAAA	2	10	69400	69409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015517	ACAGG	2	10	71850	71859	40 %	0 %	40 %	20 %	332687340
101	NC_015517	TAAAA	2	10	73326	73335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015517	TAAGC	2	10	73407	73416	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015517	ATAAC	2	10	74456	74465	60 %	20 %	0 %	20 %	332687342
104	NC_015517	ATTTT	2	10	75261	75270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015517	TTTAA	2	10	75296	75305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015517	TTAAT	2	10	75445	75454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015517	GTAAA	2	10	75942	75951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015517	AAGGA	2	10	76024	76033	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015517	AAATT	2	10	76187	76196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015517	TACAA	2	10	80453	80462	60 %	20 %	0 %	20 %	332687347
111	NC_015517	TTCTT	2	10	81150	81159	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015517	ATCTT	2	10	82343	82352	20 %	60 %	0 %	20 %	332687349
113	NC_015517	TTAAA	2	10	82711	82720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015517	ATAAA	3	15	82790	82804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015517	AAGAA	2	10	83991	84000	80 %	0 %	20 %	0 %	332687350
116	NC_015517	CCATT	2	10	84252	84261	20 %	40 %	0 %	40 %	332687350
117	NC_015517	TACCA	2	10	84751	84760	40 %	20 %	0 %	40 %	332687350
118	NC_015517	TTTAT	2	10	86183	86192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015517	TTAAA	2	10	86379	86388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015517	TGGAT	2	10	86836	86845	20 %	40 %	40 %	0 %	332687351
121	NC_015517	ACAAA	2	10	87608	87617	80 %	0 %	0 %	20 %	332687352
122	NC_015517	TATTT	2	10	90821	90830	20 %	80 %	0 %	0 %	332687356
123	NC_015517	TTTCA	2	10	91532	91541	20 %	60 %	0 %	20 %	332687356
124	NC_015517	GGTGG	2	10	91943	91952	0 %	20 %	80 %	0 %	332687356
125	NC_015517	TTAAT	2	10	92769	92778	40 %	60 %	0 %	0 %	332687357
126	NC_015517	TATAA	2	10	92803	92812	60 %	40 %	0 %	0 %	332687357
127	NC_015517	TTTTA	2	10	93906	93915	20 %	80 %	0 %	0 %	332687359
128	NC_015517	ATTTT	2	10	94704	94713	20 %	80 %	0 %	0 %	332687360
129	NC_015517	TATCT	2	10	94922	94931	20 %	60 %	0 %	20 %	332687361
130	NC_015517	TACTT	2	10	95947	95956	20 %	60 %	0 %	20 %	332687361
131	NC_015517	ATTTA	2	10	96859	96868	40 %	60 %	0 %	0 %	332687361
132	NC_015517	GAAAT	2	10	99059	99068	60 %	20 %	20 %	0 %	332687362
133	NC_015517	AAGAA	2	10	100335	100344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015517	CTTAT	2	10	102746	102755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015517	AATAA	2	10	102945	102954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015517	ATTTC	2	10	103940	103949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015517	TAATA	2	10	104171	104180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015517	TAAAA	2	10	104348	104357	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015517	ATTAA	2	10	104891	104900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015517	AATGA	2	10	107209	107218	60 %	20 %	20 %	0 %	332687367
141	NC_015517	AGTTA	2	10	108891	108900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015517	AATAA	2	10	112803	112812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015517	GGTAG	2	10	113835	113844	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015517	ATTTT	2	10	113886	113895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_015517	ATTGA	2	10	175969	175978	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.