MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 plasmid pMP1

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015517	TC	3	6	854	859	0 %	50 %	0 %	50 %	332687278
2	NC_015517	CT	3	6	1159	1164	0 %	50 %	0 %	50 %	332687279
3	NC_015517	AT	3	6	3879	3884	50 %	50 %	0 %	0 %	332687281
4	NC_015517	TA	3	6	4786	4791	50 %	50 %	0 %	0 %	332687282
5	NC_015517	TA	3	6	5382	5387	50 %	50 %	0 %	0 %	332687283
6	NC_015517	AT	3	6	6715	6720	50 %	50 %	0 %	0 %	332687285
7	NC_015517	TC	3	6	7338	7343	0 %	50 %	0 %	50 %	332687285
8	NC_015517	TA	3	6	8008	8013	50 %	50 %	0 %	0 %	332687286
9	NC_015517	TA	3	6	8644	8649	50 %	50 %	0 %	0 %	332687287
10	NC_015517	AT	3	6	11434	11439	50 %	50 %	0 %	0 %	332687290
11	NC_015517	AG	4	8	11475	11482	50 %	0 %	50 %	0 %	332687290
12	NC_015517	TC	4	8	11646	11653	0 %	50 %	0 %	50 %	332687290
13	NC_015517	AT	3	6	12453	12458	50 %	50 %	0 %	0 %	332687291
14	NC_015517	AT	3	6	12566	12571	50 %	50 %	0 %	0 %	332687291
15	NC_015517	TA	3	6	12579	12584	50 %	50 %	0 %	0 %	332687291
16	NC_015517	TA	3	6	12815	12820	50 %	50 %	0 %	0 %	332687291
17	NC_015517	AT	3	6	13181	13186	50 %	50 %	0 %	0 %	332687291
18	NC_015517	AT	3	6	15194	15199	50 %	50 %	0 %	0 %	332687293
19	NC_015517	AT	3	6	17015	17020	50 %	50 %	0 %	0 %	332687294
20	NC_015517	AT	3	6	17028	17033	50 %	50 %	0 %	0 %	332687294
21	NC_015517	GA	3	6	17481	17486	50 %	0 %	50 %	0 %	332687294
22	NC_015517	TA	3	6	17913	17918	50 %	50 %	0 %	0 %	332687295
23	NC_015517	TA	3	6	18477	18482	50 %	50 %	0 %	0 %	332687296
24	NC_015517	AG	4	8	21162	21169	50 %	0 %	50 %	0 %	332687298
25	NC_015517	TA	3	6	22638	22643	50 %	50 %	0 %	0 %	332687298
26	NC_015517	AT	3	6	23069	23074	50 %	50 %	0 %	0 %	332687299
27	NC_015517	TA	3	6	23260	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	332687299
28	NC_015517	AT	3	6	23919	23924	50 %	50 %	0 %	0 %	332687300
29	NC_015517	AT	3	6	23981	23986	50 %	50 %	0 %	0 %	332687300
30	NC_015517	TA	3	6	24024	24029	50 %	50 %	0 %	0 %	332687300
31	NC_015517	CT	3	6	24215	24220	0 %	50 %	0 %	50 %	332687300
32	NC_015517	AT	3	6	24866	24871	50 %	50 %	0 %	0 %	332687301
33	NC_015517	GA	3	6	24910	24915	50 %	0 %	50 %	0 %	332687301
34	NC_015517	TA	3	6	26023	26028	50 %	50 %	0 %	0 %	332687302
35	NC_015517	TA	3	6	28283	28288	50 %	50 %	0 %	0 %	332687303
36	NC_015517	AT	3	6	28493	28498	50 %	50 %	0 %	0 %	332687303
37	NC_015517	TA	3	6	28979	28984	50 %	50 %	0 %	0 %	332687304
38	NC_015517	AT	3	6	29643	29648	50 %	50 %	0 %	0 %	332687305
39	NC_015517	AT	4	8	29832	29839	50 %	50 %	0 %	0 %	332687305
40	NC_015517	GA	3	6	30220	30225	50 %	0 %	50 %	0 %	332687305
41	NC_015517	GA	3	6	30901	30906	50 %	0 %	50 %	0 %	332687307
42	NC_015517	AT	3	6	31798	31803	50 %	50 %	0 %	0 %	332687308
43	NC_015517	CA	3	6	34052	34057	50 %	0 %	0 %	50 %	332687309
44	NC_015517	AT	3	6	34217	34222	50 %	50 %	0 %	0 %	332687309
45	NC_015517	AT	3	6	35545	35550	50 %	50 %	0 %	0 %	332687310
46	NC_015517	AT	3	6	36232	36237	50 %	50 %	0 %	0 %	332687311
47	NC_015517	AG	3	6	36278	36283	50 %	0 %	50 %	0 %	332687311
48	NC_015517	AG	3	6	36302	36307	50 %	0 %	50 %	0 %	332687311
49	NC_015517	TA	3	6	38325	38330	50 %	50 %	0 %	0 %	332687313
50	NC_015517	GA	3	6	41854	41859	50 %	0 %	50 %	0 %	332687315
51	NC_015517	TA	3	6	42202	42207	50 %	50 %	0 %	0 %	332687315
52	NC_015517	TA	4	8	42232	42239	50 %	50 %	0 %	0 %	332687315
53	NC_015517	TA	3	6	43795	43800	50 %	50 %	0 %	0 %	332687316
54	NC_015517	AG	3	6	43938	43943	50 %	0 %	50 %	0 %	332687316
55	NC_015517	AT	3	6	44772	44777	50 %	50 %	0 %	0 %	332687316
56	NC_015517	CA	3	6	45293	45298	50 %	0 %	0 %	50 %	332687317
57	NC_015517	TA	3	6	46084	46089	50 %	50 %	0 %	0 %	332687318
58	NC_015517	TG	3	6	46677	46682	0 %	50 %	50 %	0 %	332687319
59	NC_015517	AT	3	6	46925	46930	50 %	50 %	0 %	0 %	332687319
60	NC_015517	TA	3	6	47900	47905	50 %	50 %	0 %	0 %	332687320
61	NC_015517	AT	3	6	49127	49132	50 %	50 %	0 %	0 %	332687321
62	NC_015517	TC	3	6	49734	49739	0 %	50 %	0 %	50 %	332687321
63	NC_015517	AT	3	6	50008	50013	50 %	50 %	0 %	0 %	332687321
64	NC_015517	TC	3	6	52986	52991	0 %	50 %	0 %	50 %	332687325
65	NC_015517	TG	3	6	53734	53739	0 %	50 %	50 %	0 %	332687325
66	NC_015517	AT	3	6	54482	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	332687326
67	NC_015517	TA	3	6	55692	55697	50 %	50 %	0 %	0 %	332687328
68	NC_015517	AT	3	6	56377	56382	50 %	50 %	0 %	0 %	332687329
69	NC_015517	AT	3	6	57039	57044	50 %	50 %	0 %	0 %	332687329
70	NC_015517	AT	3	6	57398	57403	50 %	50 %	0 %	0 %	332687329
71	NC_015517	TC	4	8	59362	59369	0 %	50 %	0 %	50 %	332687330
72	NC_015517	GT	3	6	59486	59491	0 %	50 %	50 %	0 %	332687330
73	NC_015517	TA	3	6	60918	60923	50 %	50 %	0 %	0 %	332687331
74	NC_015517	TA	3	6	65052	65057	50 %	50 %	0 %	0 %	332687335
75	NC_015517	CT	3	6	65080	65085	0 %	50 %	0 %	50 %	332687335
76	NC_015517	CA	3	6	68530	68535	50 %	0 %	0 %	50 %	332687338
77	NC_015517	AG	3	6	68644	68649	50 %	0 %	50 %	0 %	332687338
78	NC_015517	GA	3	6	74849	74854	50 %	0 %	50 %	0 %	332687342
79	NC_015517	GA	3	6	77102	77107	50 %	0 %	50 %	0 %	332687343
80	NC_015517	AC	3	6	77559	77564	50 %	0 %	0 %	50 %	332687344
81	NC_015517	TC	3	6	78950	78955	0 %	50 %	0 %	50 %	332687345
82	NC_015517	TC	3	6	79139	79144	0 %	50 %	0 %	50 %	332687346
83	NC_015517	TA	3	6	80136	80141	50 %	50 %	0 %	0 %	332687347
84	NC_015517	AT	3	6	80228	80233	50 %	50 %	0 %	0 %	332687347
85	NC_015517	TA	3	6	81784	81789	50 %	50 %	0 %	0 %	332687349
86	NC_015517	TA	3	6	82093	82098	50 %	50 %	0 %	0 %	332687349
87	NC_015517	TA	3	6	87127	87132	50 %	50 %	0 %	0 %	332687351
88	NC_015517	CT	3	6	87873	87878	0 %	50 %	0 %	50 %	332687352
89	NC_015517	TC	3	6	87912	87917	0 %	50 %	0 %	50 %	332687352
90	NC_015517	TC	3	6	88073	88078	0 %	50 %	0 %	50 %	332687352
91	NC_015517	AG	3	6	88565	88570	50 %	0 %	50 %	0 %	332687353
92	NC_015517	AT	3	6	88921	88926	50 %	50 %	0 %	0 %	332687353
93	NC_015517	AT	3	6	90110	90115	50 %	50 %	0 %	0 %	332687354
94	NC_015517	GT	3	6	90314	90319	0 %	50 %	50 %	0 %	332687355
95	NC_015517	AT	4	8	90547	90554	50 %	50 %	0 %	0 %	332687355
96	NC_015517	AT	3	6	91401	91406	50 %	50 %	0 %	0 %	332687356
97	NC_015517	TA	3	6	93526	93531	50 %	50 %	0 %	0 %	332687359
98	NC_015517	TA	3	6	93766	93771	50 %	50 %	0 %	0 %	332687359
99	NC_015517	TA	3	6	94076	94081	50 %	50 %	0 %	0 %	332687359
100	NC_015517	AG	3	6	94324	94329	50 %	0 %	50 %	0 %	332687360
101	NC_015517	AG	3	6	94665	94670	50 %	0 %	50 %	0 %	332687360
102	NC_015517	AT	3	6	94758	94763	50 %	50 %	0 %	0 %	332687360
103	NC_015517	AT	3	6	94877	94882	50 %	50 %	0 %	0 %	332687360
104	NC_015517	AT	3	6	96749	96754	50 %	50 %	0 %	0 %	332687361
105	NC_015517	TA	3	6	97072	97077	50 %	50 %	0 %	0 %	332687361
106	NC_015517	TA	3	6	98633	98638	50 %	50 %	0 %	0 %	332687362
107	NC_015517	TA	3	6	99148	99153	50 %	50 %	0 %	0 %	332687362
108	NC_015517	TA	3	6	103716	103721	50 %	50 %	0 %	0 %	332687365
109	NC_015517	TC	3	6	104761	104766	0 %	50 %	0 %	50 %	332687366
110	NC_015517	GT	3	6	104804	104809	0 %	50 %	50 %	0 %	332687366
111	NC_015517	TA	3	6	106949	106954	50 %	50 %	0 %	0 %	332687367
112	NC_015517	GA	3	6	107798	107803	50 %	0 %	50 %	0 %	332687367
113	NC_015517	TG	3	6	108026	108031	0 %	50 %	50 %	0 %	332687368
114	NC_015517	AG	3	6	110724	110729	50 %	0 %	50 %	0 %	332687370
115	NC_015517	AT	3	6	110798	110803	50 %	50 %	0 %	0 %	332687370
116	NC_015517	TA	3	6	110984	110989	50 %	50 %	0 %	0 %	332687370
117	NC_015517	TA	3	6	111680	111685	50 %	50 %	0 %	0 %	332687370
118	NC_015517	GA	3	6	111909	111914	50 %	0 %	50 %	0 %	332687370
119	NC_015517	TA	3	6	113515	113520	50 %	50 %	0 %	0 %	332687371
120	NC_015517	AT	3	6	114902	114907	50 %	50 %	0 %	0 %	332687372
121	NC_015517	AT	3	6	116039	116044	50 %	50 %	0 %	0 %	332687373
122	NC_015517	AT	3	6	121623	121628	50 %	50 %	0 %	0 %	332687376
123	NC_015517	CT	3	6	121672	121677	0 %	50 %	0 %	50 %	332687376
124	NC_015517	AT	3	6	122760	122765	50 %	50 %	0 %	0 %	332687377
125	NC_015517	TA	3	6	124147	124152	50 %	50 %	0 %	0 %	332687378
126	NC_015517	TC	3	6	125753	125758	0 %	50 %	0 %	50 %	332687379
127	NC_015517	AT	3	6	126677	126682	50 %	50 %	0 %	0 %	332687379
128	NC_015517	AT	3	6	126864	126869	50 %	50 %	0 %	0 %	332687379
129	NC_015517	CT	3	6	126938	126943	0 %	50 %	0 %	50 %	332687379
130	NC_015517	CA	3	6	129636	129641	50 %	0 %	0 %	50 %	332687381
131	NC_015517	TC	3	6	129864	129869	0 %	50 %	0 %	50 %	332687382
132	NC_015517	AT	3	6	130712	130717	50 %	50 %	0 %	0 %	332687382
133	NC_015517	AT	4	8	132419	132426	50 %	50 %	0 %	0 %	332687384
134	NC_015517	TA	3	6	133142	133147	50 %	50 %	0 %	0 %	332687385
135	NC_015517	GT	3	6	133251	133256	0 %	50 %	50 %	0 %	332687385
136	NC_015517	TA	3	6	133332	133337	50 %	50 %	0 %	0 %	332687385
137	NC_015517	CT	3	6	133926	133931	0 %	50 %	0 %	50 %	332687385
138	NC_015517	GA	3	6	134256	134261	50 %	0 %	50 %	0 %	332687386
139	NC_015517	TA	3	6	134303	134308	50 %	50 %	0 %	0 %	332687386
140	NC_015517	AT	3	6	135657	135662	50 %	50 %	0 %	0 %	332687388
141	NC_015517	CT	3	6	137738	137743	0 %	50 %	0 %	50 %	332687389
142	NC_015517	TC	3	6	137803	137808	0 %	50 %	0 %	50 %	332687389
143	NC_015517	TG	3	6	138300	138305	0 %	50 %	50 %	0 %	332687389
144	NC_015517	TC	3	6	138509	138514	0 %	50 %	0 %	50 %	332687389
145	NC_015517	TC	3	6	138976	138981	0 %	50 %	0 %	50 %	332687389
146	NC_015517	TA	3	6	139009	139014	50 %	50 %	0 %	0 %	332687389
147	NC_015517	TG	3	6	139365	139370	0 %	50 %	50 %	0 %	332687389
148	NC_015517	CT	3	6	140552	140557	0 %	50 %	0 %	50 %	332687390
149	NC_015517	AG	3	6	144109	144114	50 %	0 %	50 %	0 %	332687392
150	NC_015517	TA	3	6	145184	145189	50 %	50 %	0 %	0 %	332687393
151	NC_015517	TA	3	6	145555	145560	50 %	50 %	0 %	0 %	332687393
152	NC_015517	TA	3	6	147021	147026	50 %	50 %	0 %	0 %	332687394
153	NC_015517	CA	3	6	150235	150240	50 %	0 %	0 %	50 %	332687398
154	NC_015517	GA	3	6	150392	150397	50 %	0 %	50 %	0 %	332687398
155	NC_015517	AT	3	6	150778	150783	50 %	50 %	0 %	0 %	332687399
156	NC_015517	TA	3	6	151996	152001	50 %	50 %	0 %	0 %	332687400
157	NC_015517	TA	3	6	153768	153773	50 %	50 %	0 %	0 %	332687401
158	NC_015517	AC	3	6	154002	154007	50 %	0 %	0 %	50 %	332687401
159	NC_015517	TC	3	6	154289	154294	0 %	50 %	0 %	50 %	332687402
160	NC_015517	TA	3	6	154342	154347	50 %	50 %	0 %	0 %	332687402
161	NC_015517	GA	3	6	154682	154687	50 %	0 %	50 %	0 %	332687402
162	NC_015517	TA	3	6	154811	154816	50 %	50 %	0 %	0 %	332687402
163	NC_015517	AT	3	6	155442	155447	50 %	50 %	0 %	0 %	332687403
164	NC_015517	AT	3	6	155460	155465	50 %	50 %	0 %	0 %	332687403
165	NC_015517	AT	3	6	158782	158787	50 %	50 %	0 %	0 %	332687406
166	NC_015517	AT	3	6	159208	159213	50 %	50 %	0 %	0 %	332687406
167	NC_015517	AT	3	6	161369	161374	50 %	50 %	0 %	0 %	332687408
168	NC_015517	GA	3	6	162497	162502	50 %	0 %	50 %	0 %	332687410
169	NC_015517	CA	3	6	162746	162751	50 %	0 %	0 %	50 %	332687410
170	NC_015517	TC	3	6	162927	162932	0 %	50 %	0 %	50 %	332687411
171	NC_015517	CA	3	6	163661	163666	50 %	0 %	0 %	50 %	332687411
172	NC_015517	CA	3	6	165112	165117	50 %	0 %	0 %	50 %	332687412
173	NC_015517	CT	4	8	166069	166076	0 %	50 %	0 %	50 %	332687413
174	NC_015517	TG	3	6	166443	166448	0 %	50 %	50 %	0 %	332687413
175	NC_015517	TC	3	6	167497	167502	0 %	50 %	0 %	50 %	332687413
176	NC_015517	TC	3	6	168030	168035	0 %	50 %	0 %	50 %	332687413
177	NC_015517	TA	3	6	170614	170619	50 %	50 %	0 %	0 %	332687416
178	NC_015517	AG	3	6	171913	171918	50 %	0 %	50 %	0 %	332687417
179	NC_015517	AT	3	6	172076	172081	50 %	50 %	0 %	0 %	332687417
180	NC_015517	TA	3	6	172907	172912	50 %	50 %	0 %	0 %	332687418
181	NC_015517	GT	3	6	176898	176903	0 %	50 %	50 %	0 %	332687420
182	NC_015517	AT	3	6	177209	177214	50 %	50 %	0 %	0 %	332687420
183	NC_015517	GT	3	6	177459	177464	0 %	50 %	50 %	0 %	332687420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.