MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 chromosome

Total Repeats: 950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015516	TCCAGA	2	12	4983	4994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332685539
2	NC_015516	GATGGT	2	12	6754	6765	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332685541
3	NC_015516	ACAAGC	2	12	7671	7682	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332685541
4	NC_015516	TGAAGA	2	12	7899	7910	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332685541
5	NC_015516	AAAATA	2	12	8992	9003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015516	TTCTTT	2	12	11101	11112	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	332685545
7	NC_015516	AAAAGG	2	12	13091	13102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685546
8	NC_015516	AAAGCT	2	12	13308	13319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685546
9	NC_015516	ATTTTT	2	12	14098	14109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015516	AGATGC	2	12	14240	14251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332685547
11	NC_015516	TATTTT	3	18	15873	15890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015516	TTTTGA	2	12	18205	18216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685549
13	NC_015516	ATCAAA	2	12	23914	23925	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332685553
14	NC_015516	AATTTC	2	12	24642	24653	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332685554
15	NC_015516	TAAAAA	2	12	27869	27880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015516	GAAAAA	2	12	28890	28901	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332685559
17	NC_015516	TAAAAA	2	12	33057	33068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015516	TAATTG	2	12	33096	33107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015516	TTTTCT	2	12	36028	36039	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	332685565
20	NC_015516	ATATTT	2	12	39775	39786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015516	AGTGAC	2	12	43571	43582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	332685569
22	NC_015516	CATGAT	2	12	51058	51069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332685577
23	NC_015516	AACATG	2	12	51092	51103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685577
24	NC_015516	TTTTAT	2	12	53129	53140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332685579
25	NC_015516	TGAGAA	2	12	54334	54345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015516	TTTGCT	2	12	54724	54735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332685581
27	NC_015516	ACTTTT	2	12	56062	56073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332685583
28	NC_015516	AAAATA	2	12	56952	56963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015516	GATTAT	2	12	58834	58845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685584
30	NC_015516	TTTATA	2	12	60000	60011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015516	TAATTA	2	12	63285	63296	50 %	50 %	0 %	0 %	332685589
32	NC_015516	AGAATT	2	12	65093	65104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685591
33	NC_015516	GGAAAA	2	12	66164	66175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685592
34	NC_015516	TTTTAT	2	12	70850	70861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015516	TTTAAT	2	12	72565	72576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015516	TAATCA	2	12	73557	73568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332685599
37	NC_015516	AATTTC	2	12	79463	79474	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332685604
38	NC_015516	AATATA	2	12	83184	83195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015516	TTTTTA	2	12	83870	83881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015516	ATAAAA	2	12	85396	85407	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332685609
41	NC_015516	AAAAAG	2	12	85775	85786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332685609
42	NC_015516	CTTGTT	2	12	85874	85885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015516	TATTGG	2	12	89449	89460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332685613
44	NC_015516	TACAGT	2	12	95649	95660	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332685621
45	NC_015516	AAAATG	2	12	95873	95884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685621
46	NC_015516	TATAAA	2	12	96443	96454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015516	AAGATA	2	12	97110	97121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015516	CTTTCA	2	12	97786	97797	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332685622
49	NC_015516	TAGCAA	2	12	99215	99226	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685623
50	NC_015516	TCTTTT	2	12	99439	99450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	332685623
51	NC_015516	CCAGAA	2	12	99538	99549	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332685623
52	NC_015516	AAAATA	2	12	102841	102852	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332685627
53	NC_015516	TTATAT	2	12	103613	103624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015516	ACCAAC	2	12	104763	104774	50 %	0 %	0 %	50 %	332685628
55	NC_015516	TAAATT	2	12	104996	105007	50 %	50 %	0 %	0 %	332685628
56	NC_015516	CCTGAA	2	12	106293	106304	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332685629
57	NC_015516	GAAAAA	2	12	106770	106781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015516	TGTTAT	2	12	107698	107709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685630
59	NC_015516	TAAAAA	2	12	111980	111991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015516	TTTATA	2	12	112511	112522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015516	AAAAGA	2	12	113612	113623	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332685635
62	NC_015516	ATTTCT	2	12	114301	114312	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332685636
63	NC_015516	TATAAA	2	12	115150	115161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332685637
64	NC_015516	AATCAA	2	12	115815	115826	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332685638
65	NC_015516	TAGTTT	2	12	116698	116709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685639
66	NC_015516	ATAAAG	2	12	116916	116927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685639
67	NC_015516	CAAATC	2	12	117177	117188	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	332685639
68	NC_015516	ATGACA	2	12	118447	118458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685640
69	NC_015516	TTTTGA	2	12	118530	118541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685640
70	NC_015516	AAAATT	2	12	120535	120546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015516	TAAGAA	2	12	121464	121475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015516	GAAAAG	2	12	133221	133232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685657
73	NC_015516	ATATTG	2	12	133330	133341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685657
74	NC_015516	TAAAAG	2	12	134917	134928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685658
75	NC_015516	ATTCGT	2	12	137305	137316	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332685662
76	NC_015516	AAATGC	2	12	140390	140401	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685668
77	NC_015516	CAATTT	2	12	140507	140518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332685668
78	NC_015516	AATTGA	2	12	140918	140929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685669
79	NC_015516	GTAAAG	2	12	141669	141680	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332685670
80	NC_015516	ATTGTT	2	12	143583	143594	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685675
81	NC_015516	ATAAAA	2	12	144946	144957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332685679
82	NC_015516	CTTATA	2	12	145313	145324	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332685680
83	NC_015516	TAATTG	2	12	147716	147727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685683
84	NC_015516	AGAATT	2	12	147804	147815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685683
85	NC_015516	ATTGAA	2	12	148781	148792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685685
86	NC_015516	TATTTT	2	12	151771	151782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015516	TTAGTT	2	12	152016	152027	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332685691
88	NC_015516	AAAAAT	2	12	156133	156144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332685698
89	NC_015516	TGGATT	2	12	161494	161505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332685701
90	NC_015516	TTTATT	2	12	163622	163633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	332685704
91	NC_015516	TGGCTA	2	12	169527	169538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332685707
92	NC_015516	GATAGA	2	12	170231	170242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332685708
93	NC_015516	AATGTT	2	12	170635	170646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685708
94	NC_015516	ATAAAA	2	12	171409	171420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015516	TTTTAT	2	12	171453	171464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015516	AAAAGA	2	12	172083	172094	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332685709
97	NC_015516	AATTGA	2	12	173685	173696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685710
98	NC_015516	AAGATG	2	12	174008	174019	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332685710
99	NC_015516	AATTTG	2	12	174563	174574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685710
100	NC_015516	AAGCTA	2	12	178094	178105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685712
101	NC_015516	TTTTAA	2	12	188486	188497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015516	TGTTAC	2	12	189336	189347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332685722
103	NC_015516	AAATTT	2	12	193806	193817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015516	TATTAA	2	12	195666	195677	50 %	50 %	0 %	0 %	332685726
105	NC_015516	GATATA	2	12	196769	196780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685728
106	NC_015516	AAAATG	2	12	197868	197879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685728
107	NC_015516	ATACTA	2	12	200234	200245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	332685730
108	NC_015516	TTGGTT	2	12	200618	200629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332685730
109	NC_015516	AGTAAA	2	12	205745	205756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685734
110	NC_015516	ATGAAA	2	12	206563	206574	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332685735
111	NC_015516	AAGGAA	2	12	208568	208579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332685737
112	NC_015516	GTGACA	2	12	212808	212819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_015516	GGTGTT	2	12	222532	222543	0 %	50 %	50 %	0 %	332685748
114	NC_015516	AGCTTT	2	12	225413	225424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	332685752
115	NC_015516	ATTTTA	2	12	225918	225929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015516	ATTAAC	2	12	227393	227404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015516	TGACAA	2	12	230435	230446	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332685756
118	NC_015516	ATTTAA	2	12	231140	231151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015516	AGTAAT	2	12	231589	231600	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332685757
120	NC_015516	TATAAA	2	12	232412	232423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015516	AAAAAT	2	12	234436	234447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015516	ACAAGA	2	12	246199	246210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332685772
123	NC_015516	AAACAG	2	12	246381	246392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	332685772
124	NC_015516	TTTGAA	2	12	247598	247609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	332685772
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243	NC_015516	ATTTTT	2	12	488727	488738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_015516	TGGTGA	2	12	492886	492897	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	332685975
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351	NC_015516	ATTGAA	2	12	706577	706588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332686178
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356	NC_015516	ATTAAA	2	12	713183	713194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_015516	TAATTT	2	12	713195	713206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_015516	TTAGAA	2	12	713753	713764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
359	NC_015516	AAACTT	2	12	717701	717712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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361	NC_015516	GCCATT	2	12	722870	722881	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332686192
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475	NC_015516	TTAAAT	2	12	957477	957488	50 %	50 %	0 %	0 %	332686404
476	NC_015516	TATTTT	2	12	958009	958020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015516	TGCTTG	2	12	959121	959132	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	332686406
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