MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Melissococcus plutonius ATCC 35311 chromosome

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015516	AAAATA	2	12	8992	9003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015516	ATTTTT	2	12	14098	14109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015516	TATTTT	3	18	15873	15890	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015516	TAAAAA	2	12	27869	27880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015516	TAAAAA	2	12	33057	33068	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015516	TAATTG	2	12	33096	33107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015516	ATATTT	2	12	39775	39786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015516	TGAGAA	2	12	54334	54345	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015516	AAAATA	2	12	56952	56963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015516	TTTATA	2	12	60000	60011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015516	TTTTAT	2	12	70850	70861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015516	TTTAAT	2	12	72565	72576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015516	AATATA	2	12	83184	83195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015516	TTTTTA	2	12	83870	83881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015516	CTTGTT	2	12	85874	85885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015516	TATAAA	2	12	96443	96454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015516	AAGATA	2	12	97110	97121	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015516	TTATAT	2	12	103613	103624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015516	GAAAAA	2	12	106770	106781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015516	TAAAAA	2	12	111980	111991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015516	TTTATA	2	12	112511	112522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015516	AAAATT	2	12	120535	120546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015516	TAAGAA	2	12	121464	121475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015516	TATTTT	2	12	151771	151782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015516	ATAAAA	2	12	171409	171420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015516	TTTTAT	2	12	171453	171464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015516	TTTTAA	2	12	188486	188497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015516	AAATTT	2	12	193806	193817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015516	GTGACA	2	12	212808	212819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015516	ATTTTA	2	12	225918	225929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015516	ATTAAC	2	12	227393	227404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015516	ATTTAA	2	12	231140	231151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015516	TATAAA	2	12	232412	232423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015516	AAAAAT	2	12	234436	234447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015516	TTTTTA	2	12	250719	250730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015516	ATAAAA	2	12	250731	250742	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015516	TATTGA	2	12	251682	251693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015516	TTTAAT	2	12	271305	271316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015516	ATTAAA	2	12	291654	291665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015516	GTTTTA	2	12	315421	315432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015516	AAATTC	2	12	315485	315496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015516	TTTAAA	2	12	324516	324527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015516	ATAGAA	2	12	337114	337125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015516	ATTTTT	2	12	337389	337400	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015516	TATACA	2	12	350615	350626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015516	AATAAA	2	12	354422	354433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015516	AATTGG	2	12	362783	362794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015516	TCTTAG	2	12	365806	365817	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_015516	AATCTA	2	12	367803	367814	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015516	TAACTA	2	12	381689	381700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015516	AATATT	2	12	381775	381786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015516	TATAAA	2	12	382015	382026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015516	AAGAAA	2	12	382053	382064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015516	TTTTCT	2	12	406108	406119	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015516	TAAAAA	2	12	414069	414080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015516	AATTAA	2	12	414933	414944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015516	ATAATT	2	12	421842	421853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015516	ATTTTT	2	12	438750	438761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015516	TTATTT	2	12	438770	438781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015516	CTAAAG	2	12	441974	441985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015516	TGTATT	2	12	443504	443515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015516	ATAGTT	2	12	450920	450931	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015516	GATATA	2	12	451832	451843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015516	TTTATT	2	12	455812	455823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015516	AAATAG	2	12	462421	462432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015516	AGAATG	3	18	462551	462568	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015516	AATAAA	2	12	463037	463048	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015516	GAATAA	2	12	472472	472483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015516	AAAAAT	2	12	472534	472545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015516	TTTGTA	2	12	475459	475470	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015516	CTTTTA	2	12	486342	486353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015516	ATTTTT	2	12	488727	488738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015516	TACTTT	2	12	502543	502554	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015516	GTTAAC	2	12	521028	521039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015516	GTTAAC	2	12	521574	521585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015516	AAAAAT	2	12	522897	522908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015516	TCTAAA	2	12	528630	528641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015516	TTAAAT	2	12	533620	533631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015516	ATTAAA	2	12	554017	554028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015516	ATTTTT	2	12	554926	554937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015516	TATTTA	2	12	564617	564628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015516	TAAATT	2	12	567138	567149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015516	ATTTTT	2	12	568119	568130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015516	TATTTT	2	12	571431	571442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015516	TTTTAT	2	12	581528	581539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015516	TGTTTA	2	12	615580	615591	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015516	AAATTA	2	12	616977	616988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015516	AATAAA	2	12	617741	617752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015516	AAATAG	2	12	625679	625690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015516	TATAAT	2	12	636660	636671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015516	AAAAAT	2	12	636679	636690	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015516	ATTTTT	2	12	636842	636853	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015516	GTAAAT	2	12	639780	639791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015516	ATTTTT	2	12	660179	660190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015516	TATACT	2	12	697072	697083	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015516	TTTTAT	2	12	706226	706237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015516	TTGATT	2	12	712353	712364	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015516	ATTCTA	2	12	712536	712547	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015516	ATTAAA	2	12	713183	713194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015516	TAATTT	2	12	713195	713206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015516	TTAGAA	2	12	713753	713764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015516	AAACTT	2	12	717701	717712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015516	ATTAAA	2	12	722200	722211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015516	ATAAAA	2	12	736088	736099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015516	GTTTCA	2	12	738469	738480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015516	AAAGGC	2	12	738526	738537	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_015516	TATAAA	2	12	745453	745464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015516	AAAGAA	2	12	749747	749758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015516	CTTTAT	2	12	752519	752530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015516	ATATTG	2	12	763643	763654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015516	ATTGTA	2	12	777217	777228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015516	TTTATT	2	12	778427	778438	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015516	TACAAC	2	12	778602	778613	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015516	ATATTA	2	12	780907	780918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015516	TATTTA	2	12	812051	812062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015516	AAAAGA	2	12	825220	825231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015516	TTTTCA	2	12	864118	864129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015516	AAATAA	2	12	864192	864203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015516	ATTATA	2	12	869052	869063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015516	TAAACG	2	12	892668	892679	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015516	AATTGC	2	12	902486	902497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015516	TGATAA	2	12	909806	909817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015516	TCTTAT	2	12	915486	915497	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_015516	TTTTTA	2	12	918616	918627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015516	AAATTG	2	12	922580	922591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015516	TGTAAT	2	12	930327	930338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015516	TAAAAA	2	12	930514	930525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015516	TTTTAC	2	12	937279	937290	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_015516	AATAAC	2	12	950681	950692	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_015516	TAATAT	2	12	957032	957043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015516	TATTTT	2	12	958009	958020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015516	AGTTAA	2	12	960373	960384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015516	GCAGAA	2	12	966293	966304	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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249	NC_015516	CTTCAG	2	12	1890368	1890379	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.