MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	CCCGGC	2	12	3257	3268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
2	NC_015513	TGGAGA	2	12	4641	4652	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015513	CAAAGC	2	12	6191	6202	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332668456
4	NC_015513	CTTTGC	2	12	10136	10147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332668460
5	NC_015513	ACCATT	2	12	10893	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668460
6	NC_015513	CGGCAG	2	12	17835	17846	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332668464
7	NC_015513	GCCAAT	2	12	22114	22125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332668465
8	NC_015513	CCGATG	2	12	22687	22698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332668466
9	NC_015513	AACCTG	2	12	24364	24375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332668467
10	NC_015513	TGGGGG	2	12	25962	25973	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	332668467
11	NC_015513	GAAAAA	2	12	26050	26061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332668467
12	NC_015513	TGTACC	2	12	28733	28744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332668468
13	NC_015513	ATCACC	2	12	31725	31736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668471
14	NC_015513	CAATGG	2	12	48041	48052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_015513	GTGAAA	2	12	54958	54969	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332668489
16	NC_015513	CCATGG	2	12	55117	55128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332668489
17	NC_015513	GTTGCG	2	12	60203	60214	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332668493
18	NC_015513	TTAAAA	2	12	60497	60508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015513	TCCAAC	2	12	63629	63640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668494
20	NC_015513	TTTCCT	2	12	65202	65213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668495
21	NC_015513	ATTTAA	2	12	67726	67737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015513	TTTCCT	2	12	75868	75879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668506
23	NC_015513	AAAATG	2	12	76243	76254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332668507
24	NC_015513	AACCTC	2	12	76815	76826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668508
25	NC_015513	TTTCCA	2	12	79983	79994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332668512
26	NC_015513	TGGTTT	2	12	83033	83044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015513	GAAATT	2	12	89292	89303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332668521
28	NC_015513	AAGGTT	2	12	89437	89448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668521

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.