MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	CCCGGC	2	12	3257	3268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332668454
2	NC_015513	CAAAGC	2	12	6191	6202	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332668456
3	NC_015513	CTTTGC	2	12	10136	10147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	332668460
4	NC_015513	ACCATT	2	12	10893	10904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332668460
5	NC_015513	CGGCAG	2	12	17835	17846	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	332668464
6	NC_015513	GCCAAT	2	12	22114	22125	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332668465
7	NC_015513	CCGATG	2	12	22687	22698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332668466
8	NC_015513	AACCTG	2	12	24364	24375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	332668467
9	NC_015513	TGGGGG	2	12	25962	25973	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	332668467
10	NC_015513	GAAAAA	2	12	26050	26061	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	332668467
11	NC_015513	TGTACC	2	12	28733	28744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332668468
12	NC_015513	ATCACC	2	12	31725	31736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668471
13	NC_015513	GTGAAA	2	12	54958	54969	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332668489
14	NC_015513	CCATGG	2	12	55117	55128	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	332668489
15	NC_015513	GTTGCG	2	12	60203	60214	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	332668493
16	NC_015513	TCCAAC	2	12	63629	63640	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668494
17	NC_015513	TTTCCT	2	12	65202	65213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668495
18	NC_015513	TTTCCT	2	12	75868	75879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332668506
19	NC_015513	AAAATG	2	12	76243	76254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332668507
20	NC_015513	AACCTC	2	12	76815	76826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332668508
21	NC_015513	TTTCCA	2	12	79983	79994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332668512
22	NC_015513	GAAATT	2	12	89292	89303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332668521
23	NC_015513	AAGGTT	2	12	89437	89448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332668521

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.