MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY03

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015513	CGGG	2	8	8817	8824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015513	CAGC	2	8	9800	9807	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015513	CAAG	2	8	16763	16770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015513	AGCA	2	8	33501	33508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015513	CCAA	2	8	48267	48274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015513	TTAC	2	8	60579	60586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015513	GTAG	2	8	61306	61313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015513	CTTG	2	8	61506	61513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015513	GGAG	2	8	61553	61560	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015513	AGCG	2	8	61889	61896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015513	CATT	2	8	62282	62289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015513	CAAG	2	8	62346	62353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015513	TTGT	2	8	64643	64650	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015513	AAAT	2	8	64759	64766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015513	TGAA	2	8	66341	66348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015513	AATT	2	8	67363	67370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015513	ATTA	2	8	67371	67378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015513	TACA	2	8	67699	67706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015513	ATTT	2	8	67784	67791	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015513	TATT	2	8	67972	67979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015513	ATTG	2	8	79127	79134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015513	TTTA	2	8	80656	80663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015513	CTAA	2	8	83062	83069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015513	TGAT	2	8	86291	86298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015513	GATT	2	8	87629	87636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015513	ATTT	2	8	87637	87644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015513	CCTG	2	8	87737	87744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015513	GGTA	2	8	90416	90423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015513	TAGT	2	8	91629	91636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015513	AATC	2	8	91644	91651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015513	TTTA	2	8	92038	92045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.