MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 1611

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	GCG	2	6	402	407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661891
2	NC_015512	GGA	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661891
3	NC_015512	GCA	2	6	747	752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
4	NC_015512	CGA	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
5	NC_015512	CTC	2	6	798	803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661892
6	NC_015512	GAC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
7	NC_015512	CTA	3	9	893	901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661892
8	NC_015512	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661892
9	NC_015512	GTG	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661892
10	NC_015512	ACT	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661892
11	NC_015512	GCA	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
12	NC_015512	ACG	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
13	NC_015512	TGC	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661892
14	NC_015512	GAA	2	6	1383	1388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661892
15	NC_015512	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661892
16	NC_015512	GGT	2	6	1424	1429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661892
17	NC_015512	GCC	2	6	1551	1556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661892
18	NC_015512	TGC	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661892
19	NC_015512	GAA	2	6	1704	1709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661892
20	NC_015512	CAG	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661892
21	NC_015512	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661893
22	NC_015512	TCA	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661893
23	NC_015512	GTG	2	6	2018	2023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661893
24	NC_015512	GGC	2	6	2113	2118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
25	NC_015512	CAA	2	6	2156	2161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
26	NC_015512	CAG	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
27	NC_015512	AGC	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
28	NC_015512	CTG	2	6	2279	2284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
29	NC_015512	TGC	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
30	NC_015512	TGA	2	6	2571	2576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661893
31	NC_015512	GGC	2	6	2587	2592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
32	NC_015512	AGC	2	6	2600	2605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
33	NC_015512	GGA	2	6	2656	2661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661893
34	NC_015512	GCA	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
35	NC_015512	CGA	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661893
36	NC_015512	CTA	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661893
37	NC_015512	TTG	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
38	NC_015512	GAA	2	6	2807	2812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
39	NC_015512	CTG	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
40	NC_015512	GCG	2	6	2848	2853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
41	NC_015512	GCT	2	6	2905	2910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661893
42	NC_015512	GCG	2	6	2938	2943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
43	NC_015512	GGC	2	6	3069	3074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
44	NC_015512	TTG	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
45	NC_015512	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661893
46	NC_015512	TGT	2	6	3141	3146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661893
47	NC_015512	ATG	2	6	3165	3170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661893
48	NC_015512	AAG	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
49	NC_015512	ATA	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332661893
50	NC_015512	AAC	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
51	NC_015512	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661893
52	NC_015512	AAC	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661893
53	NC_015512	GCG	2	6	3404	3409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661893
54	NC_015512	GAT	2	6	3624	3629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661894
55	NC_015512	CAT	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661894
56	NC_015512	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661894
57	NC_015512	TGG	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661894
58	NC_015512	CTG	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
59	NC_015512	CTG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
60	NC_015512	GAC	2	6	4512	4517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
61	NC_015512	TGC	2	6	4577	4582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
62	NC_015512	CTG	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
63	NC_015512	CCG	2	6	4732	4737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661894
64	NC_015512	CCG	2	6	4960	4965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661894
65	NC_015512	GAC	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
66	NC_015512	GAC	2	6	5085	5090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
67	NC_015512	GAC	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661894
68	NC_015512	ACC	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661894
69	NC_015512	ACT	2	6	5465	5470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661894
70	NC_015512	CTC	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661894
71	NC_015512	GGC	2	6	5597	5602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
72	NC_015512	GCG	2	6	5676	5681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
73	NC_015512	GCT	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
74	NC_015512	TGC	2	6	5728	5733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661894
75	NC_015512	GCG	2	6	5742	5747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661894
76	NC_015512	GAT	2	6	5757	5762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661894
77	NC_015512	AGG	2	6	5815	5820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661894
78	NC_015512	ATT	2	6	5924	5929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661895
79	NC_015512	GCA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661895
80	NC_015512	GAT	2	6	6075	6080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
81	NC_015512	CCG	2	6	6242	6247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661895
82	NC_015512	AAG	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661895
83	NC_015512	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
84	NC_015512	CCG	2	6	6973	6978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661895
85	NC_015512	TGA	2	6	7028	7033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
86	NC_015512	CCG	2	6	7099	7104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332661895
87	NC_015512	ATT	2	6	7323	7328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661895
88	NC_015512	CTC	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661895
89	NC_015512	GGC	2	6	7481	7486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661895
90	NC_015512	GCG	3	9	7557	7565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661895
91	NC_015512	GCT	2	6	7583	7588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661895
92	NC_015512	TGC	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661895
93	NC_015512	GCG	2	6	7626	7631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661895
94	NC_015512	GAT	2	6	7641	7646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661895
95	NC_015512	TGA	2	6	8132	8137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661896
96	NC_015512	ATT	3	9	8270	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661897
97	NC_015512	GAA	2	6	8299	8304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661897
98	NC_015512	TTG	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661897
99	NC_015512	TGC	2	6	8391	8396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661897
100	NC_015512	TTG	2	6	8582	8587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661898
101	NC_015512	CTT	2	6	8723	8728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661898
102	NC_015512	TGC	2	6	8760	8765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661898
103	NC_015512	TGA	2	6	8799	8804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
104	NC_015512	GCT	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661898
105	NC_015512	GAT	2	6	8947	8952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
106	NC_015512	CGA	2	6	9048	9053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661898
107	NC_015512	GAT	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
108	NC_015512	AAG	2	6	9320	9325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661898
109	NC_015512	CGA	2	6	9396	9401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661898
110	NC_015512	ATT	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661898
111	NC_015512	GGA	2	6	9460	9465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661898
112	NC_015512	GAT	2	6	9565	9570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
113	NC_015512	AGC	2	6	9587	9592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661898
114	NC_015512	ATC	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661898
115	NC_015512	TGA	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
116	NC_015512	CAA	2	6	9705	9710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661898
117	NC_015512	AGC	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661898
118	NC_015512	AAC	2	6	9841	9846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661898
119	NC_015512	TGA	2	6	9885	9890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661898
120	NC_015512	ACC	2	6	9904	9909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661898
121	NC_015512	GGA	2	6	10021	10026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661898
122	NC_015512	CAA	2	6	10043	10048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661898
123	NC_015512	ATC	2	6	10067	10072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661898
124	NC_015512	ATT	2	6	10157	10162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332661898
125	NC_015512	CAT	2	6	10209	10214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661898
126	NC_015512	TTC	2	6	10286	10291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661899
127	NC_015512	AGA	2	6	10319	10324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661899
128	NC_015512	CAA	2	6	10522	10527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661899
129	NC_015512	TGA	2	6	10562	10567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661899
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152	NC_015512	GAC	2	6	12017	12022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661900
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239	NC_015512	TGT	2	6	18260	18265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661904
240	NC_015512	GCG	2	6	18276	18281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661904
241	NC_015512	TCG	2	6	18307	18312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661904
242	NC_015512	CCA	2	6	18437	18442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661904
243	NC_015512	CAA	2	6	18570	18575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661904
244	NC_015512	CTC	2	6	18762	18767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661904
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250	NC_015512	CCA	2	6	19295	19300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661904
251	NC_015512	TAG	2	6	19345	19350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
252	NC_015512	CAG	2	6	19427	19432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661904
253	NC_015512	GCG	2	6	19436	19441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332661904
254	NC_015512	CCT	2	6	19574	19579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661904
255	NC_015512	CAG	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661904
256	NC_015512	CAA	2	6	19653	19658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332661904
257	NC_015512	AGC	2	6	19686	19691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332661904
258	NC_015512	ATG	2	6	19885	19890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
259	NC_015512	TTG	2	6	19906	19911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661904
260	NC_015512	TTC	2	6	19981	19986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661904
261	NC_015512	TGG	2	6	19997	20002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661904
262	NC_015512	ATG	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
263	NC_015512	GAT	2	6	20199	20204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661904
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324	NC_015512	CCT	2	6	24788	24793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332661907
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379	NC_015512	GAA	2	6	28422	28427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332661908
380	NC_015512	GTT	2	6	28436	28441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661908
381	NC_015512	TGG	2	6	28531	28536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332661908
382	NC_015512	TGA	2	6	28930	28935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332661908
383	NC_015512	TGC	2	6	28996	29001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661908
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385	NC_015512	ATC	2	6	29216	29221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332661908
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452	NC_015512	TTC	2	6	35226	35231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332661912
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455	NC_015512	TCG	2	6	35575	35580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332661912
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496	NC_015512	ACC	2	6	40982	40987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661919
497	NC_015512	GAG	3	9	41140	41148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332661919
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499	NC_015512	GTT	2	6	41241	41246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332661919
500	NC_015512	CAC	2	6	41275	41280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332661919

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