MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	AC	3	6	54	59	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015512	AT	3	6	683	688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015512	TC	3	6	4099	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	332661894
4	NC_015512	TC	3	6	6868	6873	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
5	NC_015512	TC	3	6	6994	6999	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
6	NC_015512	GT	3	6	7735	7740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015512	GA	3	6	9577	9582	50 %	0 %	50 %	0 %	332661898
8	NC_015512	TG	4	8	9788	9795	0 %	50 %	50 %	0 %	332661898
9	NC_015512	AG	4	8	9876	9883	50 %	0 %	50 %	0 %	332661898
10	NC_015512	GA	3	6	17622	17627	50 %	0 %	50 %	0 %	332661903
11	NC_015512	GC	3	6	17833	17838	0 %	0 %	50 %	50 %	332661903
12	NC_015512	GC	3	6	19730	19735	0 %	0 %	50 %	50 %	332661904
13	NC_015512	TG	3	6	21315	21320	0 %	50 %	50 %	0 %	332661905
14	NC_015512	AG	3	6	23379	23384	50 %	0 %	50 %	0 %	332661906
15	NC_015512	AG	3	6	23610	23615	50 %	0 %	50 %	0 %	332661906
16	NC_015512	CA	3	6	24581	24586	50 %	0 %	0 %	50 %	332661907
17	NC_015512	TC	3	6	32433	32438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015512	TG	3	6	32533	32538	0 %	50 %	50 %	0 %	332661911
19	NC_015512	TA	3	6	34890	34895	50 %	50 %	0 %	0 %	332661912
20	NC_015512	GC	3	6	41562	41567	0 %	0 %	50 %	50 %	332661919
21	NC_015512	AC	5	10	42708	42717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015512	GC	4	8	45013	45020	0 %	0 %	50 %	50 %	332661922
23	NC_015512	GT	3	6	47752	47757	0 %	50 %	50 %	0 %	332661923
24	NC_015512	CT	3	6	48285	48290	0 %	50 %	0 %	50 %	332661925
25	NC_015512	GA	3	6	49105	49110	50 %	0 %	50 %	0 %	332661926
26	NC_015512	AT	3	6	49475	49480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015512	TA	4	8	50410	50417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015512	GT	3	6	53602	53607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015512	CA	3	6	54020	54025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015512	TG	3	6	54052	54057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015512	GA	3	6	55425	55430	50 %	0 %	50 %	0 %	332661932
32	NC_015512	TC	3	6	59680	59685	0 %	50 %	0 %	50 %	332661936
33	NC_015512	TG	3	6	61739	61744	0 %	50 %	50 %	0 %	332661937
34	NC_015512	CT	3	6	62359	62364	0 %	50 %	0 %	50 %	332661937
35	NC_015512	TA	3	6	62967	62972	50 %	50 %	0 %	0 %	332661937
36	NC_015512	AC	3	6	63929	63934	50 %	0 %	0 %	50 %	332661938
37	NC_015512	TG	3	6	64599	64604	0 %	50 %	50 %	0 %	332661939
38	NC_015512	GC	3	6	64608	64613	0 %	0 %	50 %	50 %	332661939
39	NC_015512	TG	3	6	65354	65359	0 %	50 %	50 %	0 %	332661939
40	NC_015512	TG	3	6	66046	66051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015512	GA	3	6	67373	67378	50 %	0 %	50 %	0 %	332661940
42	NC_015512	AT	3	6	70721	70726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015512	CA	3	6	70852	70857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015512	GA	3	6	73204	73209	50 %	0 %	50 %	0 %	332661946
45	NC_015512	GC	3	6	73642	73647	0 %	0 %	50 %	50 %	332661947
46	NC_015512	GT	3	6	74877	74882	0 %	50 %	50 %	0 %	332661948
47	NC_015512	GC	3	6	76100	76105	0 %	0 %	50 %	50 %	332661948
48	NC_015512	GA	3	6	77060	77065	50 %	0 %	50 %	0 %	332661949
49	NC_015512	GC	3	6	78354	78359	0 %	0 %	50 %	50 %	332661950
50	NC_015512	TC	3	6	78758	78763	0 %	50 %	0 %	50 %	332661950
51	NC_015512	GA	3	6	78969	78974	50 %	0 %	50 %	0 %	332661950
52	NC_015512	AG	3	6	80043	80048	50 %	0 %	50 %	0 %	332661950
53	NC_015512	AT	3	6	80898	80903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015512	TG	4	8	80914	80921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015512	GA	4	8	81292	81299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015512	GC	3	6	82953	82958	0 %	0 %	50 %	50 %	332661952
57	NC_015512	AC	3	6	84586	84591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015512	TA	3	6	84793	84798	50 %	50 %	0 %	0 %	332661954
59	NC_015512	GT	3	6	85981	85986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015512	CA	3	6	86407	86412	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
61	NC_015512	CA	3	6	86620	86625	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
62	NC_015512	CA	3	6	86793	86798	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
63	NC_015512	AC	3	6	87059	87064	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
64	NC_015512	CG	3	6	87896	87901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015512	CA	3	6	87906	87911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015512	CG	3	6	87937	87942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015512	CG	3	6	92379	92384	0 %	0 %	50 %	50 %	332661962
68	NC_015512	CG	3	6	96440	96445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015512	AG	3	6	98129	98134	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
70	NC_015512	AG	3	6	99347	99352	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
71	NC_015512	CT	3	6	99353	99358	0 %	50 %	0 %	50 %	332661967
72	NC_015512	AG	3	6	99673	99678	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
73	NC_015512	TG	3	6	100656	100661	0 %	50 %	50 %	0 %	332661967
74	NC_015512	GA	3	6	103055	103060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015512	AG	3	6	103110	103115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015512	AT	3	6	103332	103337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015512	AT	3	6	103547	103552	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
78	NC_015512	TA	3	6	103935	103940	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
79	NC_015512	AT	3	6	104554	104559	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
80	NC_015512	TA	3	6	104646	104651	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
81	NC_015512	AG	3	6	105110	105115	50 %	0 %	50 %	0 %	332661970
82	NC_015512	TC	4	8	105120	105127	0 %	50 %	0 %	50 %	332661970
83	NC_015512	AG	3	6	105212	105217	50 %	0 %	50 %	0 %	332661970
84	NC_015512	GA	3	6	105927	105932	50 %	0 %	50 %	0 %	332661971
85	NC_015512	CT	3	6	108211	108216	0 %	50 %	0 %	50 %	332661971
86	NC_015512	GA	4	8	109530	109537	50 %	0 %	50 %	0 %	332661971
87	NC_015512	GA	3	6	110484	110489	50 %	0 %	50 %	0 %	332661972
88	NC_015512	CT	3	6	111149	111154	0 %	50 %	0 %	50 %	332661972
89	NC_015512	AT	3	6	111201	111206	50 %	50 %	0 %	0 %	332661972
90	NC_015512	TC	3	6	111745	111750	0 %	50 %	0 %	50 %	332661973
91	NC_015512	TA	3	6	112091	112096	50 %	50 %	0 %	0 %	332661973
92	NC_015512	TC	3	6	115870	115875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015512	GA	3	6	117576	117581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015512	TC	3	6	119929	119934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015512	TA	3	6	119974	119979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015512	AT	3	6	119988	119993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015512	AT	3	6	120030	120035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015512	TA	3	6	120064	120069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015512	AT	3	6	120133	120138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015512	AC	3	6	120168	120173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015512	GT	3	6	121997	122002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015512	TC	3	6	128906	128911	0 %	50 %	0 %	50 %	332661986
103	NC_015512	AT	3	6	129537	129542	50 %	50 %	0 %	0 %	332661986
104	NC_015512	TG	3	6	129992	129997	0 %	50 %	50 %	0 %	332661986
105	NC_015512	CT	3	6	130809	130814	0 %	50 %	0 %	50 %	332661987
106	NC_015512	CG	3	6	134998	135003	0 %	0 %	50 %	50 %	332661991
107	NC_015512	AG	3	6	135151	135156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015512	GC	3	6	142565	142570	0 %	0 %	50 %	50 %	332661998

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.