MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY02

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015512	TC	3	6	4099	4104	0 %	50 %	0 %	50 %	332661894
2	NC_015512	TC	3	6	6868	6873	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
3	NC_015512	TC	3	6	6994	6999	0 %	50 %	0 %	50 %	332661895
4	NC_015512	GA	3	6	9577	9582	50 %	0 %	50 %	0 %	332661898
5	NC_015512	TG	4	8	9788	9795	0 %	50 %	50 %	0 %	332661898
6	NC_015512	AG	4	8	9876	9883	50 %	0 %	50 %	0 %	332661898
7	NC_015512	GA	3	6	17622	17627	50 %	0 %	50 %	0 %	332661903
8	NC_015512	GC	3	6	17833	17838	0 %	0 %	50 %	50 %	332661903
9	NC_015512	GC	3	6	19730	19735	0 %	0 %	50 %	50 %	332661904
10	NC_015512	TG	3	6	21315	21320	0 %	50 %	50 %	0 %	332661905
11	NC_015512	AG	3	6	23379	23384	50 %	0 %	50 %	0 %	332661906
12	NC_015512	AG	3	6	23610	23615	50 %	0 %	50 %	0 %	332661906
13	NC_015512	CA	3	6	24581	24586	50 %	0 %	0 %	50 %	332661907
14	NC_015512	TG	3	6	32533	32538	0 %	50 %	50 %	0 %	332661911
15	NC_015512	TA	3	6	34890	34895	50 %	50 %	0 %	0 %	332661912
16	NC_015512	GC	3	6	41562	41567	0 %	0 %	50 %	50 %	332661919
17	NC_015512	GC	4	8	45013	45020	0 %	0 %	50 %	50 %	332661922
18	NC_015512	GT	3	6	47752	47757	0 %	50 %	50 %	0 %	332661923
19	NC_015512	CT	3	6	48285	48290	0 %	50 %	0 %	50 %	332661925
20	NC_015512	GA	3	6	49105	49110	50 %	0 %	50 %	0 %	332661926
21	NC_015512	GA	3	6	55425	55430	50 %	0 %	50 %	0 %	332661932
22	NC_015512	TC	3	6	59680	59685	0 %	50 %	0 %	50 %	332661936
23	NC_015512	TG	3	6	61739	61744	0 %	50 %	50 %	0 %	332661937
24	NC_015512	CT	3	6	62359	62364	0 %	50 %	0 %	50 %	332661937
25	NC_015512	TA	3	6	62967	62972	50 %	50 %	0 %	0 %	332661937
26	NC_015512	AC	3	6	63929	63934	50 %	0 %	0 %	50 %	332661938
27	NC_015512	TG	3	6	64599	64604	0 %	50 %	50 %	0 %	332661939
28	NC_015512	GC	3	6	64608	64613	0 %	0 %	50 %	50 %	332661939
29	NC_015512	TG	3	6	65354	65359	0 %	50 %	50 %	0 %	332661939
30	NC_015512	GA	3	6	67373	67378	50 %	0 %	50 %	0 %	332661940
31	NC_015512	GA	3	6	73204	73209	50 %	0 %	50 %	0 %	332661946
32	NC_015512	GC	3	6	73642	73647	0 %	0 %	50 %	50 %	332661947
33	NC_015512	GT	3	6	74877	74882	0 %	50 %	50 %	0 %	332661948
34	NC_015512	GC	3	6	76100	76105	0 %	0 %	50 %	50 %	332661948
35	NC_015512	GA	3	6	77060	77065	50 %	0 %	50 %	0 %	332661949
36	NC_015512	GC	3	6	78354	78359	0 %	0 %	50 %	50 %	332661950
37	NC_015512	TC	3	6	78758	78763	0 %	50 %	0 %	50 %	332661950
38	NC_015512	GA	3	6	78969	78974	50 %	0 %	50 %	0 %	332661950
39	NC_015512	AG	3	6	80043	80048	50 %	0 %	50 %	0 %	332661950
40	NC_015512	GC	3	6	82953	82958	0 %	0 %	50 %	50 %	332661952
41	NC_015512	TA	3	6	84793	84798	50 %	50 %	0 %	0 %	332661954
42	NC_015512	CA	3	6	86407	86412	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
43	NC_015512	CA	3	6	86620	86625	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
44	NC_015512	CA	3	6	86793	86798	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
45	NC_015512	AC	3	6	87059	87064	50 %	0 %	0 %	50 %	332661956
46	NC_015512	CG	3	6	92379	92384	0 %	0 %	50 %	50 %	332661962
47	NC_015512	AG	3	6	98129	98134	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
48	NC_015512	AG	3	6	99347	99352	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
49	NC_015512	CT	3	6	99353	99358	0 %	50 %	0 %	50 %	332661967
50	NC_015512	AG	3	6	99673	99678	50 %	0 %	50 %	0 %	332661967
51	NC_015512	TG	3	6	100656	100661	0 %	50 %	50 %	0 %	332661967
52	NC_015512	AT	3	6	103547	103552	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
53	NC_015512	TA	3	6	103935	103940	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
54	NC_015512	AT	3	6	104554	104559	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
55	NC_015512	TA	3	6	104646	104651	50 %	50 %	0 %	0 %	332661970
56	NC_015512	AG	3	6	105110	105115	50 %	0 %	50 %	0 %	332661970
57	NC_015512	TC	4	8	105120	105127	0 %	50 %	0 %	50 %	332661970
58	NC_015512	AG	3	6	105212	105217	50 %	0 %	50 %	0 %	332661970
59	NC_015512	GA	3	6	105927	105932	50 %	0 %	50 %	0 %	332661971
60	NC_015512	CT	3	6	108211	108216	0 %	50 %	0 %	50 %	332661971
61	NC_015512	GA	4	8	109530	109537	50 %	0 %	50 %	0 %	332661971
62	NC_015512	GA	3	6	110484	110489	50 %	0 %	50 %	0 %	332661972
63	NC_015512	CT	3	6	111149	111154	0 %	50 %	0 %	50 %	332661972
64	NC_015512	AT	3	6	111201	111206	50 %	50 %	0 %	0 %	332661972
65	NC_015512	TC	3	6	111745	111750	0 %	50 %	0 %	50 %	332661973
66	NC_015512	TA	3	6	112091	112096	50 %	50 %	0 %	0 %	332661973
67	NC_015512	TC	3	6	128906	128911	0 %	50 %	0 %	50 %	332661986
68	NC_015512	AT	3	6	129537	129542	50 %	50 %	0 %	0 %	332661986
69	NC_015512	TG	3	6	129992	129997	0 %	50 %	50 %	0 %	332661986
70	NC_015512	CT	3	6	130809	130814	0 %	50 %	0 %	50 %	332661987
71	NC_015512	CG	3	6	134998	135003	0 %	0 %	50 %	50 %	332661991
72	NC_015512	GC	3	6	142565	142570	0 %	0 %	50 %	50 %	332661998

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.