MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 374

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	ACCA	2	8	417	424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015511	CAAA	2	8	561	568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015511	GGAT	2	8	998	1005	25 %	25 %	50 %	0 %	332661769
4	NC_015511	TTAT	2	8	1347	1354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015511	GGAG	2	8	1473	1480	25 %	0 %	75 %	0 %	332661770
6	NC_015511	TGGA	2	8	1967	1974	25 %	25 %	50 %	0 %	332661770
7	NC_015511	TGGA	2	8	2785	2792	25 %	25 %	50 %	0 %	332661771
8	NC_015511	CAGC	2	8	3177	3184	25 %	0 %	25 %	50 %	332661771
9	NC_015511	ATTT	2	8	3251	3258	25 %	75 %	0 %	0 %	332661771
10	NC_015511	TTCA	2	8	4011	4018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015511	GATC	2	8	4488	4495	25 %	25 %	25 %	25 %	332661772
12	NC_015511	GGCG	2	8	5125	5132	0 %	0 %	75 %	25 %	332661772
13	NC_015511	GATG	2	8	6541	6548	25 %	25 %	50 %	0 %	332661774
14	NC_015511	CAAT	2	8	7412	7419	50 %	25 %	0 %	25 %	332661775
15	NC_015511	ACCT	2	8	8119	8126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015511	GTGA	2	8	8481	8488	25 %	25 %	50 %	0 %	332661776
17	NC_015511	TCCA	2	8	8802	8809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015511	CATC	2	8	9300	9307	25 %	25 %	0 %	50 %	332661778
19	NC_015511	GCGG	2	8	10252	10259	0 %	0 %	75 %	25 %	332661779
20	NC_015511	TCCC	2	8	10378	10385	0 %	25 %	0 %	75 %	332661779
21	NC_015511	TGCT	2	8	11034	11041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015511	TGCT	2	8	11089	11096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015511	ACCA	2	8	11543	11550	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
24	NC_015511	TGTC	2	8	11624	11631	0 %	50 %	25 %	25 %	332661781
25	NC_015511	TGTA	2	8	11751	11758	25 %	50 %	25 %	0 %	332661781
26	NC_015511	ACCA	2	8	12047	12054	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
27	NC_015511	TGTA	2	8	12381	12388	25 %	50 %	25 %	0 %	332661781
28	NC_015511	ACCA	2	8	13055	13062	50 %	0 %	0 %	50 %	332661781
29	NC_015511	AGTC	2	8	13689	13696	25 %	25 %	25 %	25 %	332661781
30	NC_015511	GACT	2	8	13993	14000	25 %	25 %	25 %	25 %	332661781
31	NC_015511	CTGG	2	8	14050	14057	0 %	25 %	50 %	25 %	332661781
32	NC_015511	TTGT	2	8	14159	14166	0 %	75 %	25 %	0 %	332661781
33	NC_015511	AGAT	2	8	14346	14353	50 %	25 %	25 %	0 %	332661781
34	NC_015511	AAAT	2	8	15341	15348	75 %	25 %	0 %	0 %	332661781
35	NC_015511	GGTA	2	8	15974	15981	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
36	NC_015511	AACC	2	8	16117	16124	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
37	NC_015511	AGCA	2	8	16223	16230	50 %	0 %	25 %	25 %	332661782
38	NC_015511	ACCA	2	8	17000	17007	50 %	0 %	0 %	50 %	332661782
39	NC_015511	AAAT	2	8	17693	17700	75 %	25 %	0 %	0 %	332661782
40	NC_015511	ATTG	2	8	17820	17827	25 %	50 %	25 %	0 %	332661782
41	NC_015511	CAGG	2	8	17946	17953	25 %	0 %	50 %	25 %	332661782
42	NC_015511	GAGT	2	8	18078	18085	25 %	25 %	50 %	0 %	332661782
43	NC_015511	ACCG	2	8	18439	18446	25 %	0 %	25 %	50 %	332661782
44	NC_015511	TTCG	2	8	19248	19255	0 %	50 %	25 %	25 %	332661782
45	NC_015511	CCTT	2	8	19745	19752	0 %	50 %	0 %	50 %	332661782
46	NC_015511	AGTC	2	8	19917	19924	25 %	25 %	25 %	25 %	332661782
47	NC_015511	TTGA	2	8	20252	20259	25 %	50 %	25 %	0 %	332661783
48	NC_015511	GACT	2	8	23560	23567	25 %	25 %	25 %	25 %	332661784
49	NC_015511	CGGT	2	8	24410	24417	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
50	NC_015511	GGCT	2	8	24564	24571	0 %	25 %	50 %	25 %	332661784
51	NC_015511	GGTA	2	8	25788	25795	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
52	NC_015511	GGTA	2	8	26649	26656	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
53	NC_015511	CCCT	2	8	26926	26933	0 %	25 %	0 %	75 %	332661785
54	NC_015511	TTAC	2	8	27835	27842	25 %	50 %	0 %	25 %	332661785
55	NC_015511	GGTA	2	8	28470	28477	25 %	25 %	50 %	0 %	332661785
56	NC_015511	TACG	2	8	28909	28916	25 %	25 %	25 %	25 %	332661785
57	NC_015511	GATT	2	8	29756	29763	25 %	50 %	25 %	0 %	332661785
58	NC_015511	GCCC	2	8	29925	29932	0 %	0 %	25 %	75 %	332661785
59	NC_015511	TGCG	2	8	30823	30830	0 %	25 %	50 %	25 %	332661785
60	NC_015511	AAAC	2	8	31413	31420	75 %	0 %	0 %	25 %	332661785
61	NC_015511	TGCG	2	8	31498	31505	0 %	25 %	50 %	25 %	332661785
62	NC_015511	TTGG	2	8	31821	31828	0 %	50 %	50 %	0 %	332661786
63	NC_015511	AAAG	2	8	32726	32733	75 %	0 %	25 %	0 %	332661787
64	NC_015511	ATGG	2	8	32746	32753	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
65	NC_015511	TGCG	2	8	33227	33234	0 %	25 %	50 %	25 %	332661787
66	NC_015511	TTTG	2	8	33270	33277	0 %	75 %	25 %	0 %	332661787
67	NC_015511	TGAG	2	8	33914	33921	25 %	25 %	50 %	0 %	332661787
68	NC_015511	AAAT	2	8	34210	34217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015511	CTGT	2	8	34447	34454	0 %	50 %	25 %	25 %	332661788
70	NC_015511	GAAT	2	8	34832	34839	50 %	25 %	25 %	0 %	332661788
71	NC_015511	CCCA	2	8	35193	35200	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_015511	CTTT	2	8	35439	35446	0 %	75 %	0 %	25 %	332661789
73	NC_015511	CATA	2	8	35692	35699	50 %	25 %	0 %	25 %	332661789
74	NC_015511	AAAC	2	8	36915	36922	75 %	0 %	0 %	25 %	332661790
75	NC_015511	GGAA	2	8	36948	36955	50 %	0 %	50 %	0 %	332661790
76	NC_015511	GAAC	2	8	37969	37976	50 %	0 %	25 %	25 %	332661790
77	NC_015511	CTAC	2	8	38243	38250	25 %	25 %	0 %	50 %	332661791
78	NC_015511	ACAG	2	8	39062	39069	50 %	0 %	25 %	25 %	332661791
79	NC_015511	TTTG	2	8	39296	39303	0 %	75 %	25 %	0 %	332661791
80	NC_015511	TATT	2	8	39906	39913	25 %	75 %	0 %	0 %	332661792
81	NC_015511	CTTT	2	8	40414	40421	0 %	75 %	0 %	25 %	332661792
82	NC_015511	TAAT	2	8	40482	40489	50 %	50 %	0 %	0 %	332661792
83	NC_015511	TAAA	2	8	41147	41154	75 %	25 %	0 %	0 %	332661792
84	NC_015511	CTTT	2	8	41307	41314	0 %	75 %	0 %	25 %	332661792
85	NC_015511	GCCA	2	8	41323	41330	25 %	0 %	25 %	50 %	332661792
86	NC_015511	GTAA	2	8	41412	41419	50 %	25 %	25 %	0 %	332661792
87	NC_015511	AATC	2	8	42242	42249	50 %	25 %	0 %	25 %	332661792
88	NC_015511	TCCT	2	8	42557	42564	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
89	NC_015511	TCAA	2	8	43317	43324	50 %	25 %	0 %	25 %	332661792
90	NC_015511	TGAT	2	8	43438	43445	25 %	50 %	25 %	0 %	332661792
91	NC_015511	TTCC	2	8	44017	44024	0 %	50 %	0 %	50 %	332661792
92	NC_015511	ATGA	2	8	44475	44482	50 %	25 %	25 %	0 %	332661792
93	NC_015511	GCCA	2	8	46228	46235	25 %	0 %	25 %	50 %	332661795
94	NC_015511	TTGG	2	8	46509	46516	0 %	50 %	50 %	0 %	332661795
95	NC_015511	TACG	2	8	46636	46643	25 %	25 %	25 %	25 %	332661795
96	NC_015511	TTTA	2	8	46947	46954	25 %	75 %	0 %	0 %	332661795
97	NC_015511	GAAA	2	8	47302	47309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015511	AGGA	2	8	47486	47493	50 %	0 %	50 %	0 %	332661796
99	NC_015511	GATT	2	8	47706	47713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015511	ACTG	2	8	47895	47902	25 %	25 %	25 %	25 %	332661797
101	NC_015511	GGTT	2	8	48068	48075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015511	CTTT	2	8	48126	48133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015511	TCGC	2	8	48244	48251	0 %	25 %	25 %	50 %	332661798
104	NC_015511	TAAC	2	8	48994	49001	50 %	25 %	0 %	25 %	332661799
105	NC_015511	GAAC	2	8	49210	49217	50 %	0 %	25 %	25 %	332661800
106	NC_015511	TGCG	2	8	49324	49331	0 %	25 %	50 %	25 %	332661800
107	NC_015511	TCAA	2	8	49588	49595	50 %	25 %	0 %	25 %	332661801
108	NC_015511	ACCC	2	8	50388	50395	25 %	0 %	0 %	75 %	332661802
109	NC_015511	ATCA	2	8	51004	51011	50 %	25 %	0 %	25 %	332661802
110	NC_015511	GCAG	2	8	52365	52372	25 %	0 %	50 %	25 %	332661803
111	NC_015511	ACCT	2	8	52797	52804	25 %	25 %	0 %	50 %	332661803
112	NC_015511	GCCA	2	8	53039	53046	25 %	0 %	25 %	50 %	332661804
113	NC_015511	GGAG	2	8	53271	53278	25 %	0 %	75 %	0 %	332661804
114	NC_015511	TTTA	2	8	53438	53445	25 %	75 %	0 %	0 %	332661804
115	NC_015511	CCTG	2	8	53844	53851	0 %	25 %	25 %	50 %	332661804
116	NC_015511	ATCA	2	8	54445	54452	50 %	25 %	0 %	25 %	332661805
117	NC_015511	CAAC	2	8	54714	54721	50 %	0 %	0 %	50 %	332661805
118	NC_015511	ACCA	2	8	55294	55301	50 %	0 %	0 %	50 %	332661805
119	NC_015511	TGGA	2	8	55812	55819	25 %	25 %	50 %	0 %	332661806
120	NC_015511	AAGC	2	8	56616	56623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015511	CAAA	2	8	56680	56687	75 %	0 %	0 %	25 %	332661808
122	NC_015511	AGGA	2	8	56764	56771	50 %	0 %	50 %	0 %	332661808
123	NC_015511	ACCA	2	8	56818	56825	50 %	0 %	0 %	50 %	332661808
124	NC_015511	AATG	2	8	56973	56980	50 %	25 %	25 %	0 %	332661808
125	NC_015511	GATT	2	8	56984	56991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015511	ACTG	2	8	57173	57180	25 %	25 %	25 %	25 %	332661809
127	NC_015511	GGCG	2	8	57897	57904	0 %	0 %	75 %	25 %	332661810
128	NC_015511	GCCA	2	8	57962	57969	25 %	0 %	25 %	50 %	332661810
129	NC_015511	TTGG	2	8	58105	58112	0 %	50 %	50 %	0 %	332661810
130	NC_015511	CATC	2	8	58191	58198	25 %	25 %	0 %	50 %	332661810
131	NC_015511	TTAA	2	8	58320	58327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015511	AAAC	2	8	58783	58790	75 %	0 %	0 %	25 %	332661811
133	NC_015511	AGCA	2	8	59862	59869	50 %	0 %	25 %	25 %	332661811
134	NC_015511	GATC	2	8	60043	60050	25 %	25 %	25 %	25 %	332661811
135	NC_015511	GAAT	2	8	60221	60228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015511	AATC	2	8	61224	61231	50 %	25 %	0 %	25 %	332661813
137	NC_015511	GCAG	2	8	62085	62092	25 %	0 %	50 %	25 %	332661814
138	NC_015511	CAGG	2	8	62318	62325	25 %	0 %	50 %	25 %	332661815
139	NC_015511	GCGG	2	8	62400	62407	0 %	0 %	75 %	25 %	332661815
140	NC_015511	TTGA	2	8	62556	62563	25 %	50 %	25 %	0 %	332661815
141	NC_015511	CGAG	2	8	63776	63783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015511	GATG	2	8	63992	63999	25 %	25 %	50 %	0 %	332661818
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.