MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 plasmid pHALHY01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015511	ACCA	2	8	417	424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015511	CAAA	2	8	561	568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015511	TTAT	2	8	1347	1354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015511	TTCA	2	8	4011	4018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015511	ACCT	2	8	8119	8126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015511	TCCA	2	8	8802	8809	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015511	TGCT	2	8	11034	11041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015511	TGCT	2	8	11089	11096	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015511	AAAT	2	8	34210	34217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015511	CCCA	2	8	35193	35200	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_015511	GAAA	2	8	47302	47309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015511	GATT	2	8	47706	47713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015511	GGTT	2	8	48068	48075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015511	CTTT	2	8	48126	48133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015511	AAGC	2	8	56616	56623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015511	GATT	2	8	56984	56991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015511	TTAA	2	8	58320	58327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015511	GAAT	2	8	60221	60228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015511	CGAG	2	8	63776	63783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015511	ATCC	2	8	68148	68155	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015511	GTAG	2	8	69779	69786	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015511	TAGG	2	8	73888	73895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015511	TTTA	2	8	74249	74256	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015511	TTAG	2	8	74310	74317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015511	GGGA	2	8	76883	76890	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015511	TAAA	2	8	88258	88265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015511	CAAT	2	8	90952	90959	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015511	TTCC	2	8	92477	92484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015511	ATTT	2	8	96805	96812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015511	TTGC	2	8	96813	96820	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015511	AATG	2	8	99076	99083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015511	AATC	2	8	99153	99160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015511	TCAA	2	8	110381	110388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015511	AGTT	2	8	117760	117767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015511	TGGT	2	8	118342	118349	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015511	AAAT	2	8	119072	119079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015511	TGTT	2	8	121122	121129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015511	ATTT	2	8	121220	121227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015511	GGAG	2	8	121469	121476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015511	TAAA	2	8	121555	121562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015511	TAAA	2	8	122068	122075	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015511	GGGT	2	8	128403	128410	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015511	GGAA	2	8	128526	128533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015511	GGGT	2	8	128634	128641	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015511	AAGG	2	8	128842	128849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015511	CAAG	2	8	132784	132791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_015511	TGAG	2	8	135142	135149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015511	ACTT	2	8	135152	135159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015511	GAGC	2	8	140833	140840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015511	CTAC	2	8	153276	153283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015511	AGGC	2	8	160315	160322	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015511	TTAG	2	8	163931	163938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.